183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7135 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_7135  hypothetical protein  100 
 
 
183 aa  368  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.12543  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2718  GCN5-related N-acetyltransferase:CoA-binding  35.76 
 
 
905 aa  95.9  3e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0140591 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2024  long-chain fatty-acid-CoA ligase  36.36 
 
 
892 aa  95.9  3e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3063  acetyltransferase  36.36 
 
 
897 aa  94.7  6e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1501  CoA-binding domain protein  37.18 
 
 
886 aa  88.6  4e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.137638  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1676  GCN5-related N-acetyltransferase  32.47 
 
 
889 aa  88.2  5e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2710  GCN5-related N-acetyltransferase  34.72 
 
 
175 aa  87  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.297237  hitchhiker  0.000129512 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2352  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
892 aa  85.9  3e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2819  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
897 aa  85.5  4e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.869939 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2041  CoA-binding domain protein  30.61 
 
 
895 aa  85.5  4e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.171993  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1862  CoA-binding domain protein  33.76 
 
 
900 aa  82  0.000000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.167225  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3164  GCN5-related N-acetyltransferase  35.22 
 
 
812 aa  81.6  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1513  putative acetyl-CoA synthetase  33.13 
 
 
892 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.417267  normal  0.191357 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0540  GCN5-related N-acetyltransferase  31.17 
 
 
895 aa  80.5  0.00000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3232  acetyltransferase  33.78 
 
 
189 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2463  GCN5-related N-acetyltransferase  33.78 
 
 
189 aa  79.3  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0279306  normal  0.590012 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2023  GCN5-related N-acetyltransferase  32.03 
 
 
908 aa  77.4  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0872701  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1832  GCN5-related N-acetyltransferase  32.03 
 
 
901 aa  77.4  0.0000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.52555  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3026  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
189 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.150578  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2420  acetyltransferase  31.08 
 
 
892 aa  76.3  0.0000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.773408  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1446  GCN5-related N-acetyltransferase  35.17 
 
 
207 aa  75.9  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.239362  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1011  acyl-CoA synthetase (ADP forming)  33.33 
 
 
918 aa  75.1  0.0000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.415353  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1772  GCN5-related N-acetyltransferase  31.97 
 
 
188 aa  75.1  0.0000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0639273  normal  0.595385 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4246  GCN5-related N-acetyltransferase  32.03 
 
 
904 aa  75.1  0.0000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16050  acyl-CoA synthetase (NDP forming)  33.56 
 
 
934 aa  73.2  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.243356 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3848  GCN5-related N-acetyltransferase  35.33 
 
 
192 aa  72.4  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000121275  normal  0.760581 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3962  GCN5-related N-acetyltransferase  35.33 
 
 
192 aa  72.4  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00434349  normal  0.0285152 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0837  GCN5-related N-acetyltransferase  29.58 
 
 
176 aa  72.8  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00901347  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1469  CoA-binding domain protein  31.08 
 
 
902 aa  71.6  0.000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0056  GCN5-related N-acetyltransferase  30.07 
 
 
896 aa  71.2  0.000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.145927 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1932  GCN5-related N-acetyltransferase  34.46 
 
 
907 aa  70.9  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.56977  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2384  CoA-binding domain-containing protein  32.41 
 
 
887 aa  70.5  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.272058 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0639  GCN5-related N-acetyltransferase  29.66 
 
 
810 aa  70.5  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00627705 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3997  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
193 aa  70.1  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0143681  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05540  hypothetical protein  35.9 
 
 
199 aa  68.2  0.00000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00436113  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1548  CoA-binding domain protein  34.21 
 
 
899 aa  68.6  0.00000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.25767  normal  0.134976 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1205  CoA-binding  30.72 
 
 
903 aa  67.8  0.00000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.370285  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2128  hypothetical protein  31.43 
 
 
907 aa  66.6  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.505771  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27480  acyl-CoA synthetase (NDP forming)  33.1 
 
 
926 aa  66.6  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72260  hypothetical protein  32.09 
 
 
186 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14440  acyl-CoA synthetase (NDP forming)  32 
 
 
908 aa  66.2  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.268462  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6272  hypothetical protein  32.09 
 
 
186 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2237  CoA-binding domain protein  29.79 
 
 
950 aa  65.9  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0315579  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4857  GCN5-related N-acetyltransferase  33.1 
 
 
201 aa  64.7  0.0000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4045  GCN5-related N-acetyltransferase  28.67 
 
 
899 aa  64.3  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.565149  normal  0.994893 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3341  GCN5-related N-acetyltransferase  32.19 
 
 
187 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1293  GCN5-related N-acetyltransferase  30 
 
 
173 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3299  CoA-binding domain protein  32.14 
 
 
976 aa  64.3  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3083  GCN5-related N-acetyltransferase  31.88 
 
 
192 aa  64.3  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.458832  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4256  GCN5-related N-acetyltransferase  27.86 
 
 
173 aa  63.9  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.330329  normal  0.825884 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2271  GCN5-related N-acetyltransferase  30.71 
 
 
178 aa  63.9  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02893  acetyltransferase, gnat family  29.05 
 
 
902 aa  63.2  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2228  GCN5-related N-acetyltransferase  30.34 
 
 
893 aa  62.8  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.00661786  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0051  GCN5-related N-acetyltransferase  29.29 
 
 
173 aa  62.4  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4815  GCN5-related N-acetyltransferase  31.46 
 
 
201 aa  62.4  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.342854  normal  0.884231 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0086  acetyl-CoA hydrolase/transferase  25 
 
 
636 aa  61.6  0.000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3902  GCN5-related N-acetyltransferase  29.73 
 
 
906 aa  61.2  0.000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.835064  normal  0.701113 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15880  acyl-CoA synthetase (NDP forming)  31.43 
 
 
831 aa  61.2  0.000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00274098  normal  0.158003 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1436  GCN5-related N-acetyltransferase  31.86 
 
 
179 aa  60.5  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.068223 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2087  GCN5-related N-acetyltransferase  27.7 
 
 
187 aa  60.8  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.738524  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2102  GCN5-related N-acetyltransferase  27.4 
 
 
194 aa  60.1  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0909168  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6906  GCN5-related N-acetyltransferase  28.97 
 
 
175 aa  59.7  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0517  hypothetical protein  22.97 
 
 
893 aa  60.1  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1423  CoA-binding domain-containing protein  30 
 
 
909 aa  59.7  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.382585  hitchhiker  0.0000471677 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0861  GCN5-related N-acetyltransferase  30.5 
 
 
173 aa  59.3  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1694  GCN5-related N-acetyltransferase  30.97 
 
 
926 aa  59.3  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.133796  normal  0.55865 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1628  CoA-binding domain protein  31.16 
 
 
821 aa  58.9  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00866172  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1929  GCN5-related protein N-acetyltransferase  32 
 
 
907 aa  58.5  0.00000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.191743 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2948  CoA-binding domain-containing protein  30.22 
 
 
899 aa  57.8  0.00000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.574552  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7067  Acyl-CoA synthetase (NDP forming)-like protein  30.5 
 
 
881 aa  57.4  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1570  GCN5-related N-acetyltransferase  31.21 
 
 
177 aa  57  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.763005 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1416  GCN5-related N-acetyltransferase  29.53 
 
 
909 aa  57.4  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.953678  normal  0.831405 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0252  GCN5-related N-acetyltransferase  26.71 
 
 
882 aa  57  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0975681  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2142  GCN5-related N-acetyltransferase:Acetyl-CoA hydrolase/transferase  26.8 
 
 
617 aa  56.6  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2035  hypothetical protein  33.6 
 
 
215 aa  57  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.128169 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2131  CoA-binding domain protein  26.22 
 
 
904 aa  55.8  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.131154  normal  0.594511 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1278  acetyl-CoA hydrolase/transferase  23.29 
 
 
634 aa  55.8  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.863753  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1462  GCN5-related N-acetyltransferase  29.29 
 
 
868 aa  55.8  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.277001  normal  0.28701 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000156  protein acetyltransferase  24.64 
 
 
877 aa  55.8  0.0000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.775567  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1833  CoA-binding domain protein  27.78 
 
 
903 aa  54.7  0.0000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.415665  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1628  GCN5-related N-acetyltransferase  28.28 
 
 
901 aa  53.5  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.321665  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0885  GCN5-related N-acetyltransferase  24.31 
 
 
887 aa  54.3  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1622  CoA-binding domain protein  28.28 
 
 
894 aa  53.5  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000156668 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0641  putative acetyltransferase  26.09 
 
 
894 aa  53.1  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0517874  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3564  CoA-binding domain protein  27.54 
 
 
902 aa  53.5  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.695831  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5313  GCN5-related N-acetyltransferase  27.63 
 
 
900 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.653204  normal  0.891732 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3280  GCN5-related N-acetyltransferase  25.71 
 
 
846 aa  53.5  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0316376 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0367  acetyltransferase  24.65 
 
 
787 aa  52.4  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00347204  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4289  GCN5-related N-acetyltransferase  25 
 
 
807 aa  52.8  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0400  GCN5-related N-acetyltransferase  27.45 
 
 
898 aa  52.4  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.249053  normal  0.200769 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1554  acetyltransferase  24.65 
 
 
803 aa  52.4  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00991343  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1742  acetyltransferase  24.65 
 
 
803 aa  52.4  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00130768  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2999  acetyltransferase  24.65 
 
 
803 aa  52.4  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000057298  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2882  acetyltransferase  24.65 
 
 
803 aa  52.4  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0404  acetyltransferase  24.65 
 
 
787 aa  52.4  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.121441  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2988  GCN5-related N-acetyltransferase  28.08 
 
 
187 aa  52.8  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.757729  normal  0.754041 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04744  N-acetyltransferase family protein  30.46 
 
 
180 aa  52.8  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1742  GCN5-related N-acetyltransferase  27.52 
 
 
903 aa  52.8  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1237  acetyltransferase  24.65 
 
 
1024 aa  52.4  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000574609  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0556  GCN5-related N-acetyltransferase  32.26 
 
 
177 aa  52.4  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000991626 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>