17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1460 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1460  hypothetical protein  100 
 
 		 199 aa  387  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00443497  normal  0.661074 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0734  hypothetical protein  40.21 
 
 		 202 aa  149  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10588  hypothetical protein  40.7 
 
 		 192 aa  147  9e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27970  hypothetical protein  42.31 
 
 		 197 aa  115  5e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.924005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03310  hypothetical protein  28.66 
 
 		 203 aa  66.6  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3990  transmembrane protein  30.6 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.29118  normal  0.555253 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3259  hypothetical protein  27.96 
 
 		 198 aa  57.4  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3552  hypothetical protein  30.81 
 
 		 192 aa  56.2  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.333315 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1001  conserved hypothetical membrane spanning protein  29.19 
 
 		 194 aa  54.7  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1719  hypothetical protein  30.67 
 
 		 201 aa  52.4  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.231903 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2986  transmembrane protein  29.65 
 
 		 196 aa  50.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.500068  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0503  hypothetical protein  24.85 
 
 		 235 aa  46.2  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2467  hypothetical protein  26.25 
 
 		 206 aa  43.9  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.376911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2195  hypothetical protein  27.5 
 
 		 196 aa  43.9  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.84111 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2269  hypothetical protein  29.88 
 
 		 193 aa  42.7  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5971  putative transmembrane protein  29.11 
 
 		 249 aa  41.6  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1028  hypothetical protein  24.39 
 
 		 205 aa  41.6  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>