48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5971 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_5971  putative transmembrane protein  100 
 
 		 249 aa  478  1e-134  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4158  putative transmembrane protein  59.9 
 
 		 222 aa  233  2.0000000000000002e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0474  putative transmembrane protein  57.77 
 
 		 223 aa  229  4e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3357  putative transmembrane protein  57.84 
 
 		 214 aa  201  9e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.868744 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4720  putative transmembrane protein  56.52 
 
 		 223 aa  200  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3041  putative transmembrane protein  58.74 
 
 		 239 aa  196  3e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.406059  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3760  putative transmembrane protein  59.5 
 
 		 239 aa  195  5.000000000000001e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4352  putative transmembrane protein  55.8 
 
 		 202 aa  182  6e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0586  hypothetical protein  44.21 
 
 		 266 aa  154  9e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3969  hypothetical protein  46.94 
 
 		 206 aa  144  1e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.399927  normal  0.523061 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2467  hypothetical protein  47.57 
 
 		 206 aa  142  5e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.376911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1299  hypothetical protein  42.33 
 
 		 189 aa  140  9.999999999999999e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0952657  normal  0.612539 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2347  hypothetical protein  46.5 
 
 		 206 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.496231  normal  0.426855 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1407  hypothetical protein  44.04 
 
 		 257 aa  134  9.999999999999999e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000141627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1028  hypothetical protein  43.23 
 
 		 205 aa  133  3e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2737  putative transmembrane protein  46.5 
 
 		 206 aa  132  5e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0897  hypothetical protein  47.74 
 
 		 198 aa  129  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1091  hypothetical protein  42.19 
 
 		 205 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0374  hypothetical protein  42.19 
 
 		 205 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0776  hypothetical protein  42.19 
 
 		 205 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.186412  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1258  hypothetical protein  42.19 
 
 		 205 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0912844  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1869  hypothetical protein  42.19 
 
 		 205 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.369698  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2051  putative transmembrane protein  49.31 
 
 		 203 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.754982 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1250  hypothetical protein  42.19 
 
 		 205 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.649239  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02945  hypothetical protein  43.75 
 
 		 208 aa  126  3e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.393839  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0933  transmembrane protein  45.41 
 
 		 200 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3704  hypothetical protein  44.5 
 
 		 205 aa  124  1e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2281  hypothetical protein  48.86 
 
 		 205 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1669  hypothetical protein  48.86 
 
 		 205 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2304  hypothetical protein  48.86 
 
 		 205 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3246  putative transmembrane protein  46.81 
 
 		 203 aa  123  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1314  putative transmembrane protein  46.56 
 
 		 203 aa  123  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.19046 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5608  hypothetical protein  48.3 
 
 		 205 aa  122  5e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2197  hypothetical protein  47.73 
 
 		 205 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2319  hypothetical protein  47.73 
 
 		 205 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.591554  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0997  hypothetical protein  50.34 
 
 		 205 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.235718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0036  hypothetical protein  36.92 
 
 		 202 aa  105  9e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1970  putative transmembrane protein  36.63 
 
 		 211 aa  87.4  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.78458 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0968  putative transmembrane protein  38.54 
 
 		 200 aa  66.2  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1027  putative transmembrane protein  40 
 
 		 200 aa  66.2  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1030  putative transmembrane protein  39.38 
 
 		 200 aa  65.1  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2195  hypothetical protein  32.89 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.84111 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2986  transmembrane protein  30.26 
 
 		 196 aa  52.4  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.500068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3990  transmembrane protein  34.62 
 
 		 212 aa  50.8  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.29118  normal  0.555253 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3259  hypothetical protein  28.49 
 
 		 198 aa  47.8  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3552  hypothetical protein  27.66 
 
 		 192 aa  47.8  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.333315 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1719  hypothetical protein  30.77 
 
 		 201 aa  45.8  0.0006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.231903 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3255  hypothetical protein  42.11 
 
 		 231 aa  42.4  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>