48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1407 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1407  hypothetical protein  100 
 
 		 257 aa  514  1.0000000000000001e-145  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000141627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0586  hypothetical protein  49.82 
 
 		 266 aa  264  1e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3969  hypothetical protein  62 
 
 		 206 aa  246  2e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.399927  normal  0.523061 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0474  putative transmembrane protein  47.52 
 
 		 223 aa  179  4e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1299  hypothetical protein  46.52 
 
 		 189 aa  174  9.999999999999999e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0952657  normal  0.612539 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4158  putative transmembrane protein  46.94 
 
 		 222 aa  171  2e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0374  hypothetical protein  42.78 
 
 		 205 aa  159  6e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1869  hypothetical protein  42.78 
 
 		 205 aa  159  6e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.369698  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1258  hypothetical protein  42.78 
 
 		 205 aa  159  6e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0912844  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1250  hypothetical protein  42.78 
 
 		 205 aa  159  6e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.649239  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0776  hypothetical protein  42.78 
 
 		 205 aa  159  6e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.186412  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1091  hypothetical protein  42.78 
 
 		 205 aa  159  6e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1028  hypothetical protein  42.78 
 
 		 205 aa  157  1e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2467  hypothetical protein  46.49 
 
 		 206 aa  149  6e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.376911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5971  putative transmembrane protein  44.57 
 
 		 249 aa  144  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0897  hypothetical protein  49.19 
 
 		 198 aa  144  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4720  putative transmembrane protein  46.43 
 
 		 223 aa  143  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2051  putative transmembrane protein  45.45 
 
 		 203 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.754982 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0933  transmembrane protein  47.57 
 
 		 200 aa  140  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3246  putative transmembrane protein  43.85 
 
 		 203 aa  136  4e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1314  putative transmembrane protein  43.32 
 
 		 203 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.19046 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2347  hypothetical protein  45.41 
 
 		 206 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.496231  normal  0.426855 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2737  putative transmembrane protein  45.41 
 
 		 206 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2304  hypothetical protein  43.85 
 
 		 205 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1669  hypothetical protein  43.85 
 
 		 205 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2281  hypothetical protein  43.85 
 
 		 205 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5608  hypothetical protein  43.32 
 
 		 205 aa  129  6e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0036  hypothetical protein  39.47 
 
 		 202 aa  128  9.000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2197  hypothetical protein  43.32 
 
 		 205 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3041  putative transmembrane protein  46.62 
 
 		 239 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.406059  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3760  putative transmembrane protein  46.62 
 
 		 239 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2319  hypothetical protein  43.32 
 
 		 205 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.591554  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0997  hypothetical protein  43.85 
 
 		 205 aa  125  7e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.235718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3357  putative transmembrane protein  41.36 
 
 		 214 aa  125  8.000000000000001e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.868744 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4352  putative transmembrane protein  41.89 
 
 		 202 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3704  hypothetical protein  40.53 
 
 		 205 aa  117  1.9999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02945  hypothetical protein  37.64 
 
 		 208 aa  103  2e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.393839  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1970  putative transmembrane protein  40 
 
 		 211 aa  84  0.000000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.78458 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0968  putative transmembrane protein  38.61 
 
 		 200 aa  68.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1030  putative transmembrane protein  38.61 
 
 		 200 aa  67.8  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1027  putative transmembrane protein  38.61 
 
 		 200 aa  67  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0503  hypothetical protein  26.29 
 
 		 235 aa  58.9  0.00000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2986  transmembrane protein  27.75 
 
 		 196 aa  49.3  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.500068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3990  transmembrane protein  28.57 
 
 		 212 aa  46.2  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.29118  normal  0.555253 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3259  hypothetical protein  30.67 
 
 		 198 aa  44.3  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2195  hypothetical protein  33.33 
 
 		 196 aa  42.7  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.84111 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0482  hypothetical protein  47.83 
 
 		 309 aa  42.4  0.008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3552  hypothetical protein  24.56 
 
 		 192 aa  42  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.333315 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>