52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2354 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_2354  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 		 214 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.551599 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2936  GCN5-related N-acetyltransferase  74.65 
 
 		 206 aa  298  5e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0666782  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2508  GCN5-related N-acetyltransferase  74.3 
 
 		 206 aa  295  4e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0757866  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3440  GCN5-related N-acetyltransferase  73.83 
 
 		 207 aa  293  1e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3891  GNAT family acetyltransferase  57.46 
 
 		 207 aa  202  4e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.867552 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1446  GCN5-related N-acetyltransferase  49.34 
 
 		 186 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0368  GCN5-related N-acetyltransferase  36.36 
 
 		 242 aa  92.4  5e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3103  GCN5-related N-acetyltransferase  39.29 
 
 		 208 aa  89.4  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0866  GCN5-related N-acetyltransferase  31.25 
 
 		 218 aa  73.2  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4095  GCN5-related N-acetyltransferase  36.15 
 
 		 163 aa  71.6  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.608016 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1327  GCN5-related N-acetyltransferase  29.88 
 
 		 163 aa  67.8  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0912478  normal  0.190195 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2674  GCN5-related N-acetyltransferase  31.37 
 
 		 197 aa  62.8  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0897177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2158  GCN5-related N-acetyltransferase  30.97 
 
 		 191 aa  56.2  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.447718 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0891  GCN5-related N-acetyltransferase  30.81 
 
 		 218 aa  52.4  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0538  GCN5-related N-acetyltransferase  29.41 
 
 		 210 aa  51.6  0.000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0522  GCN5-related N-acetyltransferase  29.41 
 
 		 225 aa  51.6  0.000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0134212 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0930  GCN5-related N-acetyltransferase  31.65 
 
 		 218 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0837  GCN5-related N-acetyltransferase  23.6 
 
 		 176 aa  48.9  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00901347  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19270  sortase-like acyltransferase  31.82 
 
 		 160 aa  47.4  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.426501  normal  0.456867 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1120  GCN5-related N-acetyltransferase  31.21 
 
 		 189 aa  47  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00483116  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4764  GCN5-related N-acetyltransferase  28.19 
 
 		 242 aa  47  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0977317  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3381  GCN5-related N-acetyltransferase  26.54 
 
 		 231 aa  47  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3034  GCN5-related N-acetyltransferase  26.54 
 
 		 231 aa  47  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0438  GCN5-related N-acetyltransferase  27.38 
 
 		 275 aa  46.6  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.576633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0554  GCN5-related N-acetyltransferase  26.44 
 
 		 233 aa  46.6  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5102  GCN5-related N-acetyltransferase  31.69 
 
 		 332 aa  46.6  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0705936  normal  0.638402 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3493  GCN5-related N-acetyltransferase  26.28 
 
 		 882 aa  46.2  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0303  GCN5-related N-acetyltransferase  24.69 
 
 		 215 aa  45.8  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.518598  hitchhiker  0.000134337 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0615  GCN5-related N-acetyltransferase  28.77 
 
 		 775 aa  45.4  0.0007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.47112  normal  0.466486 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3422  GCN5-related N-acetyltransferase  25 
 
 		 215 aa  45.4  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4284  cyclic nucleotide-binding protein  33.33 
 
 		 332 aa  45.1  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4370  cyclic nucleotide-binding protein  33.33 
 
 		 332 aa  45.1  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.518531  normal  0.153807 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3337  GCN5-related N-acetyltransferase  26.28 
 
 		 882 aa  44.3  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4663  cyclic nucleotide-binding protein  33.33 
 
 		 332 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2783  GCN5-related N-acetyltransferase  24.69 
 
 		 215 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3098  hypothetical protein  25.37 
 
 		 231 aa  44.3  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1439  GCN5-related N-acetyltransferase  32.95 
 
 		 222 aa  43.5  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2210  GCN5-related N-acetyltransferase  39.34 
 
 		 178 aa  43.9  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.236842  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0323  GCN5-related N-acetyltransferase  24.69 
 
 		 215 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3158  hypothetical protein  28.21 
 
 		 242 aa  43.5  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0104373 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1270  GCN5-related N-acetyltransferase  26.71 
 
 		 223 aa  43.5  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.748246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2131  CoA-binding domain protein  30.4 
 
 		 904 aa  43.1  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.131154  normal  0.594511 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1446  GCN5-related N-acetyltransferase  27.91 
 
 		 207 aa  43.5  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.239362  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0288  GCN5-related N-acetyltransferase  24.38 
 
 		 224 aa  42.7  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.603484 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11017  hypothetical protein  29.2 
 
 		 333 aa  42.4  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.210732  normal  0.341372 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1986  GCN5-related N-acetyltransferase  29.71 
 
 		 345 aa  42  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.583564  normal  0.569103 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3378  GCN5-related N-acetyltransferase  25.32 
 
 		 245 aa  42  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4155  GCN5-related N-acetyltransferase  28.41 
 
 		 186 aa  42  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.481727  normal  0.582134 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0885  GCN5-related N-acetyltransferase  27.98 
 
 		 887 aa  41.6  0.009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3215  GCN5-related N-acetyltransferase  25.97 
 
 		 232 aa  41.6  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0251  GCN5-related N-acetyltransferase  24.07 
 
 		 211 aa  41.6  0.01  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144253 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0578  acetyltransferase-like  41.27 
 
 		 167 aa  41.6  0.01  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0334685 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>