108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_4381 on replicon NC_007901
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007901  Rfer_4381  ankyrin  100 
 
 
589 aa  1206    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32350  hypothetical protein  49.23 
 
 
210 aa  59.3  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.234736  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2741  hypothetical protein  49.23 
 
 
210 aa  58.5  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0291  ankyrin repeat-containing prophage LambdaW1  31.18 
 
 
224 aa  56.6  0.000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.461089  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0229  Ankyrin  28.89 
 
 
715 aa  56.6  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000140183  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1435  hypothetical protein  30 
 
 
1585 aa  56.6  0.000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.015567 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1284  ankyrin  29.93 
 
 
870 aa  55.8  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.226002  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0105  hypothetical protein  30.99 
 
 
637 aa  56.2  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.396317  normal  0.452557 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2345  Ankyrin  35 
 
 
233 aa  55.1  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.704803 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2634  ankyrin  29.68 
 
 
269 aa  54.7  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0366745  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1887  ankyrin  27.19 
 
 
321 aa  54.3  0.000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.959203 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0976  Ankyrin  38.61 
 
 
395 aa  54.3  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.157423  normal  0.476091 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2048  hypothetical protein  33.33 
 
 
581 aa  53.9  0.000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0824  ankyrin  37.65 
 
 
266 aa  52.8  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.132529  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0728  Ankyrin  37.23 
 
 
264 aa  52.8  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.365587  normal  0.800826 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0798  aankyrin repeat-containing protein  37.23 
 
 
264 aa  52  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.234452  normal  0.451941 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3583  ankyrin domain protein  24.46 
 
 
184 aa  51.6  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.381632  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3569  ankyrin  31.54 
 
 
227 aa  51.6  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00419939 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1283  ankyrin  31 
 
 
214 aa  51.6  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.27436  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08019  Pfs, NACHT and Ankyrin domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G01020)  30.95 
 
 
1156 aa  51.2  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.596222  hitchhiker  0.00162932 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5572  Ankyrin  32.41 
 
 
157 aa  51.2  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.43275  normal  0.999489 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08767  ankyrin repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_3G02830)  30 
 
 
855 aa  50.8  0.00006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0941887  normal  0.535904 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01130  conserved hypothetical protein  24.67 
 
 
1030 aa  51.2  0.00006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.329359  normal  0.12831 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2058  hypothetical protein  31.33 
 
 
580 aa  51.2  0.00006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2666  ankyrin  30.49 
 
 
237 aa  51.2  0.00006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.931958  hitchhiker  0.000000569803 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2346  Ankyrin  27.43 
 
 
173 aa  51.2  0.00006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.176279  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14960  Ankyrin  28.87 
 
 
483 aa  50.8  0.00007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000388228  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0781  aankyrin repeat-containing protein  37.23 
 
 
261 aa  50.8  0.00008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.150495  normal  0.0323069 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1229  hypothetical protein  27.52 
 
 
1249 aa  50.4  0.00009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0154751 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0898  ankyrin  25.81 
 
 
450 aa  50.1  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.0000205657  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0622  Ankyrin  26.15 
 
 
711 aa  50.1  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0301  Ankyrin  32.5 
 
 
369 aa  49.7  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00164342  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1144  hypothetical protein  40.28 
 
 
2122 aa  50.4  0.0001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03093  DIL and Ankyrin domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G12450)  37.5 
 
 
1395 aa  48.9  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.148614  normal  0.215247 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4314  ankyrin  27.14 
 
 
426 aa  49.3  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327235  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4090  hypothetical protein  30.95 
 
 
427 aa  49.7  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1071  ankyrin  37.1 
 
 
342 aa  49.3  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0636  hypothetical protein  26.88 
 
 
545 aa  49.3  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3354  ankyrin  24.46 
 
 
189 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0944137  normal  0.0422301 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0519  hypothetical protein  30.15 
 
 
278 aa  48.5  0.0003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.682563 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1288  hypothetical protein  34.67 
 
 
731 aa  48.5  0.0003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0920599 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2380  hypothetical protein  40.74 
 
 
305 aa  48.1  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.691759  normal  0.155983 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0911  hypothetical protein  29.37 
 
 
931 aa  48.1  0.0004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0380613 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4783  ankyrin repeat domain protein  30 
 
 
226 aa  48.1  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0385  ankyrin repeat-containing protein  25.9 
 
 
542 aa  47.8  0.0005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.317443  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2511  ankyrin  26.15 
 
 
268 aa  47.8  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  36.36 
 
 
2413 aa  47.8  0.0006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0393  hypothetical protein  34.21 
 
 
821 aa  47.8  0.0006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2051  hypothetical protein  27.55 
 
 
583 aa  47.4  0.0007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3539  hypothetical protein  25.93 
 
 
514 aa  47.4  0.0008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.294562  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03775  conserved hypothetical protein  29.63 
 
 
307 aa  46.2  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02195  conserved hypothetical protein  25.56 
 
 
1800 aa  46.6  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.222907  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2498  ankyrin  30.65 
 
 
479 aa  46.6  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0418  Ankyrin  26.53 
 
 
544 aa  47  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1096  ankyrin  35.21 
 
 
1061 aa  47  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0912242  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0849  hypothetical protein  31.78 
 
 
723 aa  46.2  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.048411 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0456  ankyrin repeat domain protein  28.89 
 
 
196 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0121916 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2693  ankyrin repeat-containing protein  32.29 
 
 
933 aa  45.8  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.82952  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0550  ankyrin repeat-containing protein  29.52 
 
 
329 aa  46.2  0.002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2061  hypothetical protein  27.55 
 
 
584 aa  45.8  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0197  ankyrin repeat-containing protein  26.67 
 
 
165 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5420  ankyrin  32.97 
 
 
274 aa  46.2  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0071  ankyrin repeat-containing protein  30 
 
 
224 aa  46.2  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4250  ankyrin  38.03 
 
 
237 aa  45.8  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.379983 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0493  ankyrin  32.58 
 
 
254 aa  46.2  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4177  ankyrin  29.93 
 
 
175 aa  46.2  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  27.84 
 
 
1402 aa  45.8  0.002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2151  Ankyrin  28.97 
 
 
490 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.712677 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4264  Ankyrin  26.83 
 
 
255 aa  45.8  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1958  Ankyrin  29.59 
 
 
234 aa  45.8  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0766  ankyrin repeat-containing protein  27.27 
 
 
474 aa  45.4  0.003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.705844  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2661  ankyrin  34.85 
 
 
287 aa  45.4  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0806598 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1484  hypothetical protein  31.76 
 
 
790 aa  45.4  0.003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3236  Ankyrin  24.41 
 
 
259 aa  45.4  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0921  ankyrin repeat-containing protein  30.61 
 
 
412 aa  45.1  0.004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.122961  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0897  ankyrin  27.59 
 
 
393 aa  44.7  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0130242  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1180  ankyrin repeat-containing protein  30.61 
 
 
398 aa  45.1  0.004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1926  Ankyrin  27.74 
 
 
750 aa  44.7  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5090  Ankyrin  34.25 
 
 
135 aa  45.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.325044  normal  0.0672645 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5600  hypothetical protein  33.33 
 
 
170 aa  44.7  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0488  ankyrin  31.36 
 
 
176 aa  44.7  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.826028  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0104  ankyrin  31.58 
 
 
151 aa  44.7  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5252  hypothetical protein  24.81 
 
 
185 aa  44.7  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.626004  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0219  Ankyrin  35.62 
 
 
382 aa  44.7  0.005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.41533e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3561  Ankyrin  37.84 
 
 
331 aa  44.7  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.466152  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2822  Ankyrin  26.02 
 
 
255 aa  44.7  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07155  conserved hypothetical protein  26.15 
 
 
180 aa  44.3  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.644558  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4419  ankyrin repeat-containing protein  29.41 
 
 
196 aa  44.3  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4922  ankyrin repeat-containing protein  29.41 
 
 
196 aa  44.3  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.573974  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2266  hypothetical protein  29.07 
 
 
445 aa  44.3  0.006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4788  ankyrin repeat domain protein  29.41 
 
 
196 aa  44.3  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0600  ankyrin repeat domain protein  33.33 
 
 
277 aa  44.3  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2823  Ankyrin  27.83 
 
 
259 aa  44.3  0.007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0294  ankyrin repeat-containing protein  28.69 
 
 
541 aa  43.9  0.008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.365976  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1221  hypothetical protein  31.46 
 
 
472 aa  43.9  0.008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000594421 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4739  ankyrin repeat domain protein  33.33 
 
 
289 aa  43.9  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4567  ankyrin repeat-containing protein  29.41 
 
 
226 aa  43.9  0.009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.928226  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1438  ankyrin  37.93 
 
 
248 aa  43.9  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0851  ankyrin repeat-containing protein  27.34 
 
 
408 aa  43.9  0.009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46192  predicted protein  30 
 
 
1171 aa  43.5  0.009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.320112  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>