48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3990 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_3990  transmembrane protein  100 
 
 
212 aa  414  9.999999999999999e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.29118  normal  0.555253 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2986  transmembrane protein  56.55 
 
 
196 aa  188  5.999999999999999e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.500068  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03310  hypothetical protein  44.9 
 
 
203 aa  162  3e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0955  hypothetical protein  48.47 
 
 
220 aa  149  4e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1719  hypothetical protein  49.69 
 
 
201 aa  148  7e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.231903 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2195  hypothetical protein  43.75 
 
 
196 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.84111 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3552  hypothetical protein  40.82 
 
 
192 aa  112  5e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.333315 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3255  hypothetical protein  48.15 
 
 
231 aa  109  4.0000000000000004e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4502  hypothetical protein  42.94 
 
 
193 aa  108  5e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2269  hypothetical protein  39.29 
 
 
193 aa  92.4  5e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0503  hypothetical protein  28.23 
 
 
235 aa  82  0.000000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1001  conserved hypothetical membrane spanning protein  30.72 
 
 
194 aa  76.3  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3259  hypothetical protein  33.33 
 
 
198 aa  71.2  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2467  hypothetical protein  34.36 
 
 
206 aa  70.1  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.376911  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1460  hypothetical protein  31 
 
 
199 aa  70.1  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00443497  normal  0.661074 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1314  putative transmembrane protein  30.81 
 
 
203 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.19046 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3246  putative transmembrane protein  30.33 
 
 
203 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2347  hypothetical protein  33.95 
 
 
206 aa  68.2  0.00000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.496231  normal  0.426855 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2737  putative transmembrane protein  33.95 
 
 
206 aa  68.2  0.00000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1028  hypothetical protein  31.08 
 
 
205 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1250  hypothetical protein  31.05 
 
 
205 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.649239  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1869  hypothetical protein  31.05 
 
 
205 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.369698  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0374  hypothetical protein  31.05 
 
 
205 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0776  hypothetical protein  31.05 
 
 
205 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.186412  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1091  hypothetical protein  31.05 
 
 
205 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1258  hypothetical protein  31.05 
 
 
205 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0912844  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5608  hypothetical protein  31.58 
 
 
205 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0897  hypothetical protein  32.3 
 
 
198 aa  59.3  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0933  transmembrane protein  31.21 
 
 
200 aa  58.5  0.00000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2197  hypothetical protein  31.58 
 
 
205 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2304  hypothetical protein  32.93 
 
 
205 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1669  hypothetical protein  32.93 
 
 
205 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2319  hypothetical protein  31.58 
 
 
205 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.591554  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0734  hypothetical protein  28.44 
 
 
202 aa  57.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2281  hypothetical protein  32.93 
 
 
205 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2051  putative transmembrane protein  36.31 
 
 
203 aa  57  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.754982 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0036  hypothetical protein  28.43 
 
 
202 aa  56.2  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10588  hypothetical protein  26.73 
 
 
192 aa  54.7  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0997  hypothetical protein  31.68 
 
 
205 aa  53.9  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.235718  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5971  putative transmembrane protein  32.48 
 
 
249 aa  53.1  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3704  hypothetical protein  31.18 
 
 
205 aa  51.6  0.000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4158  putative transmembrane protein  30.05 
 
 
222 aa  50.8  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02945  hypothetical protein  32.26 
 
 
208 aa  50.4  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.393839  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0586  hypothetical protein  30.73 
 
 
266 aa  50.4  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1299  hypothetical protein  27.6 
 
 
189 aa  47.4  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0952657  normal  0.612539 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3969  hypothetical protein  26.74 
 
 
206 aa  45.8  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.399927  normal  0.523061 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0474  putative transmembrane protein  25.89 
 
 
223 aa  43.1  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1407  hypothetical protein  26.74 
 
 
257 aa  42.4  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000141627  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>