32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1886 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_1886  integral membrane protein-like  100 
 
 		 357 aa  726    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3691  hypothetical protein  34.48 
 
 		 204 aa  80.5  0.00000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.296318  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2677  hypothetical protein  36.51 
 
 		 145 aa  77.8  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.355095  normal  0.206179 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2973  protein of unknown function DUF1036  37.29 
 
 		 151 aa  77  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.914552 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2746  hypothetical protein  37.29 
 
 		 180 aa  77  0.0000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.306874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4672  protein of unknown function DUF1036  34.38 
 
 		 194 aa  75.9  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2881  hypothetical protein  30.77 
 
 		 128 aa  75.5  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.940085 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3290  protein of unknown function DUF1036  34.71 
 
 		 157 aa  74.7  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.772364  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1749  hypothetical protein  33.33 
 
 		 153 aa  73.9  0.000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1689  hypothetical protein  33.33 
 
 		 153 aa  73.9  0.000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.760794  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3981  hypothetical protein  35.85 
 
 		 197 aa  73.6  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.316948  normal  0.424983 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3591  protein of unknown function DUF1036  34.58 
 
 		 157 aa  72.4  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.98491  normal  0.146301 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3255  hypothetical protein  36.13 
 
 		 158 aa  72.4  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1424  hypothetical protein  34.17 
 
 		 197 aa  72.4  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6868  hypothetical protein  33.96 
 
 		 195 aa  71.6  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.564815  normal  0.0261857 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1164  hypothetical protein  32.46 
 
 		 153 aa  71.6  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0987  hypothetical protein  33.06 
 
 		 194 aa  71.2  0.00000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.762572 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0127  hypothetical protein  32.79 
 
 		 160 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.90722  normal  0.376398 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1219  hypothetical protein  33.06 
 
 		 194 aa  70.5  0.00000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.530921  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2064  hypothetical protein  33.05 
 
 		 182 aa  69.3  0.00000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1403  hypothetical protein  33.33 
 
 		 196 aa  69.3  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.661083  normal  0.675418 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5206  hypothetical protein  32.79 
 
 		 116 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.224545  normal  0.192345 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3701  protein of unknown function DUF1036  32.14 
 
 		 143 aa  68.2  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0176708 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5963  protein of unknown function DUF1036  32.76 
 
 		 151 aa  67.8  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2868  protein of unknown function DUF1036  36.08 
 
 		 163 aa  67  0.0000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0134  hypothetical protein  35.96 
 
 		 121 aa  66.6  0.0000000006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0456  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.11 
 
 		 331 aa  65.9  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.954935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0296  hypothetical protein  33.06 
 
 		 333 aa  65.1  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1587  integral membrane protein-like  30.37 
 
 		 146 aa  65.1  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.378927 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3233  hypothetical protein  31.2 
 
 		 146 aa  63.5  0.000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0813  hypothetical protein  26.05 
 
 		 347 aa  48.9  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.780692  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0073  peptidoglycan binding domain-containing protein  27.97 
 
 		 384 aa  46.6  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00557733 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>