121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0554 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0554  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 		 233 aa  466  9.999999999999999e-131  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3158  hypothetical protein  52.48 
 
 		 242 aa  243  9.999999999999999e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0104373 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1270  GCN5-related N-acetyltransferase  50.22 
 
 		 223 aa  216  2e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.748246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4211  GCN5-related N-acetyltransferase  51.26 
 
 		 245 aa  212  3.9999999999999995e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.494469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0538  GCN5-related N-acetyltransferase  51.92 
 
 		 210 aa  211  5.999999999999999e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0522  GCN5-related N-acetyltransferase  51.92 
 
 		 225 aa  211  7e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0134212 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0438  GCN5-related N-acetyltransferase  51.26 
 
 		 275 aa  207  1e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.576633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4187  GCN5-related N-acetyltransferase  51.63 
 
 		 222 aa  201  7e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4764  GCN5-related N-acetyltransferase  51.02 
 
 		 242 aa  199  3e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0977317  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3699  GCN5-related N-acetyltransferase  52.17 
 
 		 246 aa  195  4.0000000000000005e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2138  GCN5-related N-acetyltransferase  50.77 
 
 		 205 aa  194  9e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.310704  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3034  GCN5-related N-acetyltransferase  40.91 
 
 		 231 aa  152  5.9999999999999996e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3381  GCN5-related N-acetyltransferase  40.91 
 
 		 231 aa  152  5.9999999999999996e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3098  hypothetical protein  39.42 
 
 		 231 aa  150  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3215  GCN5-related N-acetyltransferase  42.37 
 
 		 232 aa  149  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2864  GCN5-related N-acetyltransferase  43.65 
 
 		 221 aa  149  4e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000583305 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0242  GCN5-related N-acetyltransferase  43.5 
 
 		 215 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0303  GCN5-related N-acetyltransferase  41.99 
 
 		 215 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.518598  hitchhiker  0.000134337 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0251  GCN5-related N-acetyltransferase  42.94 
 
 		 211 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144253 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3422  GCN5-related N-acetyltransferase  41.99 
 
 		 215 aa  146  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3669  GCN5-related N-acetyltransferase  40.66 
 
 		 222 aa  145  5e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00406711  hitchhiker  0.0000000686712 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3378  GCN5-related N-acetyltransferase  40.68 
 
 		 245 aa  145  6e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2783  GCN5-related N-acetyltransferase  41.44 
 
 		 215 aa  144  9e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0323  GCN5-related N-acetyltransferase  41.44 
 
 		 215 aa  144  9e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2580  acetyltransferase  39.57 
 
 		 255 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0014  acetyltransferase  39.57 
 
 		 255 aa  144  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0005  acetyltransferase  39.57 
 
 		 215 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0625007  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3118  acetyltransferase  39.57 
 
 		 215 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.515092  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1977  acetyltransferase  39.57 
 
 		 215 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3782  acetyltransferase  39.57 
 
 		 215 aa  144  1e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3843  acetyltransferase  39.57 
 
 		 215 aa  144  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3530  acetyltransferase  39.57 
 
 		 215 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0288  GCN5-related N-acetyltransferase  40.66 
 
 		 224 aa  143  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.603484 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3104  acetyltransferase  39.57 
 
 		 215 aa  142  4e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0225  GCN5-related N-acetyltransferase  40.68 
 
 		 215 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.233449  hitchhiker  0.0000188583 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0034  GCN5-related N-acetyltransferase  38.89 
 
 		 195 aa  138  6e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000614115  hitchhiker  0.0000000330992 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0038  GCN5-related N-acetyltransferase  37.89 
 
 		 218 aa  136  3.0000000000000003e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000011752  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2843  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 		 171 aa  74.7  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.038853  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3103  GCN5-related N-acetyltransferase  33.99 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0368  GCN5-related N-acetyltransferase  26.15 
 
 		 242 aa  56.2  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2674  GCN5-related N-acetyltransferase  32.03 
 
 		 197 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0897177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1919  GCN5-related N-acetyltransferase  26.52 
 
 		 897 aa  53.5  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3493  GCN5-related N-acetyltransferase  29.52 
 
 		 882 aa  52.8  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4719  GCN5-related N-acetyltransferase  27.85 
 
 		 907 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.345229  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1742  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 		 903 aa  51.2  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3337  GCN5-related N-acetyltransferase  29.52 
 
 		 882 aa  51.2  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2863  CoA binding domain/acetyltransferase domain protein  27.15 
 
 		 886 aa  50.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2867  CoA binding domain/acetyltransferase domain-containing protein  27.15 
 
 		 886 aa  50.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2845  CoA binding domain/acetyltransferase domain protein  27.15 
 
 		 886 aa  50.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2761  CoA binding domain/acetyltransferase domain protein  27.15 
 
 		 886 aa  50.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.282153  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2979  CoA-binding domain/acetyltransferase domain-containing protein  27.15 
 
 		 886 aa  50.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1570  GCN5-related N-acetyltransferase  32.32 
 
 		 177 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.763005 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2967  GNAT family acetyltransferase  35.79 
 
 		 809 aa  49.3  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6923  GCN5-related N-acetyltransferase  34.74 
 
 		 834 aa  49.3  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.297711 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02478  fused predicted acyl-CoA synthetase: NAD(P)-binding subunit/ATP-binding subunit  27.27 
 
 		 886 aa  48.9  0.00006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02442  hypothetical protein  27.27 
 
 		 886 aa  48.9  0.00006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3821  acetyltransferase, GNAT family protein  31.58 
 
 		 886 aa  48.9  0.00006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.126569  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1084  GCN5-related N-acetyltransferase  31.58 
 
 		 886 aa  48.9  0.00007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2741  CoA-binding domain/acetyltransferase domain-containing protein  31.58 
 
 		 886 aa  48.9  0.00007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.225885  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2871  CoA-binding domain/acetyltransferase domain-containing protein  31.58 
 
 		 886 aa  48.9  0.00007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.288181  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1093  GCN5-related N-acetyltransferase  31.58 
 
 		 886 aa  48.9  0.00007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.312736  normal  0.038329 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2737  CoA-binding domain/acetyltransferase domain-containing protein  31.58 
 
 		 886 aa  48.9  0.00007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.028573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2952  acetyltransferase, GNAT family protein  31.58 
 
 		 886 aa  48.9  0.00007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.487518  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4849  GCN5-related N-acetyltransferase  35.94 
 
 		 813 aa  47.8  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0400  GCN5-related N-acetyltransferase  28.36 
 
 		 898 aa  48.1  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.249053  normal  0.200769 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3787  GCN5-related N-acetyltransferase  31.5 
 
 		 893 aa  48.1  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.152255  normal  0.584702 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1446  GCN5-related N-acetyltransferase  26.34 
 
 		 207 aa  47.8  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.239362  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27480  acyl-CoA synthetase (NDP forming)  32.12 
 
 		 926 aa  48.1  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0367  acetyltransferase  35.94 
 
 		 787 aa  47.4  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00347204  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1237  acetyltransferase  35.94 
 
 		 1024 aa  47.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000574609  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2206  acetyltransferase  36.07 
 
 		 836 aa  47.4  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0254612  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1554  acetyltransferase  35.94 
 
 		 803 aa  47.4  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00991343  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1742  acetyltransferase  35.94 
 
 		 803 aa  47.4  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00130768  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2999  acetyltransferase  35.94 
 
 		 803 aa  47.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000057298  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2882  acetyltransferase  35.94 
 
 		 803 aa  47.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0404  acetyltransferase  35.94 
 
 		 787 aa  47.4  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.121441  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3206  putative acyl-CoA synthetase  28.18 
 
 		 880 aa  47  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3280  GCN5-related N-acetyltransferase  31.18 
 
 		 846 aa  47.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0316376 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3465  putative acyl-CoA synthetase  28.18 
 
 		 880 aa  47  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.063853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3343  GCN5-related N-acetyltransferase  28.18 
 
 		 880 aa  47  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0598594  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1776  GCN5-related N-acetyltransferase  33.77 
 
 		 898 aa  47.4  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.634734 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1205  CoA-binding  25.13 
 
 		 903 aa  47  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.370285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6906  GCN5-related N-acetyltransferase  28.39 
 
 		 175 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1462  GCN5-related N-acetyltransferase  29.93 
 
 		 868 aa  47  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.277001  normal  0.28701 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5753  hypothetical protein  27.56 
 
 		 897 aa  47  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1469  CoA-binding domain protein  29.68 
 
 		 902 aa  46.6  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5396  GCN5-related N-acetyltransferase  34.38 
 
 		 785 aa  47  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.916817  normal  0.647823 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4638  CoA-binding domain protein  29.41 
 
 		 907 aa  46.2  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.349562  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2354  GCN5-related N-acetyltransferase  26.44 
 
 		 214 aa  46.6  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.551599 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0852  GCN5-related N-acetyltransferase  27.36 
 
 		 888 aa  45.8  0.0005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.121285  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1833  CoA-binding domain protein  33.86 
 
 		 903 aa  45.8  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.415665  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0885  GCN5-related N-acetyltransferase  26.92 
 
 		 887 aa  45.8  0.0006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0517  hypothetical protein  21.84 
 
 		 893 aa  45.8  0.0006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1411  GCN5-related N-acetyltransferase  24.84 
 
 		 147 aa  45.4  0.0008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000201819  hitchhiker  0.000645315 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1548  CoA-binding domain protein  30.77 
 
 		 899 aa  45.4  0.0008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.25767  normal  0.134976 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0134  GCN5-related N-acetyltransferase  32.81 
 
 		 785 aa  45.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5336  GCN5-related N-acetyltransferase  32.81 
 
 		 785 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5525  GCN5-related N-acetyltransferase  32.81 
 
 		 806 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3164  GCN5-related N-acetyltransferase  34.95 
 
 		 812 aa  44.7  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1423  CoA-binding domain-containing protein  29.5 
 
 		 909 aa  44.7  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.382585  hitchhiker  0.0000471677 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>