41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_3440 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011004  Rpal_3440  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
207 aa  422  1e-117  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2508  GCN5-related N-acetyltransferase  89.37 
 
 
206 aa  344  4e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0757866  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2936  GCN5-related N-acetyltransferase  87.5 
 
 
206 aa  338  2.9999999999999998e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0666782  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2354  GCN5-related N-acetyltransferase  73.83 
 
 
214 aa  321  5e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.551599 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3891  GNAT family acetyltransferase  57.31 
 
 
207 aa  201  8e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.867552 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1446  GCN5-related N-acetyltransferase  48.67 
 
 
186 aa  137  7.999999999999999e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0368  GCN5-related N-acetyltransferase  35.33 
 
 
242 aa  97.1  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3103  GCN5-related N-acetyltransferase  35.29 
 
 
208 aa  92.8  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0866  GCN5-related N-acetyltransferase  33.77 
 
 
218 aa  74.3  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2674  GCN5-related N-acetyltransferase  33.54 
 
 
197 aa  64.7  0.0000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0897177  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4095  GCN5-related N-acetyltransferase  34.62 
 
 
163 aa  63.2  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.608016 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1327  GCN5-related N-acetyltransferase  31.21 
 
 
163 aa  61.6  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0912478  normal  0.190195 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0891  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
218 aa  55.1  0.0000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0930  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
218 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2158  GCN5-related N-acetyltransferase  29.52 
 
 
191 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.447718 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0522  GCN5-related N-acetyltransferase  28.86 
 
 
225 aa  47  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0134212 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0538  GCN5-related N-acetyltransferase  28.86 
 
 
210 aa  46.6  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0438  GCN5-related N-acetyltransferase  30.15 
 
 
275 aa  46.2  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.576633  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4764  GCN5-related N-acetyltransferase  29.53 
 
 
242 aa  46.2  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0977317  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6022  hypothetical protein  28.85 
 
 
344 aa  45.1  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0534003  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2131  CoA-binding domain protein  40.74 
 
 
904 aa  44.3  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.131154  normal  0.594511 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19270  sortase-like acyltransferase  29.61 
 
 
160 aa  44.7  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.426501  normal  0.456867 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1986  GCN5-related N-acetyltransferase  30.22 
 
 
345 aa  44.3  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.583564  normal  0.569103 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0554  GCN5-related N-acetyltransferase  27.95 
 
 
233 aa  44.3  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0631  GCN5-related N-acetyltransferase  30.61 
 
 
160 aa  44.3  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.947121  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1270  GCN5-related N-acetyltransferase  30.46 
 
 
223 aa  43.9  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.748246  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3422  GCN5-related N-acetyltransferase  24.69 
 
 
215 aa  43.9  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0615  GCN5-related N-acetyltransferase  25 
 
 
775 aa  42.7  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.47112  normal  0.466486 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2210  GCN5-related N-acetyltransferase  36.67 
 
 
178 aa  42.7  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.236842  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1663  acetyltransferase, GNAT family  35.71 
 
 
189 aa  42.7  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.146581  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0303  GCN5-related N-acetyltransferase  24.69 
 
 
215 aa  42  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.518598  hitchhiker  0.000134337 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4663  cyclic nucleotide-binding protein  32.1 
 
 
332 aa  42  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4370  cyclic nucleotide-binding protein  32.1 
 
 
332 aa  42  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.518531  normal  0.153807 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3493  GCN5-related N-acetyltransferase  26.8 
 
 
882 aa  42  0.006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4284  cyclic nucleotide-binding protein  32.1 
 
 
332 aa  42  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3381  GCN5-related N-acetyltransferase  26.88 
 
 
231 aa  42  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3034  GCN5-related N-acetyltransferase  26.88 
 
 
231 aa  42  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0323  GCN5-related N-acetyltransferase  25.31 
 
 
215 aa  42  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2783  GCN5-related N-acetyltransferase  25.31 
 
 
215 aa  42  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4211  GCN5-related N-acetyltransferase  30.37 
 
 
245 aa  41.6  0.008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.494469  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2207  GCN5-related N-acetyltransferase  28.36 
 
 
227 aa  41.2  0.01  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000126395  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>