36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0127 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0127  hypothetical protein  100 
 
 
160 aa  326  8e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.90722  normal  0.376398 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2746  hypothetical protein  63.43 
 
 
180 aa  221  3e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.306874  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2973  protein of unknown function DUF1036  75.94 
 
 
151 aa  217  5e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.914552 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5963  protein of unknown function DUF1036  83.93 
 
 
151 aa  210  7.999999999999999e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2868  protein of unknown function DUF1036  66.88 
 
 
163 aa  209  1e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5206  hypothetical protein  83.33 
 
 
116 aa  207  4e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.224545  normal  0.192345 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4672  protein of unknown function DUF1036  58.74 
 
 
194 aa  196  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1219  hypothetical protein  61.31 
 
 
194 aa  194  3e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.530921  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3981  hypothetical protein  61.03 
 
 
197 aa  193  7e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.316948  normal  0.424983 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1424  hypothetical protein  59.86 
 
 
197 aa  192  1e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6868  hypothetical protein  64.23 
 
 
195 aa  190  6e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.564815  normal  0.0261857 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0987  hypothetical protein  59.12 
 
 
194 aa  189  1e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.762572 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1403  hypothetical protein  65.52 
 
 
196 aa  185  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.661083  normal  0.675418 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3701  protein of unknown function DUF1036  62.68 
 
 
143 aa  179  1e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0176708 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2064  hypothetical protein  60.83 
 
 
182 aa  174  5e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3233  hypothetical protein  62.9 
 
 
146 aa  169  1e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3255  hypothetical protein  47.52 
 
 
158 aa  151  2.9999999999999998e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1164  hypothetical protein  50 
 
 
153 aa  149  1e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1689  hypothetical protein  48.18 
 
 
153 aa  149  2e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.760794  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1749  hypothetical protein  48.18 
 
 
153 aa  149  2e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3691  hypothetical protein  43.42 
 
 
204 aa  144  6e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.296318  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2677  hypothetical protein  49.19 
 
 
145 aa  144  7.0000000000000006e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.355095  normal  0.206179 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3591  protein of unknown function DUF1036  50 
 
 
157 aa  142  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.98491  normal  0.146301 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3290  protein of unknown function DUF1036  45.89 
 
 
157 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.772364  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0134  hypothetical protein  49.07 
 
 
121 aa  124  8.000000000000001e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2881  hypothetical protein  43.08 
 
 
128 aa  115  3e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.940085 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1587  integral membrane protein-like  38.69 
 
 
146 aa  94.4  6e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.378927 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0296  hypothetical protein  32.8 
 
 
333 aa  73.2  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1886  integral membrane protein-like  33.33 
 
 
357 aa  69.7  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0813  hypothetical protein  30.14 
 
 
347 aa  64.3  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.780692  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0073  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.04 
 
 
384 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00557733 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0632  hypothetical protein  29.56 
 
 
339 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0679  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.54 
 
 
318 aa  58.9  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0456  peptidoglycan binding domain-containing protein  28.21 
 
 
331 aa  53.1  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.954935  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0481  protease  29.06 
 
 
371 aa  51.2  0.000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.43704  normal  0.335547 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7330  hypothetical protein  33.73 
 
 
372 aa  51.2  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.117708  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>