18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1235 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1235  hypothetical protein  100 
 
 		 215 aa  448  1e-125  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3592  hypothetical protein  43.06 
 
 		 216 aa  174  9.999999999999999e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0589405 
 
 
-
 
NC_002950  PG2227  hypothetical protein  36.11 
 
 		 218 aa  135  7.000000000000001e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000379414 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0213  hypothetical protein  31.19 
 
 		 206 aa  102  5e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4914  hypothetical protein  30.62 
 
 		 206 aa  92.8  4e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.558151  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6282  hypothetical protein  28.65 
 
 		 217 aa  91.7  7e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0309056  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0357  TPR domain-containing protein  37.93 
 
 		 234 aa  55.5  0.0000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000167049  decreased coverage  0.00000000909482 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3619  TPR repeat-containing protein  39.08 
 
 		 234 aa  53.5  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0349  TPR repeat-containing protein  36.78 
 
 		 234 aa  52.8  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0354  TPR repeat-containing protein  36.78 
 
 		 234 aa  52.8  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0784365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0359  TPR repeat-containing protein  36.47 
 
 		 230 aa  52.4  0.000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0347  TPR repeat-containing protein  36.78 
 
 		 234 aa  52.4  0.000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0393217  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0324  TPR repeat-containing protein  37.93 
 
 		 234 aa  52  0.000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0353  TPR domain-containing protein  33.33 
 
 		 232 aa  51.2  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3816  TPR repeat-containing protein  36.78 
 
 		 234 aa  47  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3823  hypothetical protein  26.61 
 
 		 228 aa  47.4  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3473  TPR repeat-containing protein  26.9 
 
 		 269 aa  42.4  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4589  TPR repeat-containing protein  37.84 
 
 		 226 aa  41.6  0.009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000195953 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>