36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1587 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1587  integral membrane protein-like  100 
 
 		 146 aa  302  1.0000000000000001e-81  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.378927 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1219  hypothetical protein  38.41 
 
 		 194 aa  107  7.000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.530921  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6868  hypothetical protein  43.1 
 
 		 195 aa  105  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.564815  normal  0.0261857 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4672  protein of unknown function DUF1036  38.73 
 
 		 194 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3255  hypothetical protein  37.68 
 
 		 158 aa  105  3e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1424  hypothetical protein  39.1 
 
 		 197 aa  104  4e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0127  hypothetical protein  38.69 
 
 		 160 aa  104  5e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.90722  normal  0.376398 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0987  hypothetical protein  42.02 
 
 		 194 aa  103  7e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.762572 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3981  hypothetical protein  42.24 
 
 		 197 aa  103  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.316948  normal  0.424983 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3691  hypothetical protein  39.17 
 
 		 204 aa  103  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.296318  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2881  hypothetical protein  45.22 
 
 		 128 aa  100  6e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.940085 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3233  hypothetical protein  44.07 
 
 		 146 aa  98.6  3e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2746  hypothetical protein  37.6 
 
 		 180 aa  98.6  3e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.306874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2973  protein of unknown function DUF1036  37.6 
 
 		 151 aa  97.8  4e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.914552 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2677  hypothetical protein  38.98 
 
 		 145 aa  97.8  4e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.355095  normal  0.206179 
 
 
-
 
NC_004310  BR1749  hypothetical protein  39.52 
 
 		 153 aa  97.8  5e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1689  hypothetical protein  39.52 
 
 		 153 aa  97.8  5e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.760794  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3701  protein of unknown function DUF1036  42.28 
 
 		 143 aa  96.7  8e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0176708 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1164  hypothetical protein  38.71 
 
 		 153 aa  96.3  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3591  protein of unknown function DUF1036  37.82 
 
 		 157 aa  95.5  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.98491  normal  0.146301 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2064  hypothetical protein  39.29 
 
 		 182 aa  95.9  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3290  protein of unknown function DUF1036  34.56 
 
 		 157 aa  95.5  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.772364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5963  protein of unknown function DUF1036  42.2 
 
 		 151 aa  94.4  5e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1403  hypothetical protein  40.18 
 
 		 196 aa  93.6  9e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.661083  normal  0.675418 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5206  hypothetical protein  41.28 
 
 		 116 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.224545  normal  0.192345 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2868  protein of unknown function DUF1036  35.78 
 
 		 163 aa  87.4  5e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0134  hypothetical protein  34.65 
 
 		 121 aa  73.9  0.0000000000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0296  hypothetical protein  34.38 
 
 		 333 aa  73.2  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1886  integral membrane protein-like  32.08 
 
 		 357 aa  67.8  0.00000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0813  hypothetical protein  34.82 
 
 		 347 aa  64.3  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.780692  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0456  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.5 
 
 		 331 aa  63.9  0.0000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.954935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0632  hypothetical protein  28.68 
 
 		 339 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7330  hypothetical protein  23.97 
 
 		 372 aa  55.1  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.117708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0679  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.25 
 
 		 318 aa  53.9  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0073  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.09 
 
 		 384 aa  51.2  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00557733 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0481  protease  26.13 
 
 		 371 aa  50.1  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.43704  normal  0.335547 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>