55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_2197 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_2197  hypothetical protein  100 
 
 		 205 aa  387  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2319  hypothetical protein  99.51 
 
 		 205 aa  385  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.591554  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1028  hypothetical protein  85.85 
 
 		 205 aa  348  4e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1869  hypothetical protein  85.37 
 
 		 205 aa  345  3e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.369698  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0374  hypothetical protein  85.37 
 
 		 205 aa  345  3e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1258  hypothetical protein  85.37 
 
 		 205 aa  345  3e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0912844  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0776  hypothetical protein  85.37 
 
 		 205 aa  345  3e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.186412  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1091  hypothetical protein  85.37 
 
 		 205 aa  345  3e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1250  hypothetical protein  85.37 
 
 		 205 aa  344  6e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.649239  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5608  hypothetical protein  96.1 
 
 		 205 aa  335  1.9999999999999998e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1669  hypothetical protein  96.59 
 
 		 205 aa  335  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2281  hypothetical protein  96.59 
 
 		 205 aa  335  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2304  hypothetical protein  96.59 
 
 		 205 aa  335  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0997  hypothetical protein  97.56 
 
 		 205 aa  332  2e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.235718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3246  putative transmembrane protein  77.16 
 
 		 203 aa  282  2.0000000000000002e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1314  putative transmembrane protein  77.16 
 
 		 203 aa  282  3.0000000000000004e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.19046 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2051  putative transmembrane protein  76.14 
 
 		 203 aa  271  7e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.754982 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2467  hypothetical protein  62.64 
 
 		 206 aa  211  9e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.376911  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2347  hypothetical protein  64.84 
 
 		 206 aa  201  7e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.496231  normal  0.426855 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0933  transmembrane protein  65.93 
 
 		 200 aa  198  5e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2737  putative transmembrane protein  65.38 
 
 		 206 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0897  hypothetical protein  61.22 
 
 		 198 aa  196  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1299  hypothetical protein  55.08 
 
 		 189 aa  195  3e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0952657  normal  0.612539 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0586  hypothetical protein  48.19 
 
 		 266 aa  175  3e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3969  hypothetical protein  53.23 
 
 		 206 aa  176  3e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.399927  normal  0.523061 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0474  putative transmembrane protein  47.62 
 
 		 223 aa  157  1e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4158  putative transmembrane protein  50.56 
 
 		 222 aa  155  4e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1407  hypothetical protein  43.32 
 
 		 257 aa  140  9e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000141627  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3704  hypothetical protein  50 
 
 		 205 aa  137  8.999999999999999e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5971  putative transmembrane protein  46.67 
 
 		 249 aa  134  7.000000000000001e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3041  putative transmembrane protein  53.38 
 
 		 239 aa  131  6e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.406059  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3760  putative transmembrane protein  53.38 
 
 		 239 aa  131  6e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4352  putative transmembrane protein  48.7 
 
 		 202 aa  131  9e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4720  putative transmembrane protein  48.69 
 
 		 223 aa  124  7e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0036  hypothetical protein  44.2 
 
 		 202 aa  121  6e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02945  hypothetical protein  47.8 
 
 		 208 aa  120  9.999999999999999e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.393839  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3357  putative transmembrane protein  50 
 
 		 214 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.868744 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1970  putative transmembrane protein  45.08 
 
 		 211 aa  113  3e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.78458 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0968  putative transmembrane protein  41.1 
 
 		 200 aa  77  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1030  putative transmembrane protein  40.41 
 
 		 200 aa  75.9  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1027  putative transmembrane protein  40.41 
 
 		 200 aa  75.9  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1719  hypothetical protein  34.87 
 
 		 201 aa  67  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.231903 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2986  transmembrane protein  32.91 
 
 		 196 aa  66.6  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.500068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3990  transmembrane protein  35.71 
 
 		 212 aa  67.4  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.29118  normal  0.555253 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0955  hypothetical protein  35.53 
 
 		 220 aa  65.5  0.0000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1001  conserved hypothetical membrane spanning protein  33.8 
 
 		 194 aa  64.3  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3552  hypothetical protein  31.03 
 
 		 192 aa  60.8  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.333315 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03310  hypothetical protein  34.16 
 
 		 203 aa  59.7  0.00000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2195  hypothetical protein  35.37 
 
 		 196 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.84111 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3259  hypothetical protein  30.46 
 
 		 198 aa  56.2  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10588  hypothetical protein  31.14 
 
 		 192 aa  53.9  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4502  hypothetical protein  41.35 
 
 		 193 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2269  hypothetical protein  31.88 
 
 		 193 aa  48.1  0.00009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0503  hypothetical protein  28.57 
 
 		 235 aa  47.4  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3255  hypothetical protein  39.51 
 
 		 231 aa  46.2  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>