75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc3098 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc3098  hypothetical protein  100 
 
 		 231 aa  471  1e-132  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3381  GCN5-related N-acetyltransferase  93.07 
 
 		 231 aa  442  1e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3034  GCN5-related N-acetyltransferase  93.07 
 
 		 231 aa  442  1e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3215  GCN5-related N-acetyltransferase  80.95 
 
 		 232 aa  382  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3378  GCN5-related N-acetyltransferase  78.45 
 
 		 245 aa  371  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0288  GCN5-related N-acetyltransferase  56.58 
 
 		 224 aa  251  7e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.603484 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2580  acetyltransferase  59.53 
 
 		 255 aa  246  2e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0014  acetyltransferase  58.14 
 
 		 255 aa  245  4e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0005  acetyltransferase  58.41 
 
 		 215 aa  245  4.9999999999999997e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0625007  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3530  acetyltransferase  58.41 
 
 		 215 aa  245  4.9999999999999997e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3843  acetyltransferase  58.41 
 
 		 215 aa  245  4.9999999999999997e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3782  acetyltransferase  58.41 
 
 		 215 aa  245  4.9999999999999997e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1977  acetyltransferase  58.41 
 
 		 215 aa  245  4.9999999999999997e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3118  acetyltransferase  58.41 
 
 		 215 aa  245  4.9999999999999997e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.515092  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0251  GCN5-related N-acetyltransferase  63.08 
 
 		 211 aa  244  6e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144253 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3669  GCN5-related N-acetyltransferase  60.41 
 
 		 222 aa  244  6.999999999999999e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00406711  hitchhiker  0.0000000686712 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0242  GCN5-related N-acetyltransferase  62.56 
 
 		 215 aa  244  9e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0303  GCN5-related N-acetyltransferase  61.31 
 
 		 215 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.518598  hitchhiker  0.000134337 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3422  GCN5-related N-acetyltransferase  62.05 
 
 		 215 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3104  acetyltransferase  58.41 
 
 		 215 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2783  GCN5-related N-acetyltransferase  61.31 
 
 		 215 aa  243  3e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0323  GCN5-related N-acetyltransferase  61.31 
 
 		 215 aa  243  3e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0225  GCN5-related N-acetyltransferase  60.51 
 
 		 215 aa  238  8e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.233449  hitchhiker  0.0000188583 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2864  GCN5-related N-acetyltransferase  59.9 
 
 		 221 aa  235  3e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000583305 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0038  GCN5-related N-acetyltransferase  55.33 
 
 		 218 aa  220  9.999999999999999e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000011752  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0034  GCN5-related N-acetyltransferase  54.97 
 
 		 195 aa  191  8e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000614115  hitchhiker  0.0000000330992 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0438  GCN5-related N-acetyltransferase  45.03 
 
 		 275 aa  173  1.9999999999999998e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.576633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4211  GCN5-related N-acetyltransferase  43.01 
 
 		 245 aa  167  9e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.494469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3699  GCN5-related N-acetyltransferase  43.26 
 
 		 246 aa  166  2e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4187  GCN5-related N-acetyltransferase  44.12 
 
 		 222 aa  162  3e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2138  GCN5-related N-acetyltransferase  42.62 
 
 		 205 aa  158  6e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.310704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3158  hypothetical protein  45.6 
 
 		 242 aa  157  2e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0104373 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4764  GCN5-related N-acetyltransferase  40.19 
 
 		 242 aa  153  2.9999999999999998e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0977317  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1270  GCN5-related N-acetyltransferase  37.76 
 
 		 223 aa  150  1e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.748246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0554  GCN5-related N-acetyltransferase  39.42 
 
 		 233 aa  150  2e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0538  GCN5-related N-acetyltransferase  39.09 
 
 		 210 aa  149  5e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0522  GCN5-related N-acetyltransferase  39.09 
 
 		 225 aa  148  6e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0134212 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0368  GCN5-related N-acetyltransferase  31.55 
 
 		 242 aa  74.3  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3103  GCN5-related N-acetyltransferase  30.46 
 
 		 208 aa  67.4  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2843  GCN5-related N-acetyltransferase  35 
 
 		 171 aa  65.9  0.0000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.038853  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1477  GCN5-related N-acetyltransferase  28.03 
 
 		 896 aa  57.4  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.630899  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2674  GCN5-related N-acetyltransferase  29.52 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0897177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2158  GCN5-related N-acetyltransferase  27.22 
 
 		 191 aa  57  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.447718 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0866  GCN5-related N-acetyltransferase  27.91 
 
 		 218 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000156  protein acetyltransferase  26.58 
 
 		 877 aa  51.6  0.000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.775567  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1446  GCN5-related N-acetyltransferase  29.79 
 
 		 186 aa  52  0.000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05787  hypothetical protein  25.95 
 
 		 877 aa  50.4  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1742  GCN5-related N-acetyltransferase  26.47 
 
 		 903 aa  50.1  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1311  hypothetical protein  28.05 
 
 		 886 aa  48.5  0.00009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1092  GCN5-related N-acetyltransferase  25.3 
 
 		 893 aa  48.1  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.20314  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3280  GCN5-related N-acetyltransferase  27.27 
 
 		 846 aa  47.4  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0316376 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1862  CoA-binding domain protein  29.32 
 
 		 900 aa  47.4  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.167225  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1037  GCN5-related N-acetyltransferase  24.82 
 
 		 887 aa  47  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.737751  normal  0.467815 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2486  GCN5-related N-acetyltransferase  24.69 
 
 		 771 aa  46.6  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5336  GCN5-related N-acetyltransferase  28.77 
 
 		 785 aa  45.4  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5525  GCN5-related N-acetyltransferase  28.77 
 
 		 806 aa  45.4  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4747  GCN5-related N-acetyltransferase  28.77 
 
 		 785 aa  45.1  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3063  acetyltransferase  26.45 
 
 		 897 aa  45.1  0.0008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2420  acetyltransferase  25 
 
 		 892 aa  44.7  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.773408  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6906  GCN5-related N-acetyltransferase  27.08 
 
 		 175 aa  44.7  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0930  GCN5-related N-acetyltransferase  30.19 
 
 		 218 aa  43.9  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2354  GCN5-related N-acetyltransferase  25.37 
 
 		 214 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.551599 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0252  GCN5-related N-acetyltransferase  25.42 
 
 		 882 aa  43.9  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0975681  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0400  GCN5-related N-acetyltransferase  28 
 
 		 898 aa  43.9  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.249053  normal  0.200769 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0134  GCN5-related N-acetyltransferase  28.08 
 
 		 785 aa  43.1  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1423  CoA-binding domain-containing protein  29.59 
 
 		 909 aa  43.5  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.382585  hitchhiker  0.0000471677 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3891  GNAT family acetyltransferase  28.78 
 
 		 207 aa  43.5  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.867552 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0891  GCN5-related N-acetyltransferase  29.56 
 
 		 218 aa  43.5  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5396  GCN5-related N-acetyltransferase  28.08 
 
 		 785 aa  42.7  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.916817  normal  0.647823 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5003  CoA-binding domain protein  27.72 
 
 		 920 aa  42.4  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3962  GCN5-related N-acetyltransferase  28.97 
 
 		 192 aa  42.4  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00434349  normal  0.0285152 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3848  GCN5-related N-acetyltransferase  28.97 
 
 		 192 aa  42.4  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000121275  normal  0.760581 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1570  GCN5-related N-acetyltransferase  27.66 
 
 		 177 aa  42.4  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.763005 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2035  hypothetical protein  26.43 
 
 		 215 aa  42  0.009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.128169 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0517  hypothetical protein  26.67 
 
 		 893 aa  41.6  0.009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>