110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4764 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012791  Vapar_4764  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
242 aa  491  9.999999999999999e-139  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0977317  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4211  GCN5-related N-acetyltransferase  66.53 
 
 
245 aa  315  6e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.494469  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0522  GCN5-related N-acetyltransferase  67.42 
 
 
225 aa  309  2.9999999999999997e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0134212 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0438  GCN5-related N-acetyltransferase  65.83 
 
 
275 aa  308  5.9999999999999995e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.576633  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0538  GCN5-related N-acetyltransferase  70.87 
 
 
210 aa  307  8e-83  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1270  GCN5-related N-acetyltransferase  61.75 
 
 
223 aa  278  6e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.748246  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3699  GCN5-related N-acetyltransferase  63.59 
 
 
246 aa  273  1.0000000000000001e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2138  GCN5-related N-acetyltransferase  66.5 
 
 
205 aa  267  1e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.310704  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4187  GCN5-related N-acetyltransferase  67.17 
 
 
222 aa  263  2e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3158  hypothetical protein  60.1 
 
 
242 aa  224  1e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0104373 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0554  GCN5-related N-acetyltransferase  51.02 
 
 
233 aa  199  3e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0242  GCN5-related N-acetyltransferase  41.38 
 
 
215 aa  158  8e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3422  GCN5-related N-acetyltransferase  40.91 
 
 
215 aa  156  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0303  GCN5-related N-acetyltransferase  39.9 
 
 
215 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.518598  hitchhiker  0.000134337 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0251  GCN5-related N-acetyltransferase  40.89 
 
 
211 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00144253 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3669  GCN5-related N-acetyltransferase  41.05 
 
 
222 aa  154  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00406711  hitchhiker  0.0000000686712 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3381  GCN5-related N-acetyltransferase  40.98 
 
 
231 aa  154  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3034  GCN5-related N-acetyltransferase  40.98 
 
 
231 aa  154  1e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3215  GCN5-related N-acetyltransferase  41.58 
 
 
232 aa  154  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3098  hypothetical protein  40.19 
 
 
231 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3378  GCN5-related N-acetyltransferase  42.63 
 
 
245 aa  152  2.9999999999999998e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2783  GCN5-related N-acetyltransferase  38.92 
 
 
215 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0323  GCN5-related N-acetyltransferase  38.92 
 
 
215 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2580  acetyltransferase  39.42 
 
 
255 aa  152  5e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0014  acetyltransferase  39.42 
 
 
255 aa  152  7e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2864  GCN5-related N-acetyltransferase  41.67 
 
 
221 aa  151  7e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000583305 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0005  acetyltransferase  40.1 
 
 
215 aa  151  8e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0625007  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3118  acetyltransferase  40.1 
 
 
215 aa  151  8e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.515092  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1977  acetyltransferase  40.1 
 
 
215 aa  151  8e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3782  acetyltransferase  40.1 
 
 
215 aa  151  8e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3843  acetyltransferase  40.1 
 
 
215 aa  151  8e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3530  acetyltransferase  40.1 
 
 
215 aa  151  8e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3104  acetyltransferase  40.82 
 
 
215 aa  149  3e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0288  GCN5-related N-acetyltransferase  40.96 
 
 
224 aa  149  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.603484 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0225  GCN5-related N-acetyltransferase  39.39 
 
 
215 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.233449  hitchhiker  0.0000188583 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0038  GCN5-related N-acetyltransferase  39.18 
 
 
218 aa  142  5e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000011752  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0034  GCN5-related N-acetyltransferase  41.14 
 
 
195 aa  139  4.999999999999999e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000614115  hitchhiker  0.0000000330992 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2843  GCN5-related N-acetyltransferase  35.1 
 
 
171 aa  78.2  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.038853  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5396  GCN5-related N-acetyltransferase  31.03 
 
 
785 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.916817  normal  0.647823 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0368  GCN5-related N-acetyltransferase  30.06 
 
 
242 aa  56.2  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5336  GCN5-related N-acetyltransferase  30.34 
 
 
785 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5525  GCN5-related N-acetyltransferase  30.34 
 
 
806 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3280  GCN5-related N-acetyltransferase  30.28 
 
 
846 aa  54.7  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0316376 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6923  GCN5-related N-acetyltransferase  31.13 
 
 
834 aa  54.7  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.297711 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0134  GCN5-related N-acetyltransferase  30.34 
 
 
785 aa  54.3  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4747  GCN5-related N-acetyltransferase  29.66 
 
 
785 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2967  GNAT family acetyltransferase  31.13 
 
 
809 aa  53.5  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4849  GCN5-related N-acetyltransferase  29.66 
 
 
813 aa  53.9  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1011  acyl-CoA synthetase (ADP forming)  29.41 
 
 
918 aa  53.1  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.415353  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2158  GCN5-related N-acetyltransferase  32.72 
 
 
191 aa  52.8  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.447718 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4289  GCN5-related N-acetyltransferase  28.38 
 
 
807 aa  52.4  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2206  acetyltransferase  28.57 
 
 
836 aa  50.8  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0254612  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3103  GCN5-related N-acetyltransferase  30.59 
 
 
208 aa  50.8  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3208  acetyltransferase  26.25 
 
 
911 aa  50.1  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000156  protein acetyltransferase  25.93 
 
 
877 aa  49.3  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.775567  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0540  GCN5-related N-acetyltransferase  27.33 
 
 
895 aa  48.9  0.00007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0367  acetyltransferase  26.21 
 
 
787 aa  47.4  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00347204  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1237  acetyltransferase  26.21 
 
 
1024 aa  47.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000574609  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1554  acetyltransferase  26.21 
 
 
803 aa  47.4  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00991343  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1742  acetyltransferase  26.21 
 
 
803 aa  47.4  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00130768  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2999  acetyltransferase  26.21 
 
 
803 aa  47.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000057298  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2882  acetyltransferase  26.21 
 
 
803 aa  47.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0404  acetyltransferase  26.21 
 
 
787 aa  47.4  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.121441  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2354  GCN5-related N-acetyltransferase  28.19 
 
 
214 aa  47  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.551599 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0866  GCN5-related N-acetyltransferase  27.56 
 
 
218 aa  46.2  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1092  GCN5-related N-acetyltransferase  26.47 
 
 
893 aa  45.8  0.0006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.20314  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1474  GCN5-related N-acetyltransferase  25.88 
 
 
206 aa  45.4  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.195699 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0615  GCN5-related N-acetyltransferase  24.24 
 
 
775 aa  45.4  0.0007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.47112  normal  0.466486 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2228  GCN5-related N-acetyltransferase  29.5 
 
 
893 aa  45.4  0.0009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.00661786  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1742  GCN5-related N-acetyltransferase  24.18 
 
 
903 aa  45.4  0.0009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3564  CoA-binding domain protein  32.22 
 
 
902 aa  44.7  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.695831  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4719  GCN5-related N-acetyltransferase  25.95 
 
 
907 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.345229  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27480  acyl-CoA synthetase (NDP forming)  29.49 
 
 
926 aa  44.3  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02478  fused predicted acyl-CoA synthetase: NAD(P)-binding subunit/ATP-binding subunit  26.06 
 
 
886 aa  43.9  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1084  GCN5-related N-acetyltransferase  26.06 
 
 
886 aa  43.9  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2352  GCN5-related N-acetyltransferase  23.84 
 
 
892 aa  44.3  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02442  hypothetical protein  26.06 
 
 
886 aa  43.9  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2741  CoA-binding domain/acetyltransferase domain-containing protein  26.06 
 
 
886 aa  43.9  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.225885  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2871  CoA-binding domain/acetyltransferase domain-containing protein  26.06 
 
 
886 aa  43.9  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.288181  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1093  GCN5-related N-acetyltransferase  26.06 
 
 
886 aa  43.9  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.312736  normal  0.038329 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2737  CoA-binding domain/acetyltransferase domain-containing protein  26.06 
 
 
886 aa  43.9  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.028573  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2674  GCN5-related N-acetyltransferase  29.3 
 
 
197 aa  43.9  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0897177  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2952  acetyltransferase, GNAT family protein  26.06 
 
 
886 aa  43.9  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.487518  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3821  acetyltransferase, GNAT family protein  26.06 
 
 
886 aa  43.9  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.126569  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1205  CoA-binding  26.71 
 
 
903 aa  43.5  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.370285  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2863  CoA binding domain/acetyltransferase domain protein  26.09 
 
 
886 aa  43.5  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2867  CoA binding domain/acetyltransferase domain-containing protein  26.09 
 
 
886 aa  43.5  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2845  CoA binding domain/acetyltransferase domain protein  26.09 
 
 
886 aa  43.5  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2761  CoA binding domain/acetyltransferase domain protein  26.09 
 
 
886 aa  43.5  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.282153  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2979  CoA-binding domain/acetyltransferase domain-containing protein  26.09 
 
 
886 aa  43.5  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1469  CoA-binding domain protein  32.18 
 
 
902 aa  43.1  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1135  GCN5-related N-acetyltransferase  26.47 
 
 
179 aa  43.1  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.370812  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3063  acetyltransferase  28.21 
 
 
897 aa  43.1  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1862  CoA-binding domain protein  26.57 
 
 
900 aa  43.1  0.004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.167225  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1446  GCN5-related N-acetyltransferase  27.27 
 
 
186 aa  42.7  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1969  CoA-binding domain-containing protein  27.14 
 
 
893 aa  42.7  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0683536  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05787  hypothetical protein  22.98 
 
 
877 aa  42.7  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3848  GCN5-related N-acetyltransferase  28.21 
 
 
192 aa  42.4  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000121275  normal  0.760581 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3258  GCN5-related N-acetyltransferase  25.7 
 
 
204 aa  42.4  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.764419 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1477  GCN5-related N-acetyltransferase  24.32 
 
 
896 aa  42.4  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.630899  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>