80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_3381 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_3034  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
231 aa  474  1e-133  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3381  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
231 aa  474  1e-133  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3098  hypothetical protein  93.07 
 
 
231 aa  442  1e-123  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3215  GCN5-related N-acetyltransferase  81.74 
 
 
232 aa  385  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3378  GCN5-related N-acetyltransferase  81.03 
 
 
245 aa  380  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0288  GCN5-related N-acetyltransferase  57.83 
 
 
224 aa  257  1e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.603484 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3669  GCN5-related N-acetyltransferase  61.69 
 
 
222 aa  253  3e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00406711  hitchhiker  0.0000000686712 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2580  acetyltransferase  60 
 
 
255 aa  248  6e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3782  acetyltransferase  58.88 
 
 
215 aa  246  1e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0251  GCN5-related N-acetyltransferase  60.87 
 
 
211 aa  247  1e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00144253 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3530  acetyltransferase  58.88 
 
 
215 aa  246  1e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3843  acetyltransferase  58.88 
 
 
215 aa  246  1e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1977  acetyltransferase  58.88 
 
 
215 aa  246  1e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3118  acetyltransferase  58.88 
 
 
215 aa  246  1e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.515092  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0005  acetyltransferase  58.88 
 
 
215 aa  246  1e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0625007  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0014  acetyltransferase  58.6 
 
 
255 aa  247  1e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0242  GCN5-related N-acetyltransferase  60.39 
 
 
215 aa  246  2e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3104  acetyltransferase  58.88 
 
 
215 aa  245  4.9999999999999997e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0303  GCN5-related N-acetyltransferase  61.93 
 
 
215 aa  244  6.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.518598  hitchhiker  0.000134337 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3422  GCN5-related N-acetyltransferase  61.5 
 
 
215 aa  244  9e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2783  GCN5-related N-acetyltransferase  61.93 
 
 
215 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0323  GCN5-related N-acetyltransferase  61.93 
 
 
215 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2864  GCN5-related N-acetyltransferase  58.79 
 
 
221 aa  242  3e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000583305 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0225  GCN5-related N-acetyltransferase  59.13 
 
 
215 aa  239  2e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.233449  hitchhiker  0.0000188583 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0038  GCN5-related N-acetyltransferase  52.79 
 
 
218 aa  213  2.9999999999999995e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000011752  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0034  GCN5-related N-acetyltransferase  53.8 
 
 
195 aa  187  2e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000614115  hitchhiker  0.0000000330992 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0438  GCN5-related N-acetyltransferase  46.6 
 
 
275 aa  177  2e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.576633  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4211  GCN5-related N-acetyltransferase  44.21 
 
 
245 aa  170  2e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.494469  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3699  GCN5-related N-acetyltransferase  43.26 
 
 
246 aa  167  9e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4187  GCN5-related N-acetyltransferase  45.1 
 
 
222 aa  164  8e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3158  hypothetical protein  45.6 
 
 
242 aa  157  2e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0104373 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0522  GCN5-related N-acetyltransferase  41.09 
 
 
225 aa  156  3e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0134212 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1270  GCN5-related N-acetyltransferase  40.1 
 
 
223 aa  156  3e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.748246  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0538  GCN5-related N-acetyltransferase  41.45 
 
 
210 aa  156  3e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2138  GCN5-related N-acetyltransferase  42.08 
 
 
205 aa  155  4e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.310704  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4764  GCN5-related N-acetyltransferase  40.98 
 
 
242 aa  154  9e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0977317  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0554  GCN5-related N-acetyltransferase  40.91 
 
 
233 aa  152  5.9999999999999996e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0368  GCN5-related N-acetyltransferase  31.43 
 
 
242 aa  79  0.00000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3103  GCN5-related N-acetyltransferase  30.15 
 
 
208 aa  67.8  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2843  GCN5-related N-acetyltransferase  33.57 
 
 
171 aa  65.1  0.0000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.038853  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2674  GCN5-related N-acetyltransferase  27.87 
 
 
197 aa  59.3  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0897177  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1477  GCN5-related N-acetyltransferase  27.74 
 
 
896 aa  58.9  0.00000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.630899  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2158  GCN5-related N-acetyltransferase  25.99 
 
 
191 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.447718 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1446  GCN5-related N-acetyltransferase  30.5 
 
 
186 aa  53.5  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1742  GCN5-related N-acetyltransferase  26.5 
 
 
903 aa  52.8  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6906  GCN5-related N-acetyltransferase  28.47 
 
 
175 aa  52  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0866  GCN5-related N-acetyltransferase  28.19 
 
 
218 aa  52  0.000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3280  GCN5-related N-acetyltransferase  30.14 
 
 
846 aa  51.2  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0316376 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5336  GCN5-related N-acetyltransferase  28.97 
 
 
785 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4747  GCN5-related N-acetyltransferase  28.97 
 
 
785 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5525  GCN5-related N-acetyltransferase  28.97 
 
 
806 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1092  GCN5-related N-acetyltransferase  27.78 
 
 
893 aa  49.3  0.00005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.20314  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1037  GCN5-related N-acetyltransferase  25.69 
 
 
887 aa  49.3  0.00005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.737751  normal  0.467815 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2486  GCN5-related N-acetyltransferase  25.68 
 
 
771 aa  48.9  0.00007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0134  GCN5-related N-acetyltransferase  28.28 
 
 
785 aa  48.5  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1862  CoA-binding domain protein  30.53 
 
 
900 aa  48.5  0.00009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.167225  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5396  GCN5-related N-acetyltransferase  28.28 
 
 
785 aa  48.1  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.916817  normal  0.647823 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2354  GCN5-related N-acetyltransferase  26.54 
 
 
214 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.551599 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05787  hypothetical protein  23.87 
 
 
877 aa  46.6  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3962  GCN5-related N-acetyltransferase  29.66 
 
 
192 aa  47  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00434349  normal  0.0285152 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3848  GCN5-related N-acetyltransferase  29.66 
 
 
192 aa  47  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000121275  normal  0.760581 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2131  CoA-binding domain protein  28.28 
 
 
904 aa  46.2  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.131154  normal  0.594511 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4849  GCN5-related N-acetyltransferase  27.59 
 
 
813 aa  45.8  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3891  GNAT family acetyltransferase  29.5 
 
 
207 aa  45.4  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.867552 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000156  protein acetyltransferase  23.87 
 
 
877 aa  44.7  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.775567  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0400  GCN5-related N-acetyltransferase  26.95 
 
 
898 aa  43.5  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.249053  normal  0.200769 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1784  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  23.46 
 
 
929 aa  43.5  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2420  acetyltransferase  23.57 
 
 
892 aa  43.5  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.773408  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3787  GCN5-related N-acetyltransferase  29.57 
 
 
893 aa  42.7  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.152255  normal  0.584702 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0615  GCN5-related N-acetyltransferase  22.84 
 
 
775 aa  43.1  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.47112  normal  0.466486 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2035  hypothetical protein  28.81 
 
 
215 aa  43.1  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.128169 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2206  acetyltransferase  28.35 
 
 
836 aa  43.1  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0254612  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1205  CoA-binding  24.66 
 
 
903 aa  42.7  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.370285  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27480  acyl-CoA synthetase (NDP forming)  32.39 
 
 
926 aa  42.4  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0144  GCN5-related N-acetyltransferase  28.97 
 
 
852 aa  42.4  0.006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1311  hypothetical protein  25.61 
 
 
886 aa  42.4  0.006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3063  acetyltransferase  26.36 
 
 
897 aa  42  0.008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0252  GCN5-related N-acetyltransferase  23.73 
 
 
882 aa  42  0.008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0975681  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1423  CoA-binding domain-containing protein  27.78 
 
 
909 aa  41.6  0.009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.382585  hitchhiker  0.0000471677 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5003  CoA-binding domain protein  27.5 
 
 
920 aa  41.6  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>