39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_0359 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_0359  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 230 aa  472  1e-132  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0347  TPR repeat-containing protein  56.39 
 
 		 234 aa  272  3e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0393217  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0354  TPR repeat-containing protein  56.83 
 
 		 234 aa  272  4.0000000000000004e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0784365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0349  TPR repeat-containing protein  56.83 
 
 		 234 aa  271  5.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0357  TPR domain-containing protein  56.39 
 
 		 234 aa  269  2e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000167049  decreased coverage  0.00000000909482 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0324  TPR repeat-containing protein  53.74 
 
 		 234 aa  255  5e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4589  TPR repeat-containing protein  55.11 
 
 		 226 aa  246  3e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000195953 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0353  TPR domain-containing protein  53.55 
 
 		 232 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3619  TPR repeat-containing protein  54.29 
 
 		 234 aa  241  7e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3473  TPR repeat-containing protein  53.78 
 
 		 269 aa  237  1e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3816  TPR repeat-containing protein  52.61 
 
 		 234 aa  235  3e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3504  TPR repeat-containing protein  47.75 
 
 		 221 aa  204  9e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3823  hypothetical protein  32.61 
 
 		 228 aa  81.3  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0213  hypothetical protein  27.27 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1235  hypothetical protein  36.47 
 
 		 215 aa  52.8  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6282  hypothetical protein  29.41 
 
 		 217 aa  50.8  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0309056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28711  hypothetical protein  53.33 
 
 		 334 aa  49.7  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0369  TPR repeat-containing protein  35 
 
 		 446 aa  47.4  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28501  hypothetical protein  36.36 
 
 		 706 aa  47.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  29.07 
 
 		 706 aa  47.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  37.97 
 
 		 462 aa  46.6  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13031  TPR repeat-containing protein  40.79 
 
 		 306 aa  45.8  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0823406 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19680  hypothetical protein  24.87 
 
 		 270 aa  45.4  0.0006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3793  TPR repeat-containing protein  34.67 
 
 		 428 aa  45.4  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.085128 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12541  Tfp pilus assembly protein PilF  38.98 
 
 		 442 aa  45.4  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.34619  hitchhiker  0.00140851 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0478  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.81 
 
 		 343 aa  45.4  0.0008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28691  hypothetical protein  48 
 
 		 306 aa  44.3  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3161  TPR repeat-containing protein  65.38 
 
 		 297 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2957  TPR repeat-containing protein  65.38 
 
 		 297 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.338311  normal  0.060469 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20371  hypothetical protein  47.5 
 
 		 233 aa  44.3  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0775177 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6629  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  44.74 
 
 		 458 aa  43.9  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0935269 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1342  TPR repeat-containing protein  34.33 
 
 		 391 aa  43.1  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3643  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  42.65 
 
 		 406 aa  42.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1228  TPR repeat-containing protein  55.88 
 
 		 297 aa  43.1  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2471  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  42.65 
 
 		 406 aa  42.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal  0.45906 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2203  TPR repeat-containing protein  48.72 
 
 		 331 aa  43.1  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1991  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  48.72 
 
 		 367 aa  42.7  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.310287  normal  0.0147414 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0828  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  48.57 
 
 		 335 aa  42.7  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.375671  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2227  hypothetical protein  30.49 
 
 		 218 aa  42.4  0.006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000379414 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>