107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3378 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_3378  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 		 245 aa  498  1e-140  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3215  GCN5-related N-acetyltransferase  93.07 
 
 		 232 aa  428  1e-119  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3381  GCN5-related N-acetyltransferase  81.47 
 
 		 231 aa  390  1e-107  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3034  GCN5-related N-acetyltransferase  81.47 
 
 		 231 aa  390  1e-107  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3098  hypothetical protein  78.88 
 
 		 231 aa  380  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0288  GCN5-related N-acetyltransferase  61.17 
 
 		 224 aa  249  3e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.603484 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2580  acetyltransferase  58.6 
 
 		 255 aa  246  2e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0014  acetyltransferase  55.79 
 
 		 255 aa  246  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0005  acetyltransferase  58.6 
 
 		 215 aa  245  4e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0625007  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3118  acetyltransferase  58.6 
 
 		 215 aa  245  4e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.515092  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1977  acetyltransferase  58.6 
 
 		 215 aa  245  4e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3782  acetyltransferase  58.6 
 
 		 215 aa  245  4e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3843  acetyltransferase  58.6 
 
 		 215 aa  245  4e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3530  acetyltransferase  58.6 
 
 		 215 aa  245  4e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3104  acetyltransferase  59.07 
 
 		 215 aa  245  4.9999999999999997e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0303  GCN5-related N-acetyltransferase  63.32 
 
 		 215 aa  245  6e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.518598  hitchhiker  0.000134337 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3422  GCN5-related N-acetyltransferase  64.1 
 
 		 215 aa  243  9.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0251  GCN5-related N-acetyltransferase  62.2 
 
 		 211 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144253 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3669  GCN5-related N-acetyltransferase  61.19 
 
 		 222 aa  243  9.999999999999999e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00406711  hitchhiker  0.0000000686712 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0242  GCN5-related N-acetyltransferase  61.03 
 
 		 215 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0225  GCN5-related N-acetyltransferase  62.56 
 
 		 215 aa  242  3e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.233449  hitchhiker  0.0000188583 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2783  GCN5-related N-acetyltransferase  62.81 
 
 		 215 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0323  GCN5-related N-acetyltransferase  62.81 
 
 		 215 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2864  GCN5-related N-acetyltransferase  59.5 
 
 		 221 aa  241  1e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000583305 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0038  GCN5-related N-acetyltransferase  51.81 
 
 		 218 aa  213  1.9999999999999998e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000011752  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0034  GCN5-related N-acetyltransferase  52.63 
 
 		 195 aa  186  3e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000614115  hitchhiker  0.0000000330992 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3699  GCN5-related N-acetyltransferase  42.73 
 
 		 246 aa  170  2e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0438  GCN5-related N-acetyltransferase  42.65 
 
 		 275 aa  170  2e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.576633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4211  GCN5-related N-acetyltransferase  42.11 
 
 		 245 aa  163  2.0000000000000002e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.494469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4187  GCN5-related N-acetyltransferase  45.23 
 
 		 222 aa  160  2e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4764  GCN5-related N-acetyltransferase  41.1 
 
 		 242 aa  155  4e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0977317  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2138  GCN5-related N-acetyltransferase  43.68 
 
 		 205 aa  153  2e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.310704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0538  GCN5-related N-acetyltransferase  40.93 
 
 		 210 aa  152  7e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0522  GCN5-related N-acetyltransferase  40.93 
 
 		 225 aa  151  8e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0134212 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1270  GCN5-related N-acetyltransferase  40 
 
 		 223 aa  151  1e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.748246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3158  hypothetical protein  40.82 
 
 		 242 aa  149  3e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0104373 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0554  GCN5-related N-acetyltransferase  40.68 
 
 		 233 aa  145  5e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2843  GCN5-related N-acetyltransferase  33.11 
 
 		 171 aa  68.2  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.038853  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0368  GCN5-related N-acetyltransferase  28 
 
 		 242 aa  66.6  0.0000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2158  GCN5-related N-acetyltransferase  28.31 
 
 		 191 aa  64.7  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.447718 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3103  GCN5-related N-acetyltransferase  30 
 
 		 208 aa  63.9  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2674  GCN5-related N-acetyltransferase  30.36 
 
 		 197 aa  63.5  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0897177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1477  GCN5-related N-acetyltransferase  29.53 
 
 		 896 aa  58.2  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.630899  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1446  GCN5-related N-acetyltransferase  29.5 
 
 		 186 aa  56.2  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1742  GCN5-related N-acetyltransferase  28.81 
 
 		 903 aa  55.8  0.0000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0866  GCN5-related N-acetyltransferase  28.76 
 
 		 218 aa  55.5  0.0000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1311  hypothetical protein  26.25 
 
 		 886 aa  51.6  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1037  GCN5-related N-acetyltransferase  25.83 
 
 		 887 aa  51.2  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.737751  normal  0.467815 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1570  GCN5-related N-acetyltransferase  29.79 
 
 		 177 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.763005 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05787  hypothetical protein  28.06 
 
 		 877 aa  49.3  0.00006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1862  CoA-binding domain protein  31.34 
 
 		 900 aa  48.9  0.00008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.167225  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3206  putative acyl-CoA synthetase  28.97 
 
 		 880 aa  47.4  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3465  putative acyl-CoA synthetase  28.97 
 
 		 880 aa  47.4  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.063853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3343  GCN5-related N-acetyltransferase  28.97 
 
 		 880 aa  47.4  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0598594  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13180  acyl-CoA synthetase (NDP forming)  29.2 
 
 		 909 aa  47.4  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.135541  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3069  GCN5-related N-acetyltransferase  25.3 
 
 		 887 aa  46.6  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.835722  hitchhiker  0.00746938 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0505  CoA-binding domain protein  27.46 
 
 		 887 aa  46.6  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000156  protein acetyltransferase  26.62 
 
 		 877 aa  46.6  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.775567  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1092  GCN5-related N-acetyltransferase  26.71 
 
 		 893 aa  46.2  0.0005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.20314  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1548  CoA-binding domain protein  29.66 
 
 		 899 aa  46.2  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.25767  normal  0.134976 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0885  GCN5-related N-acetyltransferase  28.47 
 
 		 887 aa  45.8  0.0006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3891  GNAT family acetyltransferase  27.34 
 
 		 207 aa  45.4  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.867552 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1120  GCN5-related N-acetyltransferase  30.18 
 
 		 189 aa  45.8  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00483116  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3337  GCN5-related N-acetyltransferase  28.28 
 
 		 882 aa  45.4  0.0007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3493  GCN5-related N-acetyltransferase  28.38 
 
 		 882 aa  45.4  0.0009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02478  fused predicted acyl-CoA synthetase: NAD(P)-binding subunit/ATP-binding subunit  24.84 
 
 		 886 aa  45.1  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1084  GCN5-related N-acetyltransferase  24.84 
 
 		 886 aa  45.1  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2967  GNAT family acetyltransferase  31.16 
 
 		 809 aa  45.4  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0517  hypothetical protein  24.7 
 
 		 893 aa  44.7  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2741  CoA-binding domain/acetyltransferase domain-containing protein  24.84 
 
 		 886 aa  45.1  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.225885  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2871  CoA-binding domain/acetyltransferase domain-containing protein  24.84 
 
 		 886 aa  44.7  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.288181  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1093  GCN5-related N-acetyltransferase  24.84 
 
 		 886 aa  45.1  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.312736  normal  0.038329 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2737  CoA-binding domain/acetyltransferase domain-containing protein  24.84 
 
 		 886 aa  45.1  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.028573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2952  acetyltransferase, GNAT family protein  24.84 
 
 		 886 aa  45.1  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.487518  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6923  GCN5-related N-acetyltransferase  30.43 
 
 		 834 aa  45.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.297711 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2863  CoA binding domain/acetyltransferase domain protein  24.84 
 
 		 886 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2867  CoA binding domain/acetyltransferase domain-containing protein  24.84 
 
 		 886 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2845  CoA binding domain/acetyltransferase domain protein  24.84 
 
 		 886 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2761  CoA binding domain/acetyltransferase domain protein  24.84 
 
 		 886 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.282153  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2979  CoA-binding domain/acetyltransferase domain-containing protein  24.84 
 
 		 886 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3821  acetyltransferase, GNAT family protein  24.84 
 
 		 886 aa  45.1  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.126569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6906  GCN5-related N-acetyltransferase  25.79 
 
 		 175 aa  45.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02442  hypothetical protein  24.84 
 
 		 886 aa  45.1  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2035  hypothetical protein  28.81 
 
 		 215 aa  43.9  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.128169 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1628  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 		 901 aa  43.9  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.321665  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3280  GCN5-related N-acetyltransferase  27.4 
 
 		 846 aa  44.3  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0316376 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16050  acyl-CoA synthetase (NDP forming)  34.62 
 
 		 934 aa  43.9  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.243356 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3787  GCN5-related N-acetyltransferase  30.43 
 
 		 893 aa  44.3  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.152255  normal  0.584702 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2354  GCN5-related N-acetyltransferase  25.73 
 
 		 214 aa  43.5  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.551599 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2486  GCN5-related N-acetyltransferase  23.76 
 
 		 771 aa  43.5  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0144  GCN5-related N-acetyltransferase  28.95 
 
 		 852 aa  43.5  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2131  CoA-binding domain protein  28.28 
 
 		 904 aa  43.5  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.131154  normal  0.594511 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15880  acyl-CoA synthetase (NDP forming)  29.93 
 
 		 831 aa  43.1  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00274098  normal  0.158003 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5336  GCN5-related N-acetyltransferase  25.34 
 
 		 785 aa  42.7  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5525  GCN5-related N-acetyltransferase  25.34 
 
 		 806 aa  42.7  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1469  CoA-binding domain protein  28.21 
 
 		 902 aa  42.7  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27480  acyl-CoA synthetase (NDP forming)  31.11 
 
 		 926 aa  42.7  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2552  GCN5-related N-acetyltransferase  26.17 
 
 		 163 aa  42.7  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2604  GCN5-related N-acetyltransferase  26.17 
 
 		 163 aa  42.7  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3748  GCN5-related N-acetyltransferase  28.91 
 
 		 882 aa  42.7  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0223555  normal  0.236384 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>