48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02945 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_02945  hypothetical protein  100 
 
 
208 aa  392  1e-108  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.393839  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3704  hypothetical protein  81.58 
 
 
205 aa  265  2.9999999999999995e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4158  putative transmembrane protein  40.09 
 
 
222 aa  138  4.999999999999999e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0474  putative transmembrane protein  38.84 
 
 
223 aa  135  5e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2467  hypothetical protein  46.96 
 
 
206 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.376911  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2347  hypothetical protein  53.02 
 
 
206 aa  132  3e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.496231  normal  0.426855 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0933  transmembrane protein  43.88 
 
 
200 aa  132  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2737  putative transmembrane protein  53.02 
 
 
206 aa  132  3e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0586  hypothetical protein  41.67 
 
 
266 aa  132  3e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0897  hypothetical protein  47.62 
 
 
198 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5971  putative transmembrane protein  45.36 
 
 
249 aa  128  5.0000000000000004e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1869  hypothetical protein  45.56 
 
 
205 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.369698  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0374  hypothetical protein  45.56 
 
 
205 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1258  hypothetical protein  45.56 
 
 
205 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0912844  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0776  hypothetical protein  45.56 
 
 
205 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.186412  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1091  hypothetical protein  45.56 
 
 
205 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3969  hypothetical protein  43.09 
 
 
206 aa  126  2.0000000000000002e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.399927  normal  0.523061 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1250  hypothetical protein  45.56 
 
 
205 aa  125  3e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.649239  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1028  hypothetical protein  44.44 
 
 
205 aa  124  9e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1299  hypothetical protein  38.67 
 
 
189 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0952657  normal  0.612539 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3357  putative transmembrane protein  39.9 
 
 
214 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.868744 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3246  putative transmembrane protein  43.5 
 
 
203 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1314  putative transmembrane protein  42.94 
 
 
203 aa  112  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.19046 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2051  putative transmembrane protein  48.53 
 
 
203 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.754982 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2197  hypothetical protein  46.36 
 
 
205 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4720  putative transmembrane protein  49.66 
 
 
223 aa  108  6e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2281  hypothetical protein  45.03 
 
 
205 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2319  hypothetical protein  46.36 
 
 
205 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.591554  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1669  hypothetical protein  45.03 
 
 
205 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2304  hypothetical protein  45.03 
 
 
205 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0997  hypothetical protein  46.94 
 
 
205 aa  107  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.235718  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5608  hypothetical protein  43.71 
 
 
205 aa  106  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4352  putative transmembrane protein  40.93 
 
 
202 aa  104  9e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1407  hypothetical protein  38.12 
 
 
257 aa  102  4e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000141627  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0036  hypothetical protein  37.91 
 
 
202 aa  99.4  4e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3041  putative transmembrane protein  46.26 
 
 
239 aa  98.6  7e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.406059  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3760  putative transmembrane protein  46.26 
 
 
239 aa  98.6  7e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1970  putative transmembrane protein  42.29 
 
 
211 aa  82  0.000000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.78458 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0968  putative transmembrane protein  39.68 
 
 
200 aa  72.4  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1030  putative transmembrane protein  39.68 
 
 
200 aa  72  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1027  putative transmembrane protein  39.68 
 
 
200 aa  71.6  0.000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3990  transmembrane protein  35.66 
 
 
212 aa  58.2  0.00000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.29118  normal  0.555253 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2986  transmembrane protein  32.64 
 
 
196 aa  56.2  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.500068  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03310  hypothetical protein  31.58 
 
 
203 aa  46.2  0.0004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2195  hypothetical protein  31.97 
 
 
196 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.84111 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0955  hypothetical protein  30.99 
 
 
220 aa  45.1  0.0007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1001  conserved hypothetical membrane spanning protein  30.61 
 
 
194 aa  44.3  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0503  hypothetical protein  26.86 
 
 
235 aa  43.5  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>