96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1327 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007778  RPB_1327  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
163 aa  328  2e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0912478  normal  0.190195 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4095  GCN5-related N-acetyltransferase  71.07 
 
 
163 aa  219  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.608016 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0368  GCN5-related N-acetyltransferase  32.91 
 
 
242 aa  85.9  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1446  GCN5-related N-acetyltransferase  34.42 
 
 
186 aa  82.4  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3103  GCN5-related N-acetyltransferase  36.77 
 
 
208 aa  81.3  0.000000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2674  GCN5-related N-acetyltransferase  35.4 
 
 
197 aa  75.5  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0897177  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2158  GCN5-related N-acetyltransferase  35.4 
 
 
191 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.447718 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2354  GCN5-related N-acetyltransferase  29.88 
 
 
214 aa  67.8  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.551599 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3891  GNAT family acetyltransferase  37.39 
 
 
207 aa  66.6  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.867552 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5313  GCN5-related N-acetyltransferase  36.09 
 
 
900 aa  65.1  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.653204  normal  0.891732 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0866  GCN5-related N-acetyltransferase  32.61 
 
 
218 aa  64.3  0.0000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5238  GCN5-related N-acetyltransferase  33.12 
 
 
900 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.365104 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4771  GCN5-related N-acetyltransferase  33.12 
 
 
900 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1742  GCN5-related N-acetyltransferase  31.25 
 
 
903 aa  58.2  0.00000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4638  CoA-binding domain protein  31.16 
 
 
907 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.349562  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1570  GCN5-related N-acetyltransferase  33.12 
 
 
177 aa  55.1  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.763005 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2131  CoA-binding domain protein  30.66 
 
 
904 aa  55.1  0.0000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.131154  normal  0.594511 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3341  GCN5-related N-acetyltransferase  30 
 
 
187 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3911  GCN5-related N-acetyltransferase  32.35 
 
 
891 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.680583  normal  0.356909 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4187  GCN5-related N-acetyltransferase  30.92 
 
 
222 aa  52  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2589  CoA-binding domain-containing protein  31.01 
 
 
918 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.121473 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1474  GCN5-related N-acetyltransferase  29.41 
 
 
206 aa  51.2  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.195699 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1092  GCN5-related N-acetyltransferase  29.86 
 
 
893 aa  50.8  0.000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.20314  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1120  GCN5-related N-acetyltransferase  33.12 
 
 
189 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00483116  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7067  Acyl-CoA synthetase (NDP forming)-like protein  27.78 
 
 
881 aa  50.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1270  GCN5-related N-acetyltransferase  27.95 
 
 
223 aa  49.7  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.748246  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3440  GCN5-related N-acetyltransferase  31.21 
 
 
207 aa  49.7  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3280  GCN5-related N-acetyltransferase  30.3 
 
 
846 aa  49.3  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0316376 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3902  GCN5-related N-acetyltransferase  31.82 
 
 
906 aa  48.5  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.835064  normal  0.701113 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2138  GCN5-related N-acetyltransferase  28.95 
 
 
205 aa  48.5  0.00004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.310704  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0615  GCN5-related N-acetyltransferase  30.77 
 
 
775 aa  48.5  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.47112  normal  0.466486 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4289  GCN5-related N-acetyltransferase  32.14 
 
 
807 aa  48.1  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2936  GCN5-related N-acetyltransferase  31.21 
 
 
206 aa  48.1  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0666782  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4719  GCN5-related N-acetyltransferase  29.03 
 
 
907 aa  48.1  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.345229  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4849  GCN5-related N-acetyltransferase  28.79 
 
 
813 aa  47.8  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3026  GCN5-related N-acetyltransferase  29.17 
 
 
189 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.150578  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0930  GCN5-related N-acetyltransferase  33.57 
 
 
218 aa  47.8  0.00006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2508  GCN5-related N-acetyltransferase  30.5 
 
 
206 aa  47.4  0.00009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0757866  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0891  GCN5-related N-acetyltransferase  32.86 
 
 
218 aa  47.4  0.00009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1351  GCN5-related N-acetyltransferase  29.13 
 
 
907 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1037  GCN5-related N-acetyltransferase  26.56 
 
 
887 aa  47  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.737751  normal  0.467815 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1311  hypothetical protein  34.26 
 
 
886 aa  46.6  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1205  CoA-binding  31.91 
 
 
903 aa  45.8  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.370285  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0517  hypothetical protein  27.01 
 
 
893 aa  46.2  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5396  GCN5-related N-acetyltransferase  28.79 
 
 
785 aa  46.6  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.916817  normal  0.647823 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6923  GCN5-related N-acetyltransferase  30.66 
 
 
834 aa  46.6  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.297711 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6906  GCN5-related N-acetyltransferase  29.1 
 
 
175 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3030  GCN5-related N-acetyltransferase  26.85 
 
 
182 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.712566  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5525  GCN5-related N-acetyltransferase  28.79 
 
 
806 aa  45.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5336  GCN5-related N-acetyltransferase  28.79 
 
 
785 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1469  CoA-binding domain protein  29.32 
 
 
902 aa  45.8  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4747  GCN5-related N-acetyltransferase  28.03 
 
 
785 aa  45.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1477  GCN5-related N-acetyltransferase  24.63 
 
 
896 aa  44.7  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.630899  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0134  GCN5-related N-acetyltransferase  28.79 
 
 
785 aa  44.7  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2206  acetyltransferase  28.89 
 
 
836 aa  44.3  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0254612  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3669  GCN5-related N-acetyltransferase  29.55 
 
 
222 aa  44.3  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00406711  hitchhiker  0.0000000686712 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0242  GCN5-related N-acetyltransferase  30.3 
 
 
215 aa  43.9  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0522  GCN5-related N-acetyltransferase  25.57 
 
 
225 aa  44.3  0.0008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0134212 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0538  GCN5-related N-acetyltransferase  25.57 
 
 
210 aa  43.9  0.0009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0288  GCN5-related N-acetyltransferase  29.37 
 
 
224 aa  43.5  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.603484 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4045  GCN5-related N-acetyltransferase  28.12 
 
 
899 aa  43.9  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.565149  normal  0.994893 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02893  acetyltransferase, gnat family  31.01 
 
 
902 aa  43.9  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2864  GCN5-related N-acetyltransferase  29.55 
 
 
221 aa  43.5  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000583305 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7760  putative Acetyl-CoA synthetase  27.78 
 
 
903 aa  43.5  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0734608  normal  0.0277308 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0303  GCN5-related N-acetyltransferase  28.79 
 
 
215 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.518598  hitchhiker  0.000134337 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1237  acetyltransferase  29.41 
 
 
1024 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000574609  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1554  acetyltransferase  29.41 
 
 
803 aa  43.1  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00991343  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1742  acetyltransferase  29.41 
 
 
803 aa  43.1  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00130768  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2999  acetyltransferase  29.41 
 
 
803 aa  43.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000057298  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2882  acetyltransferase  29.41 
 
 
803 aa  43.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0404  acetyltransferase  29.41 
 
 
787 aa  43.1  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.121441  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2486  GCN5-related N-acetyltransferase  28 
 
 
771 aa  42.7  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0367  acetyltransferase  29.41 
 
 
787 aa  43.1  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00347204  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0251  GCN5-related N-acetyltransferase  29.55 
 
 
211 aa  43.1  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00144253 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2967  GNAT family acetyltransferase  30.66 
 
 
809 aa  42.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1293  GCN5-related N-acetyltransferase  27.41 
 
 
173 aa  42  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3422  GCN5-related N-acetyltransferase  28.79 
 
 
215 aa  42.4  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2819  GCN5-related N-acetyltransferase  25 
 
 
897 aa  42.4  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.869939 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3164  GCN5-related N-acetyltransferase  28.06 
 
 
812 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0837  GCN5-related N-acetyltransferase  24.03 
 
 
176 aa  42  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00901347  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1919  GCN5-related N-acetyltransferase  26.72 
 
 
897 aa  42  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1862  CoA-binding domain protein  31.75 
 
 
900 aa  41.6  0.004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.167225  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2228  GCN5-related N-acetyltransferase  27.54 
 
 
893 aa  41.2  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.00661786  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0051  GCN5-related N-acetyltransferase  27.41 
 
 
173 aa  41.6  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1011  acyl-CoA synthetase (ADP forming)  27.34 
 
 
918 aa  41.6  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.415353  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3997  GCN5-related N-acetyltransferase  30 
 
 
193 aa  41.6  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0143681  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0323  GCN5-related N-acetyltransferase  28.79 
 
 
215 aa  41.2  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3208  acetyltransferase  28.03 
 
 
911 aa  41.2  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1371  GCN5-related N-acetyltransferase  27.42 
 
 
907 aa  41.2  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.870954  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4256  GCN5-related N-acetyltransferase  39.62 
 
 
173 aa  41.2  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.330329  normal  0.825884 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2783  GCN5-related N-acetyltransferase  28.79 
 
 
215 aa  41.2  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3063  acetyltransferase  38.33 
 
 
897 aa  40.8  0.007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0034  GCN5-related N-acetyltransferase  27.39 
 
 
195 aa  41.2  0.007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000614115  hitchhiker  0.0000000330992 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2207  GCN5-related N-acetyltransferase  29.17 
 
 
227 aa  40.8  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000126395  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0225  GCN5-related N-acetyltransferase  28.79 
 
 
215 aa  40.4  0.009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.233449  hitchhiker  0.0000188583 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3289  acetyltransferase  29.25 
 
 
182 aa  40.8  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.252345  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>