18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0213 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0213  hypothetical protein  100 
 
 		 206 aa  429  1e-119  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6282  hypothetical protein  33.51 
 
 		 217 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0309056  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1235  hypothetical protein  31.19 
 
 		 215 aa  102  5e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3592  hypothetical protein  34.97 
 
 		 216 aa  99  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0589405 
 
 
-
 
NC_002950  PG2227  hypothetical protein  32.11 
 
 		 218 aa  92  5e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000379414 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0359  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 		 230 aa  57  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4914  hypothetical protein  28.57 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.558151  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3619  TPR repeat-containing protein  28.92 
 
 		 234 aa  55.1  0.0000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0354  TPR repeat-containing protein  26.49 
 
 		 234 aa  51.6  0.000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0784365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0349  TPR repeat-containing protein  27.03 
 
 		 234 aa  51.2  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0347  TPR repeat-containing protein  26.49 
 
 		 234 aa  51.2  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0393217  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0357  TPR domain-containing protein  27.03 
 
 		 234 aa  51.2  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000167049  decreased coverage  0.00000000909482 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0324  TPR repeat-containing protein  25.62 
 
 		 234 aa  50.1  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0353  TPR domain-containing protein  27.22 
 
 		 232 aa  50.1  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3816  TPR repeat-containing protein  26.97 
 
 		 234 aa  47.8  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3473  TPR repeat-containing protein  30.71 
 
 		 269 aa  47  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4589  TPR repeat-containing protein  24.86 
 
 		 226 aa  44.7  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000195953 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3504  TPR repeat-containing protein  25.64 
 
 		 221 aa  43.1  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>