36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_2508 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_2508  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 		 206 aa  423  1e-118  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0757866  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2936  GCN5-related N-acetyltransferase  93.2 
 
 		 206 aa  364  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0666782  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3440  GCN5-related N-acetyltransferase  89.37 
 
 		 207 aa  343  8e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2354  GCN5-related N-acetyltransferase  74.3 
 
 		 214 aa  323  2e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.551599 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3891  GNAT family acetyltransferase  57.89 
 
 		 207 aa  204  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.867552 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1446  GCN5-related N-acetyltransferase  49.33 
 
 		 186 aa  139  3.9999999999999997e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0368  GCN5-related N-acetyltransferase  34.24 
 
 		 242 aa  95.9  4e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3103  GCN5-related N-acetyltransferase  37.79 
 
 		 208 aa  93.6  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0866  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 		 218 aa  75.5  0.0000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2674  GCN5-related N-acetyltransferase  34.36 
 
 		 197 aa  68.6  0.00000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0897177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4095  GCN5-related N-acetyltransferase  34.62 
 
 		 163 aa  61.6  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.608016 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0891  GCN5-related N-acetyltransferase  31.91 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1327  GCN5-related N-acetyltransferase  30.5 
 
 		 163 aa  59.3  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0912478  normal  0.190195 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0930  GCN5-related N-acetyltransferase  34.19 
 
 		 218 aa  58.5  0.00000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2158  GCN5-related N-acetyltransferase  31.82 
 
 		 191 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.447718 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0631  GCN5-related N-acetyltransferase  29.2 
 
 		 160 aa  48.1  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.947121  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4764  GCN5-related N-acetyltransferase  29.53 
 
 		 242 aa  46.2  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0977317  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0522  GCN5-related N-acetyltransferase  28.86 
 
 		 225 aa  45.8  0.0005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0134212 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0538  GCN5-related N-acetyltransferase  28.86 
 
 		 210 aa  45.8  0.0005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2131  CoA-binding domain protein  33.33 
 
 		 904 aa  45.8  0.0005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.131154  normal  0.594511 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19270  sortase-like acyltransferase  29.61 
 
 		 160 aa  44.3  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.426501  normal  0.456867 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1986  GCN5-related N-acetyltransferase  30.22 
 
 		 345 aa  44.3  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.583564  normal  0.569103 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0890  CoA-binding domain protein  28.08 
 
 		 915 aa  43.5  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6022  hypothetical protein  27.85 
 
 		 344 aa  43.5  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0534003  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0554  GCN5-related N-acetyltransferase  26.71 
 
 		 233 aa  43.1  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1270  GCN5-related N-acetyltransferase  30.46 
 
 		 223 aa  43.1  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.748246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3493  GCN5-related N-acetyltransferase  26.8 
 
 		 882 aa  43.1  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0438  GCN5-related N-acetyltransferase  29.41 
 
 		 275 aa  42.7  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.576633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5102  GCN5-related N-acetyltransferase  31.86 
 
 		 332 aa  42.4  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0705936  normal  0.638402 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0038  GCN5-related N-acetyltransferase  25.93 
 
 		 218 aa  42  0.006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000011752  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4370  cyclic nucleotide-binding protein  31.33 
 
 		 332 aa  42  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.518531  normal  0.153807 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2102  GCN5-related N-acetyltransferase  27.27 
 
 		 194 aa  42  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0909168  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4284  cyclic nucleotide-binding protein  31.33 
 
 		 332 aa  42  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4663  cyclic nucleotide-binding protein  31.33 
 
 		 332 aa  41.6  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3337  GCN5-related N-acetyltransferase  26.42 
 
 		 882 aa  41.6  0.009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3098  hypothetical protein  26.17 
 
 		 231 aa  41.2  0.01  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>