89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A3158 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A3158  hypothetical protein  100 
 
 
242 aa  488  1e-137  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0104373 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4211  GCN5-related N-acetyltransferase  63.27 
 
 
245 aa  249  3e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.494469  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0554  GCN5-related N-acetyltransferase  52.48 
 
 
233 aa  243  1.9999999999999999e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0438  GCN5-related N-acetyltransferase  61.73 
 
 
275 aa  241  7.999999999999999e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.576633  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0522  GCN5-related N-acetyltransferase  56.81 
 
 
225 aa  236  2e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0134212 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0538  GCN5-related N-acetyltransferase  60.2 
 
 
210 aa  236  3e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1270  GCN5-related N-acetyltransferase  53.74 
 
 
223 aa  232  4.0000000000000004e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.748246  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4187  GCN5-related N-acetyltransferase  56.36 
 
 
222 aa  231  1e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4764  GCN5-related N-acetyltransferase  60.1 
 
 
242 aa  224  1e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0977317  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2138  GCN5-related N-acetyltransferase  56.12 
 
 
205 aa  223  2e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.310704  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3699  GCN5-related N-acetyltransferase  54.85 
 
 
246 aa  212  3.9999999999999995e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0288  GCN5-related N-acetyltransferase  41.1 
 
 
224 aa  157  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.603484 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3098  hypothetical protein  45.6 
 
 
231 aa  157  2e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3381  GCN5-related N-acetyltransferase  45.6 
 
 
231 aa  157  2e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3034  GCN5-related N-acetyltransferase  45.6 
 
 
231 aa  157  2e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3669  GCN5-related N-acetyltransferase  40.64 
 
 
222 aa  154  9e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00406711  hitchhiker  0.0000000686712 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0038  GCN5-related N-acetyltransferase  41.67 
 
 
218 aa  150  2e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000011752  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3215  GCN5-related N-acetyltransferase  41.99 
 
 
232 aa  149  4e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2864  GCN5-related N-acetyltransferase  42.31 
 
 
221 aa  149  5e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000583305 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0005  acetyltransferase  39.58 
 
 
215 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0625007  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3118  acetyltransferase  39.58 
 
 
215 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.515092  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3530  acetyltransferase  39.58 
 
 
215 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1977  acetyltransferase  39.58 
 
 
215 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3782  acetyltransferase  39.58 
 
 
215 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3843  acetyltransferase  39.58 
 
 
215 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2580  acetyltransferase  39.58 
 
 
255 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0251  GCN5-related N-acetyltransferase  39.06 
 
 
211 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00144253 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0303  GCN5-related N-acetyltransferase  39.58 
 
 
215 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.518598  hitchhiker  0.000134337 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0242  GCN5-related N-acetyltransferase  38.54 
 
 
215 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0014  acetyltransferase  39.58 
 
 
255 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3104  acetyltransferase  40.1 
 
 
215 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0225  GCN5-related N-acetyltransferase  41.21 
 
 
215 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.233449  hitchhiker  0.0000188583 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3422  GCN5-related N-acetyltransferase  39.58 
 
 
215 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3378  GCN5-related N-acetyltransferase  40.88 
 
 
245 aa  146  4.0000000000000006e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0034  GCN5-related N-acetyltransferase  42.37 
 
 
195 aa  144  1e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000614115  hitchhiker  0.0000000330992 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2783  GCN5-related N-acetyltransferase  39.06 
 
 
215 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0323  GCN5-related N-acetyltransferase  39.06 
 
 
215 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2843  GCN5-related N-acetyltransferase  38.31 
 
 
171 aa  88.2  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.038853  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3103  GCN5-related N-acetyltransferase  34.23 
 
 
208 aa  59.7  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0368  GCN5-related N-acetyltransferase  28.89 
 
 
242 aa  58.5  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2206  acetyltransferase  30.5 
 
 
836 aa  55.1  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0254612  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0404  acetyltransferase  31.08 
 
 
787 aa  53.1  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.121441  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0367  acetyltransferase  31.08 
 
 
787 aa  53.1  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00347204  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2882  acetyltransferase  31.08 
 
 
803 aa  53.1  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2999  acetyltransferase  31.08 
 
 
803 aa  53.1  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000057298  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1742  acetyltransferase  31.08 
 
 
803 aa  53.1  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00130768  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1554  acetyltransferase  31.08 
 
 
803 aa  53.1  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00991343  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1237  acetyltransferase  31.08 
 
 
1024 aa  53.1  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000574609  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4849  GCN5-related N-acetyltransferase  28.86 
 
 
813 aa  51.6  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5396  GCN5-related N-acetyltransferase  28.86 
 
 
785 aa  51.6  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.916817  normal  0.647823 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1205  CoA-binding  27.22 
 
 
903 aa  50.8  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.370285  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3280  GCN5-related N-acetyltransferase  32.56 
 
 
846 aa  49.7  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0316376 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5525  GCN5-related N-acetyltransferase  28.8 
 
 
806 aa  48.5  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5336  GCN5-related N-acetyltransferase  28.8 
 
 
785 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1446  GCN5-related N-acetyltransferase  29.49 
 
 
186 aa  47.8  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1742  GCN5-related N-acetyltransferase  26.28 
 
 
903 aa  47.4  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0134  GCN5-related N-acetyltransferase  28.8 
 
 
785 aa  47.4  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4747  GCN5-related N-acetyltransferase  28 
 
 
785 aa  47  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2463  GCN5-related N-acetyltransferase  29.14 
 
 
189 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0279306  normal  0.590012 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1411  GCN5-related N-acetyltransferase  26.28 
 
 
147 aa  44.7  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000201819  hitchhiker  0.000645315 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6923  GCN5-related N-acetyltransferase  31.5 
 
 
834 aa  44.3  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.297711 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7135  hypothetical protein  33.83 
 
 
183 aa  44.3  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.12543  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0252  GCN5-related N-acetyltransferase  24.83 
 
 
882 aa  44.3  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0975681  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27480  acyl-CoA synthetase (NDP forming)  29.75 
 
 
926 aa  43.9  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2354  GCN5-related N-acetyltransferase  28.21 
 
 
214 aa  43.5  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.551599 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1628  CoA-binding domain protein  35.62 
 
 
821 aa  43.5  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00866172  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3716  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  26.13 
 
 
151 aa  43.5  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0086441  hitchhiker  0.00862742 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2674  GCN5-related N-acetyltransferase  28.74 
 
 
197 aa  43.5  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0897177  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1570  GCN5-related N-acetyltransferase  30.54 
 
 
177 aa  43.1  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.763005 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2948  CoA-binding domain-containing protein  29.55 
 
 
899 aa  43.1  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.574552  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3787  GCN5-related N-acetyltransferase  31.45 
 
 
893 aa  43.1  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.152255  normal  0.584702 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3341  GCN5-related N-acetyltransferase  28.08 
 
 
187 aa  43.1  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3232  acetyltransferase  27.81 
 
 
189 aa  42.7  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0400  GCN5-related N-acetyltransferase  33.8 
 
 
898 aa  42.7  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.249053  normal  0.200769 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02664  hypothetical protein  28.24 
 
 
234 aa  42.7  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2967  GNAT family acetyltransferase  28.79 
 
 
809 aa  42.7  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2502  GCN5-related N-acetyltransferase  27.48 
 
 
915 aa  42.4  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0866  GCN5-related N-acetyltransferase  29.79 
 
 
218 aa  42.7  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1776  GCN5-related N-acetyltransferase  27.66 
 
 
898 aa  42.4  0.006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.634734 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3026  GCN5-related N-acetyltransferase  27.15 
 
 
189 aa  42.7  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.150578  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3208  acetyltransferase  26.22 
 
 
911 aa  42.4  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2596  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  29.27 
 
 
149 aa  42.4  0.007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0178817  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07490  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  39.22 
 
 
175 aa  42.4  0.007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.106277  normal  0.121236 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2158  GCN5-related N-acetyltransferase  29.94 
 
 
191 aa  42.4  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.447718 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2271  GCN5-related N-acetyltransferase  30.07 
 
 
178 aa  42.4  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13180  acyl-CoA synthetase (NDP forming)  30.56 
 
 
909 aa  42  0.008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.135541  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4289  GCN5-related N-acetyltransferase  37.29 
 
 
807 aa  42  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2131  CoA-binding domain protein  26.45 
 
 
904 aa  42  0.009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.131154  normal  0.594511 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1662  polyprenyl synthetase  29.23 
 
 
165 aa  42  0.01  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00255661  unclonable  0.000000000000112216 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>