66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4095 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_4095  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 		 163 aa  328  2e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.608016 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1327  GCN5-related N-acetyltransferase  71.07 
 
 		 163 aa  219  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0912478  normal  0.190195 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3103  GCN5-related N-acetyltransferase  35.48 
 
 		 208 aa  90.5  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0368  GCN5-related N-acetyltransferase  34.78 
 
 		 242 aa  82.4  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1446  GCN5-related N-acetyltransferase  34.69 
 
 		 186 aa  82.8  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2674  GCN5-related N-acetyltransferase  35.37 
 
 		 197 aa  76.3  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0897177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2354  GCN5-related N-acetyltransferase  36.15 
 
 		 214 aa  71.6  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.551599 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0866  GCN5-related N-acetyltransferase  31.33 
 
 		 218 aa  71.2  0.000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2158  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 		 191 aa  67  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.447718 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3891  GNAT family acetyltransferase  36.07 
 
 		 207 aa  65.1  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.867552 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4638  CoA-binding domain protein  29.85 
 
 		 907 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.349562  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3440  GCN5-related N-acetyltransferase  36.08 
 
 		 207 aa  53.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1718  CoA-binding domain protein  27.34 
 
 		 901 aa  50.8  0.000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1742  GCN5-related N-acetyltransferase  28.46 
 
 		 903 aa  50.8  0.000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2508  GCN5-related N-acetyltransferase  36.08 
 
 		 206 aa  50.8  0.000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0757866  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2936  GCN5-related N-acetyltransferase  37 
 
 		 206 aa  50.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0666782  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1092  GCN5-related N-acetyltransferase  27.39 
 
 		 893 aa  50.1  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.20314  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0930  GCN5-related N-acetyltransferase  32.41 
 
 		 218 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2621  GCN5-related N-acetyltransferase  42.11 
 
 		 165 aa  50.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0308502  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3911  GCN5-related N-acetyltransferase  32.31 
 
 		 891 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.680583  normal  0.356909 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0891  GCN5-related N-acetyltransferase  31.72 
 
 		 218 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4402  GCN5-related N-acetyltransferase  40 
 
 		 161 aa  48.9  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0721768 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3002  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 		 168 aa  47.8  0.00007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3902  GCN5-related N-acetyltransferase  29.38 
 
 		 906 aa  46.6  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.835064  normal  0.701113 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1120  GCN5-related N-acetyltransferase  32 
 
 		 189 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00483116  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2295  GCN5-related N-acetyltransferase  37.33 
 
 		 175 aa  45.8  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.4166 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4284  cyclic nucleotide-binding protein  36.76 
 
 		 332 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4663  cyclic nucleotide-binding protein  36.76 
 
 		 332 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5313  GCN5-related N-acetyltransferase  30.16 
 
 		 900 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.653204  normal  0.891732 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4370  cyclic nucleotide-binding protein  36.76 
 
 		 332 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.518531  normal  0.153807 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5238  GCN5-related N-acetyltransferase  29.92 
 
 		 900 aa  45.4  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.365104 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6906  GCN5-related N-acetyltransferase  30.07 
 
 		 175 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4771  GCN5-related N-acetyltransferase  29.92 
 
 		 900 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4688  GCN5-related N-acetyltransferase  36 
 
 		 169 aa  44.7  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.185448  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1411  GCN5-related N-acetyltransferase  29.67 
 
 		 147 aa  43.9  0.0009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000201819  hitchhiker  0.000645315 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0746  acetyl-CoA hydrolase/transferase  33.33 
 
 		 634 aa  43.5  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2589  CoA-binding domain-containing protein  28.33 
 
 		 918 aa  43.5  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.121473 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0400  GCN5-related N-acetyltransferase  30.58 
 
 		 898 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.249053  normal  0.200769 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1270  GCN5-related N-acetyltransferase  26.39 
 
 		 223 aa  43.5  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.748246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02893  acetyltransferase, gnat family  28.76 
 
 		 902 aa  42.7  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2835  GCN5-related N-acetyltransferase  32.61 
 
 		 181 aa  42.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.851702 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2024  long-chain fatty-acid-CoA ligase  30.95 
 
 		 892 aa  42.7  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2138  GCN5-related N-acetyltransferase  28 
 
 		 205 aa  42.7  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.310704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4187  GCN5-related N-acetyltransferase  28.28 
 
 		 222 aa  42.7  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1570  GCN5-related N-acetyltransferase  34.12 
 
 		 177 aa  43.1  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.763005 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1474  GCN5-related N-acetyltransferase  26.9 
 
 		 206 aa  42.7  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.195699 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1915  cyclic nucleotide-binding protein  31.25 
 
 		 329 aa  42  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.379435  normal  0.183424 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2131  CoA-binding domain protein  28.24 
 
 		 904 aa  42.4  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.131154  normal  0.594511 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0641  putative acetyltransferase  27.78 
 
 		 894 aa  42.4  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0517874  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2792  acetyltransferase  37.88 
 
 		 178 aa  42.4  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3669  GCN5-related N-acetyltransferase  26.76 
 
 		 222 aa  42  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00406711  hitchhiker  0.0000000686712 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1477  GCN5-related N-acetyltransferase  25.35 
 
 		 896 aa  42  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.630899  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0288  GCN5-related N-acetyltransferase  26.87 
 
 		 224 aa  41.6  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.603484 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1776  GCN5-related N-acetyltransferase  26.03 
 
 		 898 aa  41.6  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.634734 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2819  GCN5-related N-acetyltransferase  25.17 
 
 		 897 aa  41.2  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.869939 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3289  acetyltransferase  30.37 
 
 		 182 aa  41.2  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.252345  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0852  GCN5-related N-acetyltransferase  25.64 
 
 		 888 aa  40.8  0.007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.121285  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2237  CoA-binding domain protein  30.65 
 
 		 950 aa  41.2  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0315579  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1092  acetyltransferase  37.1 
 
 		 191 aa  40.8  0.008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1372  acetyltransferase  37.1 
 
 		 191 aa  40.8  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.519651  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1456  acetyltransferase  37.1 
 
 		 191 aa  40.8  0.008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3240  acetyltransferase  37.1 
 
 		 191 aa  40.8  0.008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.68006  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2063  acetyltransferase  37.1 
 
 		 191 aa  40.8  0.008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.475157  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3125  acetyltransferase  37.1 
 
 		 191 aa  40.8  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.706224  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2357  acetyltransferase  37.1 
 
 		 191 aa  40.8  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0038  GCN5-related N-acetyltransferase  28.69 
 
 		 218 aa  40.4  0.01  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000011752  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>