36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3290 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3290  protein of unknown function DUF1036  100 
 
 		 157 aa  327  5.0000000000000004e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.772364  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3591  protein of unknown function DUF1036  98.09 
 
 		 157 aa  320  4e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.98491  normal  0.146301 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2677  hypothetical protein  86.43 
 
 		 145 aa  259  8.999999999999999e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.355095  normal  0.206179 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3691  hypothetical protein  76.82 
 
 		 204 aa  248  3e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.296318  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1164  hypothetical protein  65.69 
 
 		 153 aa  189  9e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1689  hypothetical protein  66.42 
 
 		 153 aa  188  2e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.760794  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1749  hypothetical protein  66.42 
 
 		 153 aa  188  2e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3255  hypothetical protein  60.15 
 
 		 158 aa  181  5.0000000000000004e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1424  hypothetical protein  46.76 
 
 		 197 aa  143  1e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0127  hypothetical protein  50.43 
 
 		 160 aa  138  3e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.90722  normal  0.376398 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4672  protein of unknown function DUF1036  51.3 
 
 		 194 aa  137  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2746  hypothetical protein  48.44 
 
 		 180 aa  135  2e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.306874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0987  hypothetical protein  46.15 
 
 		 194 aa  135  3.0000000000000003e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.762572 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3981  hypothetical protein  44.06 
 
 		 197 aa  134  4e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.316948  normal  0.424983 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6868  hypothetical protein  49.57 
 
 		 195 aa  134  5e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.564815  normal  0.0261857 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2973  protein of unknown function DUF1036  48.44 
 
 		 151 aa  134  5e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.914552 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2064  hypothetical protein  48.74 
 
 		 182 aa  134  6.0000000000000005e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1403  hypothetical protein  50.89 
 
 		 196 aa  133  8e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.661083  normal  0.675418 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1219  hypothetical protein  46.15 
 
 		 194 aa  131  3.9999999999999996e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.530921  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5963  protein of unknown function DUF1036  53.57 
 
 		 151 aa  130  7.999999999999999e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0134  hypothetical protein  55.45 
 
 		 121 aa  130  7.999999999999999e-30  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5206  hypothetical protein  52.25 
 
 		 116 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.224545  normal  0.192345 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2868  protein of unknown function DUF1036  50 
 
 		 163 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3233  hypothetical protein  43.75 
 
 		 146 aa  122  2e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3701  protein of unknown function DUF1036  41.43 
 
 		 143 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0176708 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2881  hypothetical protein  41.27 
 
 		 128 aa  107  7.000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.940085 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1587  integral membrane protein-like  34.56 
 
 		 146 aa  84  8e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.378927 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1886  integral membrane protein-like  35.58 
 
 		 357 aa  72  0.000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0296  hypothetical protein  30.56 
 
 		 333 aa  65.5  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0456  peptidoglycan binding domain-containing protein  27.52 
 
 		 331 aa  58.2  0.00000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.954935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7330  hypothetical protein  31.03 
 
 		 372 aa  57.8  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.117708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0813  hypothetical protein  28.7 
 
 		 347 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.780692  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0679  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.67 
 
 		 318 aa  50.4  0.000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0632  hypothetical protein  26.47 
 
 		 339 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0073  peptidoglycan binding domain-containing protein  27.27 
 
 		 384 aa  47.8  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00557733 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0481  protease  26.89 
 
 		 371 aa  47  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.43704  normal  0.335547 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>