26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3572 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3572  hypothetical protein  100 
 
 		 163 aa  322  2e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.163728 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0785  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  29.84 
 
 		 185 aa  58.2  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1539  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  31.72 
 
 		 186 aa  55.5  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.51669  normal  0.0662213 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0122  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  41.43 
 
 		 623 aa  53.1  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3965  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  30.77 
 
 		 191 aa  50.8  0.000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.123911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1732  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  31.86 
 
 		 155 aa  50.1  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00171017  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4816  TRAP C4-dicarboxylate transport system permease DctM subunit  37.88 
 
 		 625 aa  48.1  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.290966  normal  0.395519 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4576  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  29.85 
 
 		 240 aa  48.1  0.00006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.323841 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0554  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  30.77 
 
 		 176 aa  46.2  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.29193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3543  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  47.06 
 
 		 165 aa  45.4  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.186116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1267  aspartate kinase, monofunctional class  32.29 
 
 		 172 aa  43.5  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.457772  normal  0.0118778 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0023  permease (transport protein)  28.89 
 
 		 159 aa  43.5  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.352968  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0089  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  36.11 
 
 		 188 aa  43.9  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0702  TRAP dicarboxylate transporter, permease component  31.25 
 
 		 621 aa  42.7  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000972925  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1073  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  29.52 
 
 		 172 aa  43.1  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2754  tripartite ATP-independent periplasmic transporter  38.6 
 
 		 196 aa  43.1  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.03848 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1310  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  29.03 
 
 		 628 aa  43.1  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.968355 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0647  tripartite ATP-independent periplasmic (TRAP) C4-dicarboxylate transporter subunit DctQ  34.78 
 
 		 173 aa  42.4  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.784671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3117  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  29.11 
 
 		 184 aa  42  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.573948  hitchhiker  0.000638451 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3833  TRAP dicarboxylate transporter- DctM subunit  28.23 
 
 		 628 aa  42  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.187747  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6993  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  30.69 
 
 		 631 aa  41.6  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.800495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4881  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  31.33 
 
 		 170 aa  41.2  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5769  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  28.23 
 
 		 628 aa  41.2  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4535  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  28.23 
 
 		 628 aa  41.2  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.303303 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4704  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  36.21 
 
 		 156 aa  40.8  0.009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4769  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  26.27 
 
 		 190 aa  40.4  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.107599 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>