46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3552 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3552  hypothetical protein  100 
 
 		 192 aa  365  1e-100  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.333315 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2269  hypothetical protein  87.5 
 
 		 193 aa  246  1e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3259  hypothetical protein  46.56 
 
 		 198 aa  141  7e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0503  hypothetical protein  46.71 
 
 		 235 aa  117  7.999999999999999e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2986  transmembrane protein  40.24 
 
 		 196 aa  111  7.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.500068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3990  transmembrane protein  39.78 
 
 		 212 aa  109  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.29118  normal  0.555253 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03310  hypothetical protein  37.24 
 
 		 203 aa  108  3e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1719  hypothetical protein  45.75 
 
 		 201 aa  102  2e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.231903 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2195  hypothetical protein  40.13 
 
 		 196 aa  99  4e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.84111 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4502  hypothetical protein  40.37 
 
 		 193 aa  97.1  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0955  hypothetical protein  36.97 
 
 		 220 aa  97.1  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1001  conserved hypothetical membrane spanning protein  36.88 
 
 		 194 aa  95.1  5e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3255  hypothetical protein  40 
 
 		 231 aa  90.5  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10588  hypothetical protein  27.96 
 
 		 192 aa  73.9  0.000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1028  hypothetical protein  30.46 
 
 		 205 aa  65.1  0.0000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0734  hypothetical protein  33.66 
 
 		 202 aa  65.5  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1250  hypothetical protein  29.89 
 
 		 205 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.649239  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1869  hypothetical protein  29.31 
 
 		 205 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.369698  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1460  hypothetical protein  30.61 
 
 		 199 aa  63.5  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00443497  normal  0.661074 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1091  hypothetical protein  29.31 
 
 		 205 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0776  hypothetical protein  29.31 
 
 		 205 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.186412  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1258  hypothetical protein  29.31 
 
 		 205 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0912844  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0374  hypothetical protein  29.31 
 
 		 205 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2051  putative transmembrane protein  33.57 
 
 		 203 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.754982 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0586  hypothetical protein  27.43 
 
 		 266 aa  57.4  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2304  hypothetical protein  31.07 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1669  hypothetical protein  31.07 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2281  hypothetical protein  31.07 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5608  hypothetical protein  30.51 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3246  putative transmembrane protein  30.17 
 
 		 203 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1314  putative transmembrane protein  30.17 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.19046 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3969  hypothetical protein  29.31 
 
 		 206 aa  52.4  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.399927  normal  0.523061 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2197  hypothetical protein  30.51 
 
 		 205 aa  52  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4158  putative transmembrane protein  26.47 
 
 		 222 aa  51.6  0.000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2319  hypothetical protein  30.51 
 
 		 205 aa  51.2  0.000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.591554  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1299  hypothetical protein  26.7 
 
 		 189 aa  50.8  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0952657  normal  0.612539 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0997  hypothetical protein  32.62 
 
 		 205 aa  49.7  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.235718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5971  putative transmembrane protein  26.59 
 
 		 249 aa  48.5  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2467  hypothetical protein  27.45 
 
 		 206 aa  48.1  0.00008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.376911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0474  putative transmembrane protein  27.59 
 
 		 223 aa  47.8  0.00009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0933  transmembrane protein  29.58 
 
 		 200 aa  45.8  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27970  hypothetical protein  30.17 
 
 		 197 aa  44.7  0.0009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.924005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0036  hypothetical protein  25.56 
 
 		 202 aa  44.3  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1970  putative transmembrane protein  32.93 
 
 		 211 aa  43.5  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.78458 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2347  hypothetical protein  27.27 
 
 		 206 aa  42.4  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.496231  normal  0.426855 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2737  putative transmembrane protein  27.27 
 
 		 206 aa  42.4  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>