51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0586 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_0586  hypothetical protein  100 
 
 
266 aa  526  1e-148  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1407  hypothetical protein  49.82 
 
 
257 aa  246  2e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000141627  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3969  hypothetical protein  62.5 
 
 
206 aa  238  8e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.399927  normal  0.523061 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1299  hypothetical protein  51.85 
 
 
189 aa  192  6e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0952657  normal  0.612539 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0474  putative transmembrane protein  51.78 
 
 
223 aa  191  1e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1869  hypothetical protein  48.7 
 
 
205 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.369698  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0374  hypothetical protein  48.7 
 
 
205 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1258  hypothetical protein  48.7 
 
 
205 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0912844  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0776  hypothetical protein  48.7 
 
 
205 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.186412  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1091  hypothetical protein  48.7 
 
 
205 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1250  hypothetical protein  48.7 
 
 
205 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.649239  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1028  hypothetical protein  49.22 
 
 
205 aa  178  7e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4158  putative transmembrane protein  48.15 
 
 
222 aa  175  7e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2467  hypothetical protein  49.73 
 
 
206 aa  167  2e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.376911  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2347  hypothetical protein  51.89 
 
 
206 aa  162  6e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.496231  normal  0.426855 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1314  putative transmembrane protein  50.78 
 
 
203 aa  160  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.19046 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2051  putative transmembrane protein  51.81 
 
 
203 aa  160  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.754982 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3246  putative transmembrane protein  51.3 
 
 
203 aa  160  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2737  putative transmembrane protein  51.89 
 
 
206 aa  159  6e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0897  hypothetical protein  56.76 
 
 
198 aa  155  4e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0933  transmembrane protein  51.35 
 
 
200 aa  152  4e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5971  putative transmembrane protein  44.51 
 
 
249 aa  152  4e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1669  hypothetical protein  48.19 
 
 
205 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2197  hypothetical protein  48.19 
 
 
205 aa  151  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2281  hypothetical protein  48.19 
 
 
205 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2304  hypothetical protein  48.19 
 
 
205 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2319  hypothetical protein  48.19 
 
 
205 aa  150  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.591554  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5608  hypothetical protein  47.67 
 
 
205 aa  150  3e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4720  putative transmembrane protein  50.25 
 
 
223 aa  148  9e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3760  putative transmembrane protein  52.67 
 
 
239 aa  144  1e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3041  putative transmembrane protein  52.67 
 
 
239 aa  144  1e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.406059  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0997  hypothetical protein  48.7 
 
 
205 aa  141  9e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.235718  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4352  putative transmembrane protein  42.54 
 
 
202 aa  138  7.999999999999999e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0036  hypothetical protein  39.27 
 
 
202 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3357  putative transmembrane protein  43.39 
 
 
214 aa  128  8.000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.868744 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3704  hypothetical protein  40.66 
 
 
205 aa  125  7e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02945  hypothetical protein  41.57 
 
 
208 aa  122  5e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.393839  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0968  putative transmembrane protein  39.46 
 
 
200 aa  83.6  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1030  putative transmembrane protein  38.92 
 
 
200 aa  82.4  0.000000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1027  putative transmembrane protein  38.92 
 
 
200 aa  81.6  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1970  putative transmembrane protein  34.97 
 
 
211 aa  79.3  0.00000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.78458 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3552  hypothetical protein  27.43 
 
 
192 aa  54.3  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.333315 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03310  hypothetical protein  30.73 
 
 
203 aa  52  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0503  hypothetical protein  26.2 
 
 
235 aa  51.6  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2986  transmembrane protein  31.41 
 
 
196 aa  50.8  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.500068  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2195  hypothetical protein  39.51 
 
 
196 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.84111 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1001  conserved hypothetical membrane spanning protein  33.57 
 
 
194 aa  50.1  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1719  hypothetical protein  33.82 
 
 
201 aa  48.5  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.231903 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3990  transmembrane protein  31.46 
 
 
212 aa  46.2  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.29118  normal  0.555253 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0955  hypothetical protein  30.37 
 
 
220 aa  46.2  0.0006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4502  hypothetical protein  42.11 
 
 
193 aa  42.7  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>