59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3891 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_3891  GNAT family acetyltransferase  100 
 
 
207 aa  428  1e-119  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.867552 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2354  GCN5-related N-acetyltransferase  58.42 
 
 
214 aa  228  4e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.551599 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2508  GCN5-related N-acetyltransferase  57.89 
 
 
206 aa  204  9e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0757866  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3440  GCN5-related N-acetyltransferase  57.31 
 
 
207 aa  201  8e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2936  GCN5-related N-acetyltransferase  57.89 
 
 
206 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0666782  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1446  GCN5-related N-acetyltransferase  53.12 
 
 
186 aa  149  2e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0368  GCN5-related N-acetyltransferase  35.88 
 
 
242 aa  104  1e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3103  GCN5-related N-acetyltransferase  44.06 
 
 
208 aa  98.6  6e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0866  GCN5-related N-acetyltransferase  35.21 
 
 
218 aa  79  0.00000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2674  GCN5-related N-acetyltransferase  39.29 
 
 
197 aa  79  0.00000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0897177  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1327  GCN5-related N-acetyltransferase  38.84 
 
 
163 aa  77.4  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0912478  normal  0.190195 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4095  GCN5-related N-acetyltransferase  37.4 
 
 
163 aa  75.9  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.608016 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0891  GCN5-related N-acetyltransferase  35.5 
 
 
218 aa  65.5  0.0000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0930  GCN5-related N-acetyltransferase  36.77 
 
 
218 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2158  GCN5-related N-acetyltransferase  34.07 
 
 
191 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.447718 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3034  GCN5-related N-acetyltransferase  31.52 
 
 
231 aa  56.2  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3381  GCN5-related N-acetyltransferase  31.52 
 
 
231 aa  56.2  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3378  GCN5-related N-acetyltransferase  29.01 
 
 
245 aa  55.8  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3215  GCN5-related N-acetyltransferase  29.01 
 
 
232 aa  54.7  0.0000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3098  hypothetical protein  30.43 
 
 
231 aa  54.3  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0505  CoA-binding domain protein  32.09 
 
 
887 aa  50.8  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3669  GCN5-related N-acetyltransferase  26.22 
 
 
222 aa  50.1  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00406711  hitchhiker  0.0000000686712 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0251  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 
211 aa  48.5  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00144253 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0303  GCN5-related N-acetyltransferase  28.3 
 
 
215 aa  48.5  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.518598  hitchhiker  0.000134337 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0522  GCN5-related N-acetyltransferase  28.48 
 
 
225 aa  48.5  0.00007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0134212 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0242  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 
215 aa  48.5  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0538  GCN5-related N-acetyltransferase  28.48 
 
 
210 aa  48.5  0.00007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3422  GCN5-related N-acetyltransferase  28.3 
 
 
215 aa  48.1  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0288  GCN5-related N-acetyltransferase  26.71 
 
 
224 aa  48.1  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.603484 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0554  GCN5-related N-acetyltransferase  30.72 
 
 
233 aa  47.4  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1270  GCN5-related N-acetyltransferase  29.71 
 
 
223 aa  46.6  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.748246  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0323  GCN5-related N-acetyltransferase  27.67 
 
 
215 aa  45.8  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2783  GCN5-related N-acetyltransferase  27.67 
 
 
215 aa  45.8  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3299  CoA-binding domain protein  27.06 
 
 
976 aa  45.4  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1120  GCN5-related N-acetyltransferase  34.96 
 
 
189 aa  45.1  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00483116  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3026  GCN5-related N-acetyltransferase  30.83 
 
 
189 aa  45.1  0.0008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.150578  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2604  GCN5-related N-acetyltransferase  34.07 
 
 
163 aa  45.1  0.0009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2131  CoA-binding domain protein  40.74 
 
 
904 aa  45.1  0.0009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.131154  normal  0.594511 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2552  GCN5-related N-acetyltransferase  34.07 
 
 
163 aa  45.1  0.0009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4284  cyclic nucleotide-binding protein  35.71 
 
 
332 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3232  acetyltransferase  30.58 
 
 
189 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4764  GCN5-related N-acetyltransferase  25 
 
 
242 aa  43.5  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0977317  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3104  acetyltransferase  26.71 
 
 
215 aa  43.9  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4370  cyclic nucleotide-binding protein  35.71 
 
 
332 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.518531  normal  0.153807 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2138  GCN5-related N-acetyltransferase  30 
 
 
205 aa  43.5  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.310704  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2864  GCN5-related N-acetyltransferase  26.42 
 
 
221 aa  43.5  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000583305 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4663  cyclic nucleotide-binding protein  35.71 
 
 
332 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0438  GCN5-related N-acetyltransferase  27.22 
 
 
275 aa  43.1  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.576633  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2463  GCN5-related N-acetyltransferase  29.75 
 
 
189 aa  43.1  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0279306  normal  0.590012 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000156  protein acetyltransferase  28 
 
 
877 aa  43.1  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.775567  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19270  sortase-like acyltransferase  38.24 
 
 
160 aa  43.1  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.426501  normal  0.456867 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0225  GCN5-related N-acetyltransferase  26.71 
 
 
215 aa  43.1  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.233449  hitchhiker  0.0000188583 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0038  GCN5-related N-acetyltransferase  27.01 
 
 
218 aa  42.7  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000011752  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0890  CoA-binding domain protein  30.23 
 
 
915 aa  42.7  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3158  hypothetical protein  29.61 
 
 
242 aa  42.4  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0104373 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2580  acetyltransferase  26.83 
 
 
255 aa  42  0.006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6022  hypothetical protein  28.99 
 
 
344 aa  42  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0534003  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1628  CoA-binding domain protein  30.77 
 
 
821 aa  41.6  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00866172  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0014  acetyltransferase  26.83 
 
 
255 aa  41.2  0.01  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>