23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_0353 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0353  TPR domain-containing protein  100 
 
 		 232 aa  464  9.999999999999999e-131  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0324  TPR repeat-containing protein  79.49 
 
 		 234 aa  371  1e-102  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0357  TPR domain-containing protein  78.54 
 
 		 234 aa  367  1e-101  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000167049  decreased coverage  0.00000000909482 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0349  TPR repeat-containing protein  78.54 
 
 		 234 aa  367  1e-101  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0347  TPR repeat-containing protein  78.54 
 
 		 234 aa  369  1e-101  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0393217  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0354  TPR repeat-containing protein  78.97 
 
 		 234 aa  369  1e-101  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0784365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3619  TPR repeat-containing protein  79.91 
 
 		 234 aa  352  2e-96  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3816  TPR repeat-containing protein  78.21 
 
 		 234 aa  347  1e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4589  TPR repeat-containing protein  57.27 
 
 		 226 aa  252  4.0000000000000004e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000195953 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0359  TPR repeat-containing protein  53.59 
 
 		 230 aa  243  9.999999999999999e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3473  TPR repeat-containing protein  54.11 
 
 		 269 aa  238  5e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3504  TPR repeat-containing protein  52.42 
 
 		 221 aa  226  3e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3823  hypothetical protein  35.56 
 
 		 228 aa  85.9  5e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6282  hypothetical protein  39 
 
 		 217 aa  60.5  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0309056  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0213  hypothetical protein  28.73 
 
 		 206 aa  54.3  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1235  hypothetical protein  33.33 
 
 		 215 aa  51.6  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5131  TPR repeat-containing protein  46.94 
 
 		 361 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131061 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2322  TPR repeat-containing protein  33.67 
 
 		 352 aa  45.1  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1088  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  48.65 
 
 		 308 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.446207 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3643  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  41.33 
 
 		 406 aa  43.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2471  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  41.33 
 
 		 406 aa  43.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal  0.45906 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  27.6 
 
 		 706 aa  42.7  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13031  TPR repeat-containing protein  29.23 
 
 		 306 aa  41.6  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0823406 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>