38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_10588 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_10588  hypothetical protein  100 
 
 
192 aa  374  1e-103  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1460  hypothetical protein  40.7 
 
 
199 aa  147  8e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00443497  normal  0.661074 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0734  hypothetical protein  40.43 
 
 
202 aa  140  9e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27970  hypothetical protein  42.63 
 
 
197 aa  120  9.999999999999999e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.924005  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1001  conserved hypothetical membrane spanning protein  31.01 
 
 
194 aa  69.7  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2269  hypothetical protein  32.5 
 
 
193 aa  68.6  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3552  hypothetical protein  27.96 
 
 
192 aa  68.2  0.00000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.333315 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03310  hypothetical protein  28.5 
 
 
203 aa  63.2  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3259  hypothetical protein  30 
 
 
198 aa  62.4  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1028  hypothetical protein  31.64 
 
 
205 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1250  hypothetical protein  33.52 
 
 
205 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.649239  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1869  hypothetical protein  33.52 
 
 
205 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.369698  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0374  hypothetical protein  33.52 
 
 
205 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1258  hypothetical protein  33.52 
 
 
205 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0912844  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1091  hypothetical protein  33.52 
 
 
205 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0776  hypothetical protein  33.52 
 
 
205 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.186412  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2986  transmembrane protein  27.54 
 
 
196 aa  57.8  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.500068  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2195  hypothetical protein  28.3 
 
 
196 aa  54.7  0.0000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.84111 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1719  hypothetical protein  28.48 
 
 
201 aa  50.1  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.231903 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2051  putative transmembrane protein  29.5 
 
 
203 aa  48.9  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.754982 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1669  hypothetical protein  32.14 
 
 
205 aa  48.9  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0955  hypothetical protein  31.87 
 
 
220 aa  48.5  0.00005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2304  hypothetical protein  32.14 
 
 
205 aa  48.9  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2281  hypothetical protein  32.14 
 
 
205 aa  48.9  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3990  transmembrane protein  28.49 
 
 
212 aa  48.1  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.29118  normal  0.555253 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2197  hypothetical protein  31.14 
 
 
205 aa  48.1  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3246  putative transmembrane protein  31.29 
 
 
203 aa  47.4  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5608  hypothetical protein  31.43 
 
 
205 aa  47.8  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3255  hypothetical protein  35.53 
 
 
231 aa  47.4  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1314  putative transmembrane protein  31.33 
 
 
203 aa  46.6  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.19046 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2319  hypothetical protein  31.14 
 
 
205 aa  46.6  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.591554  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0036  hypothetical protein  29.59 
 
 
202 aa  46.6  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0503  hypothetical protein  23.12 
 
 
235 aa  44.7  0.0008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0997  hypothetical protein  31.43 
 
 
205 aa  44.3  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.235718  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2467  hypothetical protein  27.33 
 
 
206 aa  43.5  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.376911  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4502  hypothetical protein  31.17 
 
 
193 aa  42.4  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2347  hypothetical protein  31.25 
 
 
206 aa  41.2  0.008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.496231  normal  0.426855 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2737  putative transmembrane protein  31.25 
 
 
206 aa  41.2  0.009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>