55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2195 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_2195  hypothetical protein  100 
 
 
196 aa  367  1e-101  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.84111 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4502  hypothetical protein  87.64 
 
 
193 aa  248  3e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2986  transmembrane protein  50.31 
 
 
196 aa  160  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.500068  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0955  hypothetical protein  51.83 
 
 
220 aa  159  3e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1719  hypothetical protein  52.9 
 
 
201 aa  154  9e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.231903 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03310  hypothetical protein  43.24 
 
 
203 aa  139  3e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3990  transmembrane protein  42.05 
 
 
212 aa  134  7.000000000000001e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.29118  normal  0.555253 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3255  hypothetical protein  50.96 
 
 
231 aa  117  7.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3552  hypothetical protein  37.06 
 
 
192 aa  108  5e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.333315 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2269  hypothetical protein  37.13 
 
 
193 aa  90.5  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0503  hypothetical protein  34.39 
 
 
235 aa  88.2  7e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1001  conserved hypothetical membrane spanning protein  33.95 
 
 
194 aa  82.4  0.000000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3259  hypothetical protein  34.97 
 
 
198 aa  78.6  0.00000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1250  hypothetical protein  34.24 
 
 
205 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.649239  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0374  hypothetical protein  33.7 
 
 
205 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1258  hypothetical protein  33.7 
 
 
205 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0912844  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0776  hypothetical protein  33.7 
 
 
205 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.186412  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1091  hypothetical protein  33.7 
 
 
205 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1869  hypothetical protein  33.7 
 
 
205 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.369698  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1028  hypothetical protein  34.78 
 
 
205 aa  68.2  0.00000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10588  hypothetical protein  27.46 
 
 
192 aa  67.4  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2467  hypothetical protein  33.13 
 
 
206 aa  67.4  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.376911  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2737  putative transmembrane protein  32.51 
 
 
206 aa  66.6  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2347  hypothetical protein  32.02 
 
 
206 aa  66.6  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.496231  normal  0.426855 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5971  putative transmembrane protein  32.04 
 
 
249 aa  64.3  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0036  hypothetical protein  32.16 
 
 
202 aa  62  0.000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2281  hypothetical protein  35.54 
 
 
205 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5608  hypothetical protein  34.94 
 
 
205 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1669  hypothetical protein  35.54 
 
 
205 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1314  putative transmembrane protein  31.15 
 
 
203 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.19046 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2304  hypothetical protein  35.54 
 
 
205 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3246  putative transmembrane protein  31.15 
 
 
203 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2051  putative transmembrane protein  33.56 
 
 
203 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.754982 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0897  hypothetical protein  34.16 
 
 
198 aa  58.2  0.00000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1299  hypothetical protein  30.57 
 
 
189 aa  58.2  0.00000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0952657  normal  0.612539 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0933  transmembrane protein  43.84 
 
 
200 aa  58.2  0.00000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1460  hypothetical protein  28.27 
 
 
199 aa  55.5  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00443497  normal  0.661074 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2197  hypothetical protein  34.34 
 
 
205 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0997  hypothetical protein  46.67 
 
 
205 aa  53.9  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.235718  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2319  hypothetical protein  34.34 
 
 
205 aa  54.7  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.591554  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0586  hypothetical protein  29.32 
 
 
266 aa  52.8  0.000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3969  hypothetical protein  32.24 
 
 
206 aa  52.4  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.399927  normal  0.523061 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0734  hypothetical protein  26.87 
 
 
202 aa  50.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0474  putative transmembrane protein  30.48 
 
 
223 aa  48.9  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3704  hypothetical protein  41.77 
 
 
205 aa  47.8  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3357  putative transmembrane protein  30.27 
 
 
214 aa  47  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.868744 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4158  putative transmembrane protein  38.16 
 
 
222 aa  45.4  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4720  putative transmembrane protein  38.64 
 
 
223 aa  45.1  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1970  putative transmembrane protein  32.53 
 
 
211 aa  44.7  0.0009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.78458 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02945  hypothetical protein  36.59 
 
 
208 aa  43.9  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.393839  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3041  putative transmembrane protein  29.2 
 
 
239 aa  43.1  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.406059  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3760  putative transmembrane protein  29.2 
 
 
239 aa  43.1  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4352  putative transmembrane protein  29.56 
 
 
202 aa  42.7  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03030  hypothetical protein  64.29 
 
 
84 aa  42  0.005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1407  hypothetical protein  34.25 
 
 
257 aa  41.6  0.008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000141627  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>