244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_3289 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3289  acetyltransferase  100 
 
 		 182 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.252345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2469  GCN5-related N-acetyltransferase  98.35 
 
 		 182 aa  374  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.298594  normal  0.469762 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3030  GCN5-related N-acetyltransferase  75.69 
 
 		 182 aa  289  2e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.712566  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3026  GCN5-related N-acetyltransferase  48.82 
 
 		 189 aa  165  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.150578  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3232  acetyltransferase  48.81 
 
 		 189 aa  164  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2463  GCN5-related N-acetyltransferase  47.62 
 
 		 189 aa  160  7e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0279306  normal  0.590012 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3341  GCN5-related N-acetyltransferase  48.81 
 
 		 187 aa  157  8e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6272  hypothetical protein  49.4 
 
 		 186 aa  151  5e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72260  hypothetical protein  49.4 
 
 		 186 aa  151  5e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1663  acetyltransferase, GNAT family  40.49 
 
 		 189 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.146581  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3063  acetyltransferase  38.99 
 
 		 897 aa  118  3.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2041  CoA-binding domain protein  38.36 
 
 		 895 aa  111  7.000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.171993  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2024  long-chain fatty-acid-CoA ligase  39.6 
 
 		 892 aa  108  5e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2718  GCN5-related N-acetyltransferase:CoA-binding  36.65 
 
 		 905 aa  104  6e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0140591 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1676  GCN5-related N-acetyltransferase  37.01 
 
 		 889 aa  104  9e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2420  acetyltransferase  33.74 
 
 		 892 aa  102  4e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.773408  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2710  GCN5-related N-acetyltransferase  38.1 
 
 		 175 aa  100  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.297237  hitchhiker  0.000129512 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3208  acetyltransferase  37.8 
 
 		 911 aa  94.7  6e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1832  GCN5-related N-acetyltransferase  35.26 
 
 		 901 aa  90.9  9e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.52555  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2023  GCN5-related N-acetyltransferase  35.26 
 
 		 908 aa  90.9  9e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0872701  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1862  CoA-binding domain protein  32.43 
 
 		 900 aa  90.1  1e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.167225  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2102  GCN5-related N-acetyltransferase  28.32 
 
 		 194 aa  90.9  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0909168  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1501  CoA-binding domain protein  36.84 
 
 		 886 aa  89.4  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.137638  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0540  GCN5-related N-acetyltransferase  36.36 
 
 		 895 aa  89.4  3e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0056  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 		 896 aa  89  4e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.145927 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1011  acyl-CoA synthetase (ADP forming)  32.05 
 
 		 918 aa  88.2  6e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.415353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2819  GCN5-related N-acetyltransferase  33.72 
 
 		 897 aa  88.2  7e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.869939 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3164  GCN5-related N-acetyltransferase  33.99 
 
 		 812 aa  87  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0890  CoA-binding domain protein  34.15 
 
 		 915 aa  87.4  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3069  GCN5-related N-acetyltransferase  34.19 
 
 		 887 aa  87  1e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.835722  hitchhiker  0.00746938 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0400  GCN5-related N-acetyltransferase  35.81 
 
 		 898 aa  86.7  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.249053  normal  0.200769 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02478  fused predicted acyl-CoA synthetase: NAD(P)-binding subunit/ATP-binding subunit  33.33 
 
 		 886 aa  84.3  9e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1084  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 		 886 aa  84.3  9e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2871  CoA-binding domain/acetyltransferase domain-containing protein  33.33 
 
 		 886 aa  84.3  9e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.288181  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3821  acetyltransferase, GNAT family protein  33.33 
 
 		 886 aa  84.3  9e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.126569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2952  acetyltransferase, GNAT family protein  33.33 
 
 		 886 aa  84.3  9e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.487518  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2741  CoA-binding domain/acetyltransferase domain-containing protein  33.33 
 
 		 886 aa  84.3  9e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.225885  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2737  CoA-binding domain/acetyltransferase domain-containing protein  33.33 
 
 		 886 aa  84.3  9e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.028573  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02442  hypothetical protein  33.33 
 
 		 886 aa  84.3  9e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1093  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 		 886 aa  84.3  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.312736  normal  0.038329 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0639  GCN5-related N-acetyltransferase  30.41 
 
 		 810 aa  83.2  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00627705 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2352  GCN5-related N-acetyltransferase  32.05 
 
 		 892 aa  82.4  0.000000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2761  CoA binding domain/acetyltransferase domain protein  32.26 
 
 		 886 aa  82.4  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.282153  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2979  CoA-binding domain/acetyltransferase domain-containing protein  32.26 
 
 		 886 aa  82.4  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2845  CoA binding domain/acetyltransferase domain protein  32.26 
 
 		 886 aa  82.4  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2867  CoA binding domain/acetyltransferase domain-containing protein  32.26 
 
 		 886 aa  82.4  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2863  CoA binding domain/acetyltransferase domain protein  32.26 
 
 		 886 aa  82.4  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1804  N-acetyltransferase  34.93 
 
 		 913 aa  81.6  0.000000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0641  putative acetyltransferase  31.17 
 
 		 894 aa  81.6  0.000000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0517874  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1776  GCN5-related N-acetyltransferase  32.76 
 
 		 898 aa  80.9  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.634734 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1092  GCN5-related N-acetyltransferase  32 
 
 		 893 aa  80.9  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.20314  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1436  GCN5-related N-acetyltransferase  32.89 
 
 		 179 aa  80.1  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.068223 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1772  GCN5-related N-acetyltransferase  34.55 
 
 		 188 aa  79.7  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0639273  normal  0.595385 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1718  CoA-binding domain protein  33.54 
 
 		 901 aa  80.1  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6906  GCN5-related N-acetyltransferase  34.3 
 
 		 175 aa  79  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1477  GCN5-related N-acetyltransferase  31.45 
 
 		 896 aa  79.3  0.00000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.630899  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4289  GCN5-related N-acetyltransferase  33.11 
 
 		 807 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4246  GCN5-related N-acetyltransferase  33.97 
 
 		 904 aa  79  0.00000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0837  GCN5-related N-acetyltransferase  32.43 
 
 		 176 aa  78.6  0.00000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00901347  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5396  GCN5-related N-acetyltransferase  33.55 
 
 		 785 aa  77.8  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.916817  normal  0.647823 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5336  GCN5-related N-acetyltransferase  34.19 
 
 		 785 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4849  GCN5-related N-acetyltransferase  33.55 
 
 		 813 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5525  GCN5-related N-acetyltransferase  34.19 
 
 		 806 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0975  GCN5-related N-acetyltransferase  32.19 
 
 		 517 aa  77  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.021927  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3280  GCN5-related N-acetyltransferase  33.56 
 
 		 846 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0316376 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0134  GCN5-related N-acetyltransferase  33.55 
 
 		 785 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0619  acetyl-CoA hydrolase/transferase  28.57 
 
 		 627 aa  76.3  0.0000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4747  GCN5-related N-acetyltransferase  33.55 
 
 		 785 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3564  CoA-binding domain protein  33.94 
 
 		 902 aa  75.5  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.695831  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2131  CoA-binding domain protein  33.33 
 
 		 904 aa  75.5  0.0000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.131154  normal  0.594511 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0885  GCN5-related N-acetyltransferase  32.9 
 
 		 887 aa  75.5  0.0000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05787  hypothetical protein  32.21 
 
 		 877 aa  75.1  0.0000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1371  GCN5-related N-acetyltransferase  32.65 
 
 		 907 aa  74.7  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.870954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1513  putative acetyl-CoA synthetase  31.82 
 
 		 892 aa  74.3  0.0000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.417267  normal  0.191357 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0852  GCN5-related N-acetyltransferase  31.85 
 
 		 888 aa  74.3  0.0000000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.121285  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4664  GCN5-related N-acetyltransferase  32.69 
 
 		 918 aa  73.9  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4719  GCN5-related N-acetyltransferase  31.33 
 
 		 907 aa  73.6  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.345229  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000156  protein acetyltransferase  30.34 
 
 		 877 aa  73.6  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.775567  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1570  GCN5-related N-acetyltransferase  33.95 
 
 		 177 aa  73.2  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.763005 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3337  GCN5-related N-acetyltransferase  32.41 
 
 		 882 aa  72.8  0.000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0367  acetyltransferase  33.1 
 
 		 787 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00347204  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3997  GCN5-related N-acetyltransferase  33.56 
 
 		 193 aa  72.8  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0143681  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2967  GNAT family acetyltransferase  34.03 
 
 		 809 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2530  GCN5-related N-acetyltransferase  30.18 
 
 		 896 aa  72.4  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1554  acetyltransferase  33.1 
 
 		 803 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00991343  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1742  acetyltransferase  33.1 
 
 		 803 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00130768  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2999  acetyltransferase  33.1 
 
 		 803 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000057298  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2882  acetyltransferase  33.1 
 
 		 803 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0404  acetyltransferase  33.1 
 
 		 787 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.121441  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1237  acetyltransferase  33.1 
 
 		 1024 aa  72  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000574609  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6923  GCN5-related N-acetyltransferase  34.01 
 
 		 834 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.297711 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1311  hypothetical protein  32.88 
 
 		 886 aa  71.6  0.000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5003  CoA-binding domain protein  31.14 
 
 		 920 aa  71.6  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7067  Acyl-CoA synthetase (NDP forming)-like protein  33.15 
 
 		 881 aa  71.2  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2206  acetyltransferase  32.39 
 
 		 836 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0254612  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3493  GCN5-related N-acetyltransferase  31.03 
 
 		 882 aa  70.5  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3748  GCN5-related N-acetyltransferase  32.9 
 
 		 882 aa  70.9  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0223555  normal  0.236384 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1548  CoA-binding domain protein  32.94 
 
 		 899 aa  69.7  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.25767  normal  0.134976 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0086  acetyl-CoA hydrolase/transferase  31.25 
 
 		 636 aa  70.1  0.00000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1293  GCN5-related N-acetyltransferase  32.03 
 
 		 173 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>