54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_2347 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_2347  hypothetical protein  100 
 
 		 206 aa  397  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.496231  normal  0.426855 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2737  putative transmembrane protein  99.51 
 
 		 206 aa  396  1e-109  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2467  hypothetical protein  86.24 
 
 		 206 aa  301  5.000000000000001e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.376911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0933  transmembrane protein  80.61 
 
 		 200 aa  270  1e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0897  hypothetical protein  79.27 
 
 		 198 aa  264  5e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1869  hypothetical protein  62.64 
 
 		 205 aa  223  1e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.369698  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0374  hypothetical protein  62.64 
 
 		 205 aa  223  1e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1258  hypothetical protein  62.64 
 
 		 205 aa  223  1e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0912844  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0776  hypothetical protein  62.64 
 
 		 205 aa  223  1e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.186412  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1091  hypothetical protein  62.64 
 
 		 205 aa  223  1e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1250  hypothetical protein  62.64 
 
 		 205 aa  223  2e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.649239  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1028  hypothetical protein  62.09 
 
 		 205 aa  222  2e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2197  hypothetical protein  64.84 
 
 		 205 aa  202  2e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1669  hypothetical protein  64.29 
 
 		 205 aa  202  3e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2281  hypothetical protein  64.29 
 
 		 205 aa  202  3e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2304  hypothetical protein  64.29 
 
 		 205 aa  202  3e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3246  putative transmembrane protein  61.2 
 
 		 203 aa  201  6e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2319  hypothetical protein  64.29 
 
 		 205 aa  201  7e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.591554  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1314  putative transmembrane protein  61.2 
 
 		 203 aa  201  9e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.19046 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5608  hypothetical protein  63.19 
 
 		 205 aa  200  9e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1299  hypothetical protein  55.14 
 
 		 189 aa  196  2.0000000000000003e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0952657  normal  0.612539 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2051  putative transmembrane protein  61.2 
 
 		 203 aa  194  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.754982 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0997  hypothetical protein  63.74 
 
 		 205 aa  191  5e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.235718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0586  hypothetical protein  51.89 
 
 		 266 aa  187  7e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3969  hypothetical protein  53.23 
 
 		 206 aa  181  5.0000000000000004e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.399927  normal  0.523061 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4158  putative transmembrane protein  50.99 
 
 		 222 aa  172  2.9999999999999996e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0474  putative transmembrane protein  49.73 
 
 		 223 aa  165  5e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3704  hypothetical protein  53.06 
 
 		 205 aa  162  3e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1407  hypothetical protein  45.41 
 
 		 257 aa  154  1e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000141627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5971  putative transmembrane protein  46.91 
 
 		 249 aa  148  6e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02945  hypothetical protein  49.72 
 
 		 208 aa  146  2.0000000000000003e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.393839  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4352  putative transmembrane protein  45.5 
 
 		 202 aa  139  3e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0036  hypothetical protein  45.98 
 
 		 202 aa  132  5e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3041  putative transmembrane protein  54.73 
 
 		 239 aa  131  5e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.406059  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4720  putative transmembrane protein  48.02 
 
 		 223 aa  131  5e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3760  putative transmembrane protein  54.73 
 
 		 239 aa  131  6e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3357  putative transmembrane protein  45.74 
 
 		 214 aa  125  5e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.868744 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1970  putative transmembrane protein  42.79 
 
 		 211 aa  118  7e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.78458 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03310  hypothetical protein  35.71 
 
 		 203 aa  79  0.00000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3990  transmembrane protein  36.81 
 
 		 212 aa  75.1  0.0000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.29118  normal  0.555253 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1719  hypothetical protein  36.67 
 
 		 201 aa  73.9  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.231903 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2986  transmembrane protein  35.9 
 
 		 196 aa  72.8  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.500068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1027  putative transmembrane protein  42.75 
 
 		 200 aa  69.7  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1030  putative transmembrane protein  42.54 
 
 		 200 aa  69.3  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0968  putative transmembrane protein  42.54 
 
 		 200 aa  68.9  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2195  hypothetical protein  36.67 
 
 		 196 aa  68.2  0.00000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.84111 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0955  hypothetical protein  35.29 
 
 		 220 aa  66.2  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1001  conserved hypothetical membrane spanning protein  33.76 
 
 		 194 aa  64.7  0.0000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0503  hypothetical protein  26.53 
 
 		 235 aa  57.4  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3552  hypothetical protein  27.93 
 
 		 192 aa  56.2  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.333315 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4502  hypothetical protein  43.75 
 
 		 193 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10588  hypothetical protein  29.19 
 
 		 192 aa  51.2  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3259  hypothetical protein  31.58 
 
 		 198 aa  50.4  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1460  hypothetical protein  26.7 
 
 		 199 aa  47.8  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00443497  normal  0.661074 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>