262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_3232 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3232  acetyltransferase  100 
 
 		 189 aa  391  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2463  GCN5-related N-acetyltransferase  97.35 
 
 		 189 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0279306  normal  0.590012 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3026  GCN5-related N-acetyltransferase  80.32 
 
 		 189 aa  318  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.150578  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3341  GCN5-related N-acetyltransferase  61.71 
 
 		 187 aa  224  6e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6272  hypothetical protein  57.63 
 
 		 186 aa  205  3e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72260  hypothetical protein  57.63 
 
 		 186 aa  205  3e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2469  GCN5-related N-acetyltransferase  48.81 
 
 		 182 aa  166  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.298594  normal  0.469762 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3289  acetyltransferase  48.81 
 
 		 182 aa  164  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.252345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3030  GCN5-related N-acetyltransferase  46.82 
 
 		 182 aa  158  5e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.712566  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2041  CoA-binding domain protein  39.43 
 
 		 895 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.171993  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2102  GCN5-related N-acetyltransferase  37.65 
 
 		 194 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0909168  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1663  acetyltransferase, GNAT family  38.6 
 
 		 189 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.146581  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2710  GCN5-related N-acetyltransferase  38.46 
 
 		 175 aa  119  3.9999999999999996e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.297237  hitchhiker  0.000129512 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2024  long-chain fatty-acid-CoA ligase  36.99 
 
 		 892 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1862  CoA-binding domain protein  38.22 
 
 		 900 aa  114  7.999999999999999e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.167225  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3063  acetyltransferase  35.16 
 
 		 897 aa  108  5e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2819  GCN5-related N-acetyltransferase  34.48 
 
 		 897 aa  107  1e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.869939 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3164  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 		 812 aa  106  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2352  GCN5-related N-acetyltransferase  34.1 
 
 		 892 aa  105  5e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2718  GCN5-related N-acetyltransferase:CoA-binding  35.43 
 
 		 905 aa  103  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0140591 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3997  GCN5-related N-acetyltransferase  37.58 
 
 		 193 aa  102  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0143681  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1011  acyl-CoA synthetase (ADP forming)  33.91 
 
 		 918 aa  102  4e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.415353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1832  GCN5-related N-acetyltransferase  33.88 
 
 		 901 aa  100  8e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.52555  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2023  GCN5-related N-acetyltransferase  33.88 
 
 		 908 aa  100  9e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0872701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1513  putative acetyl-CoA synthetase  34.86 
 
 		 892 aa  97.8  9e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.417267  normal  0.191357 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0975  GCN5-related N-acetyltransferase  36.49 
 
 		 517 aa  97.4  9e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.021927  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1772  GCN5-related N-acetyltransferase  33.51 
 
 		 188 aa  97.1  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0639273  normal  0.595385 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3337  GCN5-related N-acetyltransferase  34.72 
 
 		 882 aa  96.3  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1676  GCN5-related N-acetyltransferase  32.93 
 
 		 889 aa  95.9  3e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0056  GCN5-related N-acetyltransferase  33.71 
 
 		 896 aa  95.9  3e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.145927 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0400  GCN5-related N-acetyltransferase  32.12 
 
 		 898 aa  95.5  4e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.249053  normal  0.200769 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0639  GCN5-related N-acetyltransferase  31.79 
 
 		 810 aa  95.1  5e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00627705 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2228  GCN5-related N-acetyltransferase  33.51 
 
 		 893 aa  95.1  6e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.00661786  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4246  GCN5-related N-acetyltransferase  31.61 
 
 		 904 aa  94.4  9e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1776  GCN5-related N-acetyltransferase  31.17 
 
 		 898 aa  93.6  1e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.634734 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3208  acetyltransferase  33.33 
 
 		 911 aa  93.2  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2420  acetyltransferase  30.54 
 
 		 892 aa  92.8  3e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.773408  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1501  CoA-binding domain protein  34.44 
 
 		 886 aa  90.9  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.137638  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3493  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 		 882 aa  90.1  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3069  GCN5-related N-acetyltransferase  31.58 
 
 		 887 aa  89.4  3e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.835722  hitchhiker  0.00746938 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02478  fused predicted acyl-CoA synthetase: NAD(P)-binding subunit/ATP-binding subunit  30.26 
 
 		 886 aa  88.2  6e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1084  GCN5-related N-acetyltransferase  30.26 
 
 		 886 aa  88.2  6e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2952  acetyltransferase, GNAT family protein  30.26 
 
 		 886 aa  88.2  6e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.487518  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2871  CoA-binding domain/acetyltransferase domain-containing protein  30.26 
 
 		 886 aa  88.2  6e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.288181  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1093  GCN5-related N-acetyltransferase  30.26 
 
 		 886 aa  88.2  6e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.312736  normal  0.038329 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2741  CoA-binding domain/acetyltransferase domain-containing protein  30.26 
 
 		 886 aa  88.2  6e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.225885  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3821  acetyltransferase, GNAT family protein  30.26 
 
 		 886 aa  88.6  6e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.126569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2737  CoA-binding domain/acetyltransferase domain-containing protein  30.26 
 
 		 886 aa  88.2  6e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.028573  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02442  hypothetical protein  30.26 
 
 		 886 aa  88.2  6e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0540  GCN5-related N-acetyltransferase  32.24 
 
 		 895 aa  88.2  6e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4771  GCN5-related N-acetyltransferase  33.85 
 
 		 900 aa  86.7  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1436  GCN5-related N-acetyltransferase  31.72 
 
 		 179 aa  86.3  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.068223 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2502  GCN5-related N-acetyltransferase  33.12 
 
 		 915 aa  86.3  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2065  hypothetical protein  34.59 
 
 		 897 aa  86.3  3e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.354982 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5238  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 		 900 aa  85.5  4e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.365104 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4289  GCN5-related N-acetyltransferase  31.25 
 
 		 807 aa  85.1  5e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2761  CoA binding domain/acetyltransferase domain protein  29.49 
 
 		 886 aa  84.7  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.282153  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2863  CoA binding domain/acetyltransferase domain protein  29.33 
 
 		 886 aa  84.7  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2979  CoA-binding domain/acetyltransferase domain-containing protein  29.33 
 
 		 886 aa  84.7  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2867  CoA binding domain/acetyltransferase domain-containing protein  29.33 
 
 		 886 aa  84.7  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2845  CoA binding domain/acetyltransferase domain protein  29.33 
 
 		 886 aa  84.7  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05787  hypothetical protein  28.85 
 
 		 877 aa  83.6  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0517  hypothetical protein  29.58 
 
 		 893 aa  84.3  0.000000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1037  GCN5-related N-acetyltransferase  30.19 
 
 		 887 aa  82.8  0.000000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.737751  normal  0.467815 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0641  putative acetyltransferase  29.03 
 
 		 894 aa  82.4  0.000000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0517874  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3962  GCN5-related N-acetyltransferase  31.87 
 
 		 192 aa  82  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00434349  normal  0.0285152 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3848  GCN5-related N-acetyltransferase  31.87 
 
 		 192 aa  82  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000121275  normal  0.760581 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5733  GCN5-related N-acetyltransferase  30 
 
 		 172 aa  81.6  0.000000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.498676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2544  CoA-binding protein  28.99 
 
 		 911 aa  80.5  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.163603  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0885  GCN5-related N-acetyltransferase  31.25 
 
 		 887 aa  80.5  0.00000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7135  hypothetical protein  33.78 
 
 		 183 aa  79.7  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.12543  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000156  protein acetyltransferase  27.56 
 
 		 877 aa  80.1  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.775567  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0367  acetyltransferase  28.75 
 
 		 787 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00347204  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1237  acetyltransferase  28.75 
 
 		 1024 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000574609  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0404  acetyltransferase  28.75 
 
 		 787 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.121441  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2882  acetyltransferase  28.75 
 
 		 803 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1742  GCN5-related N-acetyltransferase  28.81 
 
 		 903 aa  79.3  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1554  acetyltransferase  28.75 
 
 		 803 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00991343  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1742  acetyltransferase  28.75 
 
 		 803 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00130768  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2999  acetyltransferase  28.75 
 
 		 803 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000057298  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3748  GCN5-related N-acetyltransferase  31.03 
 
 		 882 aa  79  0.00000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0223555  normal  0.236384 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5396  GCN5-related N-acetyltransferase  28.32 
 
 		 785 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.916817  normal  0.647823 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3280  GCN5-related N-acetyltransferase  28.75 
 
 		 846 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0316376 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1293  GCN5-related N-acetyltransferase  36.73 
 
 		 173 aa  78.6  0.00000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4719  GCN5-related N-acetyltransferase  28.74 
 
 		 907 aa  78.6  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.345229  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5313  GCN5-related N-acetyltransferase  30.05 
 
 		 900 aa  78.2  0.00000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.653204  normal  0.891732 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0852  GCN5-related N-acetyltransferase  30.14 
 
 		 888 aa  78.2  0.00000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.121285  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3343  GCN5-related N-acetyltransferase  28.95 
 
 		 880 aa  78.6  0.00000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0598594  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3465  putative acyl-CoA synthetase  28.95 
 
 		 880 aa  78.6  0.00000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.063853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3206  putative acyl-CoA synthetase  28.95 
 
 		 880 aa  78.6  0.00000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4849  GCN5-related N-acetyltransferase  28.32 
 
 		 813 aa  78.2  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5525  GCN5-related N-acetyltransferase  28.32 
 
 		 806 aa  77.8  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0134  GCN5-related N-acetyltransferase  28.32 
 
 		 785 aa  77.8  0.00000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1477  GCN5-related N-acetyltransferase  27.21 
 
 		 896 aa  77.8  0.00000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.630899  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5336  GCN5-related N-acetyltransferase  28.32 
 
 		 785 aa  77.8  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0890  CoA-binding domain protein  29.71 
 
 		 915 aa  77.8  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2967  GNAT family acetyltransferase  30 
 
 		 809 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6923  GCN5-related N-acetyltransferase  30 
 
 		 834 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.297711 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2131  CoA-binding domain protein  28.05 
 
 		 904 aa  76.3  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.131154  normal  0.594511 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6906  GCN5-related N-acetyltransferase  34.16 
 
 		 175 aa  76.6  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>