36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4672 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4672  protein of unknown function DUF1036  100 
 
 		 194 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1424  hypothetical protein  76.77 
 
 		 197 aa  273  8e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3981  hypothetical protein  76.17 
 
 		 197 aa  267  5.9999999999999995e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.316948  normal  0.424983 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0987  hypothetical protein  76.36 
 
 		 194 aa  258  5.0000000000000005e-68  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.762572 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1403  hypothetical protein  78.06 
 
 		 196 aa  256  1e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.661083  normal  0.675418 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6868  hypothetical protein  86.01 
 
 		 195 aa  256  2e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.564815  normal  0.0261857 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1219  hypothetical protein  72.94 
 
 		 194 aa  251  5.000000000000001e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.530921  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2064  hypothetical protein  77.19 
 
 		 182 aa  200  9.999999999999999e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0127  hypothetical protein  58.74 
 
 		 160 aa  194  6e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.90722  normal  0.376398 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5963  protein of unknown function DUF1036  71.56 
 
 		 151 aa  188  5e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5206  hypothetical protein  67.48 
 
 		 116 aa  188  5e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.224545  normal  0.192345 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2746  hypothetical protein  60.9 
 
 		 180 aa  186  1e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.306874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2973  protein of unknown function DUF1036  57.53 
 
 		 151 aa  184  5e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.914552 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2868  protein of unknown function DUF1036  62.7 
 
 		 163 aa  177  8e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3701  protein of unknown function DUF1036  58.7 
 
 		 143 aa  175  4e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0176708 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3233  hypothetical protein  60.47 
 
 		 146 aa  171  5e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1689  hypothetical protein  51.54 
 
 		 153 aa  150  2e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.760794  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1749  hypothetical protein  51.54 
 
 		 153 aa  150  2e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1164  hypothetical protein  50 
 
 		 153 aa  148  4e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3255  hypothetical protein  44.12 
 
 		 158 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2677  hypothetical protein  50 
 
 		 145 aa  141  6e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.355095  normal  0.206179 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3591  protein of unknown function DUF1036  52.17 
 
 		 157 aa  138  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.98491  normal  0.146301 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3691  hypothetical protein  47.11 
 
 		 204 aa  138  4.999999999999999e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.296318  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3290  protein of unknown function DUF1036  51.3 
 
 		 157 aa  137  8.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.772364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0134  hypothetical protein  44.63 
 
 		 121 aa  117  9.999999999999999e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2881  hypothetical protein  40.77 
 
 		 128 aa  104  9e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.940085 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1587  integral membrane protein-like  38.73 
 
 		 146 aa  92.8  3e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.378927 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0296  hypothetical protein  31.76 
 
 		 333 aa  79.3  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1886  integral membrane protein-like  34.31 
 
 		 357 aa  72  0.000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0813  hypothetical protein  27.73 
 
 		 347 aa  60.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.780692  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0073  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.63 
 
 		 384 aa  58.2  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00557733 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0481  protease  25.64 
 
 		 371 aa  53.5  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.43704  normal  0.335547 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7330  hypothetical protein  26.14 
 
 		 372 aa  52.8  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.117708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0679  peptidoglycan binding domain-containing protein  28.16 
 
 		 318 aa  51.2  0.000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0632  hypothetical protein  27.27 
 
 		 339 aa  50.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0456  peptidoglycan binding domain-containing protein  22.69 
 
 		 331 aa  46.6  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.954935  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>