217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4815 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007974  Rmet_4815  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
201 aa  404  1.0000000000000001e-112  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.342854  normal  0.884231 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4857  GCN5-related N-acetyltransferase  58.7 
 
 
201 aa  202  3e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05540  hypothetical protein  41.52 
 
 
199 aa  111  8.000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00436113  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3848  GCN5-related N-acetyltransferase  39.88 
 
 
192 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000121275  normal  0.760581 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3962  GCN5-related N-acetyltransferase  39.88 
 
 
192 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00434349  normal  0.0285152 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3063  acetyltransferase  40.38 
 
 
897 aa  101  9e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3164  GCN5-related N-acetyltransferase  38.92 
 
 
812 aa  96.3  3e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4246  GCN5-related N-acetyltransferase  34.62 
 
 
904 aa  89.4  3e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6906  GCN5-related N-acetyltransferase  36.08 
 
 
175 aa  89  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2024  long-chain fatty-acid-CoA ligase  36.75 
 
 
892 aa  88.6  6e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2420  acetyltransferase  35.54 
 
 
892 aa  87.4  1e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.773408  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2718  GCN5-related N-acetyltransferase:CoA-binding  33.71 
 
 
905 aa  86.7  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0140591 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2041  CoA-binding domain protein  36.31 
 
 
895 aa  86.7  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.171993  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2352  GCN5-related N-acetyltransferase  33.52 
 
 
892 aa  86.7  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0639  GCN5-related N-acetyltransferase  35.62 
 
 
810 aa  86.7  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00627705 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1676  GCN5-related N-acetyltransferase  33.13 
 
 
889 aa  86.3  3e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1501  CoA-binding domain protein  34.73 
 
 
886 aa  85.5  5e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.137638  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2819  GCN5-related N-acetyltransferase  34.73 
 
 
897 aa  84.3  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.869939 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1011  acyl-CoA synthetase (ADP forming)  35.23 
 
 
918 aa  84  0.000000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.415353  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1570  GCN5-related N-acetyltransferase  38.22 
 
 
177 aa  82.8  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.763005 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4272  CoA-binding domain protein  31.58 
 
 
921 aa  82  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0056  GCN5-related N-acetyltransferase  32.39 
 
 
896 aa  79.7  0.00000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.145927 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1513  putative acetyl-CoA synthetase  32 
 
 
892 aa  78.6  0.00000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.417267  normal  0.191357 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1628  CoA-binding domain protein  38.29 
 
 
821 aa  77  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00866172  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1772  GCN5-related N-acetyltransferase  28.73 
 
 
188 aa  75.1  0.0000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0639273  normal  0.595385 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2023  GCN5-related N-acetyltransferase  32.93 
 
 
908 aa  74.7  0.0000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0872701  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1832  GCN5-related N-acetyltransferase  32.93 
 
 
901 aa  74.7  0.0000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.52555  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3997  GCN5-related N-acetyltransferase  33.14 
 
 
193 aa  74.7  0.0000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0143681  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1278  acetyl-CoA hydrolase/transferase  28.8 
 
 
634 aa  74.3  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.863753  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2271  GCN5-related N-acetyltransferase  32.93 
 
 
178 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4256  GCN5-related N-acetyltransferase  34.87 
 
 
173 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.330329  normal  0.825884 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4664  GCN5-related N-acetyltransferase  31.48 
 
 
918 aa  73.6  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0540  GCN5-related N-acetyltransferase  29.94 
 
 
895 aa  72.4  0.000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1862  CoA-binding domain protein  34.03 
 
 
900 aa  70.5  0.00000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.167225  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0086  acetyl-CoA hydrolase/transferase  30.92 
 
 
636 aa  71.2  0.00000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1932  GCN5-related N-acetyltransferase  34.02 
 
 
907 aa  70.1  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.56977  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3232  acetyltransferase  31.38 
 
 
189 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0505  CoA-binding domain protein  32.61 
 
 
887 aa  68.9  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1474  GCN5-related N-acetyltransferase  30.99 
 
 
206 aa  68.9  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.195699 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0861  GCN5-related N-acetyltransferase  30.82 
 
 
173 aa  68.9  0.00000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2102  GCN5-related N-acetyltransferase  26.71 
 
 
194 aa  68.6  0.00000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0909168  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2544  CoA-binding protein  31.45 
 
 
911 aa  68.2  0.00000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.163603  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3299  CoA-binding domain protein  34.72 
 
 
976 aa  67  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2463  GCN5-related N-acetyltransferase  30.57 
 
 
189 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0279306  normal  0.590012 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4813  Acyl-CoA synthetase (NDP forming)-like protein  32.87 
 
 
883 aa  66.6  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104591  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2710  GCN5-related N-acetyltransferase  30.63 
 
 
175 aa  66.2  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.297237  hitchhiker  0.000129512 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1436  GCN5-related N-acetyltransferase  30.73 
 
 
179 aa  65.9  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.068223 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2384  CoA-binding domain-containing protein  32.37 
 
 
887 aa  65.5  0.0000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.272058 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2867  CoA binding domain/acetyltransferase domain-containing protein  29.38 
 
 
886 aa  65.5  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2863  CoA binding domain/acetyltransferase domain protein  29.38 
 
 
886 aa  65.5  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2845  CoA binding domain/acetyltransferase domain protein  29.38 
 
 
886 aa  65.5  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2761  CoA binding domain/acetyltransferase domain protein  29.38 
 
 
886 aa  65.5  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.282153  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2979  CoA-binding domain/acetyltransferase domain-containing protein  29.87 
 
 
886 aa  65.1  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2128  hypothetical protein  31.82 
 
 
907 aa  64.7  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.505771  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1628  GCN5-related N-acetyltransferase  29.23 
 
 
901 aa  64.3  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.321665  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0051  GCN5-related N-acetyltransferase  32.26 
 
 
173 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7067  Acyl-CoA synthetase (NDP forming)-like protein  33.14 
 
 
881 aa  63.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0030  GCN5-related N-acetyltransferase  28.82 
 
 
179 aa  63.2  0.000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3069  GCN5-related N-acetyltransferase  27.27 
 
 
887 aa  63.5  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.835722  hitchhiker  0.00746938 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1293  GCN5-related N-acetyltransferase  32.26 
 
 
173 aa  62.8  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0890  CoA-binding domain protein  30.19 
 
 
915 aa  62.8  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0615  GCN5-related N-acetyltransferase  33.8 
 
 
775 aa  63.2  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.47112  normal  0.466486 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04744  N-acetyltransferase family protein  29.65 
 
 
180 aa  62  0.000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7135  hypothetical protein  31.46 
 
 
183 aa  62.4  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.12543  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1929  GCN5-related protein N-acetyltransferase  33.12 
 
 
907 aa  62  0.000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.191743 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1416  GCN5-related N-acetyltransferase  28.86 
 
 
909 aa  62  0.000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.953678  normal  0.831405 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1135  GCN5-related N-acetyltransferase  31.95 
 
 
179 aa  62  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.370812  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1084  GCN5-related N-acetyltransferase  27.33 
 
 
886 aa  61.6  0.000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2871  CoA-binding domain/acetyltransferase domain-containing protein  27.33 
 
 
886 aa  61.6  0.000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.288181  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1093  GCN5-related N-acetyltransferase  27.33 
 
 
886 aa  61.6  0.000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.312736  normal  0.038329 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1622  CoA-binding domain protein  28.49 
 
 
894 aa  61.6  0.000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000156668 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2741  CoA-binding domain/acetyltransferase domain-containing protein  27.33 
 
 
886 aa  61.6  0.000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.225885  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2952  acetyltransferase, GNAT family protein  27.33 
 
 
886 aa  61.6  0.000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.487518  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02478  fused predicted acyl-CoA synthetase: NAD(P)-binding subunit/ATP-binding subunit  27.74 
 
 
886 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16050  acyl-CoA synthetase (NDP forming)  29.38 
 
 
934 aa  60.8  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.243356 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2737  CoA-binding domain/acetyltransferase domain-containing protein  27.74 
 
 
886 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.028573  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1904  CoA-binding  24.73 
 
 
915 aa  61.2  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1106  GCN5-related N-acetyltransferase  31.95 
 
 
179 aa  60.5  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3083  GCN5-related N-acetyltransferase  31.48 
 
 
192 aa  60.5  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.458832  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3821  acetyltransferase, GNAT family protein  27.74 
 
 
886 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.126569  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0619  acetyl-CoA hydrolase/transferase  27.45 
 
 
627 aa  60.8  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1123  GCN5-related N-acetyltransferase  31.95 
 
 
179 aa  60.5  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.645372 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2502  GCN5-related N-acetyltransferase  26.37 
 
 
915 aa  60.8  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02442  hypothetical protein  27.74 
 
 
886 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1694  GCN5-related N-acetyltransferase  33.91 
 
 
926 aa  60.8  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.133796  normal  0.55865 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2087  GCN5-related N-acetyltransferase  29.41 
 
 
187 aa  60.1  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.738524  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1919  GCN5-related N-acetyltransferase  27.91 
 
 
897 aa  60.5  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3787  GCN5-related N-acetyltransferase  31.03 
 
 
893 aa  60.1  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.152255  normal  0.584702 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2530  GCN5-related N-acetyltransferase  25.82 
 
 
896 aa  60.1  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3564  CoA-binding domain protein  30.46 
 
 
902 aa  60.5  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.695831  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000156  protein acetyltransferase  28.48 
 
 
877 aa  59.7  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.775567  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2486  GCN5-related N-acetyltransferase  33.56 
 
 
771 aa  59.7  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3465  putative acyl-CoA synthetase  25.15 
 
 
880 aa  59.7  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.063853  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3006  CoA-binding protein  26.99 
 
 
912 aa  59.7  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000257819 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3343  GCN5-related N-acetyltransferase  25.15 
 
 
880 aa  59.7  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0598594  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05787  hypothetical protein  28.86 
 
 
877 aa  59.7  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3206  putative acyl-CoA synthetase  25.15 
 
 
880 aa  59.7  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2039  GCN5-related N-acetyltransferase  26.09 
 
 
900 aa  59.7  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.583899  normal  0.0195221 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0517  hypothetical protein  26.11 
 
 
893 aa  59.7  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3258  GCN5-related N-acetyltransferase  31.76 
 
 
204 aa  59.7  0.00000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.764419 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>