198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2035 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_2035  hypothetical protein  100 
 
 
215 aa  422  1e-117  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.128169 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11017  hypothetical protein  33.33 
 
 
333 aa  80.1  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.210732  normal  0.341372 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2041  CoA-binding domain protein  34.27 
 
 
895 aa  74.3  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.171993  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1087  GCN5-related N-acetyltransferase  29.52 
 
 
169 aa  73.9  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6906  GCN5-related N-acetyltransferase  30.97 
 
 
175 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1676  GCN5-related N-acetyltransferase  31.29 
 
 
889 aa  73.6  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4284  cyclic nucleotide-binding protein  28.66 
 
 
332 aa  73.2  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4370  cyclic nucleotide-binding protein  28.66 
 
 
332 aa  73.2  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.518531  normal  0.153807 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4663  cyclic nucleotide-binding protein  28.66 
 
 
332 aa  72.8  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3299  CoA-binding domain protein  35.29 
 
 
976 aa  71.6  0.000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4818  cyclic nucleotide-binding protein  29.27 
 
 
332 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0931859  normal  0.928656 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2128  hypothetical protein  33.89 
 
 
907 aa  70.1  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.505771  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1469  CoA-binding domain protein  32.19 
 
 
902 aa  70.5  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2087  GCN5-related N-acetyltransferase  30.72 
 
 
187 aa  70.1  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.738524  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2420  acetyltransferase  28.74 
 
 
892 aa  70.1  0.00000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.773408  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2207  GCN5-related N-acetyltransferase  35.17 
 
 
227 aa  68.9  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000126395  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1423  CoA-binding domain-containing protein  32.65 
 
 
909 aa  68.9  0.00000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.382585  hitchhiker  0.0000471677 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1804  N-acetyltransferase  29.26 
 
 
913 aa  68.9  0.00000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2352  GCN5-related N-acetyltransferase  29.61 
 
 
892 aa  68.6  0.00000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1628  CoA-binding domain protein  34.97 
 
 
821 aa  68.6  0.00000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00866172  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2710  GCN5-related N-acetyltransferase  31.29 
 
 
175 aa  67.8  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.297237  hitchhiker  0.000129512 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2617  GCN5-related N-acetyltransferase  32.76 
 
 
197 aa  67.4  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.767416  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0540  GCN5-related N-acetyltransferase  31.17 
 
 
895 aa  68.2  0.0000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1462  GCN5-related N-acetyltransferase  32.65 
 
 
868 aa  67.8  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.277001  normal  0.28701 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2988  GCN5-related N-acetyltransferase  31.37 
 
 
187 aa  68.2  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.757729  normal  0.754041 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6022  hypothetical protein  31.33 
 
 
344 aa  65.5  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0534003  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0400  GCN5-related N-acetyltransferase  31.37 
 
 
898 aa  65.1  0.0000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.249053  normal  0.200769 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1986  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
345 aa  64.7  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.583564  normal  0.569103 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0056  GCN5-related N-acetyltransferase  28.85 
 
 
896 aa  64.7  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.145927 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2237  CoA-binding domain protein  30.65 
 
 
950 aa  64.3  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0315579  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3026  GCN5-related N-acetyltransferase  30.41 
 
 
189 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.150578  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1915  cyclic nucleotide-binding protein  27.95 
 
 
329 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.379435  normal  0.183424 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27480  acyl-CoA synthetase (NDP forming)  33.16 
 
 
926 aa  63.9  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3997  GCN5-related N-acetyltransferase  31.51 
 
 
193 aa  63.2  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0143681  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0086  acetyl-CoA hydrolase/transferase  24.68 
 
 
636 aa  62.8  0.000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2271  GCN5-related N-acetyltransferase  31.03 
 
 
178 aa  62.4  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7760  putative Acetyl-CoA synthetase  28.29 
 
 
903 aa  62.4  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0734608  normal  0.0277308 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0837  GCN5-related N-acetyltransferase  25.85 
 
 
176 aa  62.4  0.000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00901347  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1501  CoA-binding domain protein  31.29 
 
 
886 aa  62  0.000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.137638  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1772  GCN5-related N-acetyltransferase  33.78 
 
 
188 aa  62  0.000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0639273  normal  0.595385 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1011  acyl-CoA synthetase (ADP forming)  28.29 
 
 
918 aa  62  0.000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.415353  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2131  CoA-binding domain protein  30.41 
 
 
904 aa  61.6  0.000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.131154  normal  0.594511 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5313  GCN5-related N-acetyltransferase  31.91 
 
 
900 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.653204  normal  0.891732 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2024  long-chain fatty-acid-CoA ligase  31.76 
 
 
892 aa  60.5  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14440  acyl-CoA synthetase (NDP forming)  29.89 
 
 
908 aa  60.5  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.268462  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05787  hypothetical protein  26.39 
 
 
877 aa  60.5  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000156  protein acetyltransferase  26.39 
 
 
877 aa  59.7  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.775567  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1513  putative acetyl-CoA synthetase  31.58 
 
 
892 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.417267  normal  0.191357 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1718  CoA-binding domain protein  27.95 
 
 
901 aa  59.7  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1570  GCN5-related N-acetyltransferase  32.21 
 
 
177 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.763005 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3337  GCN5-related N-acetyltransferase  28.47 
 
 
882 aa  59.3  0.00000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7067  Acyl-CoA synthetase (NDP forming)-like protein  31.71 
 
 
881 aa  59.3  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3063  acetyltransferase  29.14 
 
 
897 aa  58.9  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1371  GCN5-related N-acetyltransferase  26.85 
 
 
907 aa  58.5  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.870954  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2544  CoA-binding protein  28.21 
 
 
911 aa  58.5  0.00000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.163603  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0885  GCN5-related N-acetyltransferase  26.97 
 
 
887 aa  58.5  0.00000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2718  GCN5-related N-acetyltransferase:CoA-binding  28.21 
 
 
905 aa  57.8  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0140591 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3962  GCN5-related N-acetyltransferase  30 
 
 
192 aa  58.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00434349  normal  0.0285152 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1904  CoA-binding  28.57 
 
 
915 aa  57.8  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3848  GCN5-related N-acetyltransferase  30 
 
 
192 aa  58.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000121275  normal  0.760581 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1694  GCN5-related N-acetyltransferase  29.71 
 
 
926 aa  57  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.133796  normal  0.55865 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1832  GCN5-related N-acetyltransferase  27.63 
 
 
901 aa  57.4  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.52555  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1833  CoA-binding domain protein  27.33 
 
 
903 aa  56.6  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.415665  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4246  GCN5-related N-acetyltransferase  29.94 
 
 
904 aa  57  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3502  GCN5-related N-acetyltransferase  33.09 
 
 
872 aa  57  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.667038  normal  0.35114 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1037  GCN5-related N-acetyltransferase  24.03 
 
 
887 aa  57.4  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.737751  normal  0.467815 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1436  GCN5-related N-acetyltransferase  29.17 
 
 
179 aa  57  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.068223 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2023  GCN5-related N-acetyltransferase  27.63 
 
 
908 aa  57.4  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0872701  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1776  GCN5-related N-acetyltransferase  29.05 
 
 
898 aa  57.4  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.634734 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0252  GCN5-related N-acetyltransferase  26.14 
 
 
882 aa  57  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0975681  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7135  hypothetical protein  33.6 
 
 
183 aa  57  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.12543  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0205  GCN5-related N-acetyltransferase  28.92 
 
 
172 aa  57  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3493  GCN5-related N-acetyltransferase  29.5 
 
 
882 aa  56.2  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1919  GCN5-related N-acetyltransferase  28.19 
 
 
897 aa  56.6  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5753  hypothetical protein  26.49 
 
 
897 aa  56.2  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3787  GCN5-related N-acetyltransferase  32.52 
 
 
893 aa  56.6  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.152255  normal  0.584702 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1548  CoA-binding domain protein  30.06 
 
 
899 aa  56.2  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.25767  normal  0.134976 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1351  GCN5-related N-acetyltransferase  27.21 
 
 
907 aa  56.2  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1969  CoA-binding domain-containing protein  30.53 
 
 
893 aa  56.2  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0683536  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1862  CoA-binding domain protein  27.7 
 
 
900 aa  55.8  0.0000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.167225  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05540  hypothetical protein  33.1 
 
 
199 aa  55.8  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00436113  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02893  acetyltransferase, gnat family  28.47 
 
 
902 aa  55.8  0.0000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2948  CoA-binding domain-containing protein  30.88 
 
 
899 aa  55.8  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.574552  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4771  GCN5-related N-acetyltransferase  30.22 
 
 
900 aa  55.8  0.0000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2819  GCN5-related N-acetyltransferase  27.63 
 
 
897 aa  55.8  0.0000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.869939 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5238  GCN5-related N-acetyltransferase  30.22 
 
 
900 aa  55.8  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.365104 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1784  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  32.21 
 
 
929 aa  55.8  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0051  GCN5-related N-acetyltransferase  28.08 
 
 
173 aa  55.5  0.0000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4719  GCN5-related N-acetyltransferase  26.85 
 
 
907 aa  55.1  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.345229  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0517  hypothetical protein  23.18 
 
 
893 aa  55.1  0.0000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0144  GCN5-related N-acetyltransferase  29.14 
 
 
852 aa  55.1  0.0000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2384  CoA-binding domain-containing protein  33.33 
 
 
887 aa  55.1  0.0000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.272058 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1293  GCN5-related N-acetyltransferase  28.08 
 
 
173 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3083  GCN5-related N-acetyltransferase  31.94 
 
 
192 aa  54.7  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.458832  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4256  GCN5-related N-acetyltransferase  28.86 
 
 
173 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.330329  normal  0.825884 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1742  GCN5-related N-acetyltransferase  27.27 
 
 
903 aa  54.3  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4045  GCN5-related N-acetyltransferase  26.53 
 
 
899 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.565149  normal  0.994893 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2102  GCN5-related N-acetyltransferase  24.16 
 
 
194 aa  54.3  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0909168  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0890  CoA-binding domain protein  28.1 
 
 
915 aa  53.9  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1446  GCN5-related N-acetyltransferase  31.61 
 
 
207 aa  53.5  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.239362  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>