19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_3473 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_3473  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 269 aa  542  1e-153  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0347  TPR repeat-containing protein  58.8 
 
 		 234 aa  261  8.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0393217  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0354  TPR repeat-containing protein  58.37 
 
 		 234 aa  258  6e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0784365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0349  TPR repeat-containing protein  58.37 
 
 		 234 aa  258  7e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3619  TPR repeat-containing protein  61.32 
 
 		 234 aa  256  4e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0357  TPR domain-containing protein  57.51 
 
 		 234 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000167049  decreased coverage  0.00000000909482 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4589  TPR repeat-containing protein  60.61 
 
 		 226 aa  252  5.000000000000001e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000195953 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0324  TPR repeat-containing protein  56.22 
 
 		 234 aa  251  9.000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3816  TPR repeat-containing protein  60.38 
 
 		 234 aa  249  3e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0353  TPR domain-containing protein  58.14 
 
 		 232 aa  248  1e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0359  TPR repeat-containing protein  56.52 
 
 		 230 aa  245  6.999999999999999e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3504  TPR repeat-containing protein  53.3 
 
 		 221 aa  208  6e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3823  hypothetical protein  32.54 
 
 		 228 aa  74.7  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6282  hypothetical protein  34.78 
 
 		 217 aa  52  0.000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0309056  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0213  hypothetical protein  28.31 
 
 		 206 aa  48.1  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1000  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.78 
 
 		 219 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.810235  normal  0.0608831 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1235  hypothetical protein  26.9 
 
 		 215 aa  42.7  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0478  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  58.06 
 
 		 343 aa  42.4  0.009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  26.67 
 
 		 462 aa  42.4  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>