36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0456 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0456  peptidoglycan binding domain-containing protein  100 
 
 
331 aa  666    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.954935  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0296  hypothetical protein  32.74 
 
 
333 aa  150  2e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0679  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.87 
 
 
318 aa  127  3e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7330  hypothetical protein  30.33 
 
 
372 aa  127  3e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.117708  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0813  hypothetical protein  30.77 
 
 
347 aa  122  8e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.780692  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0632  hypothetical protein  30.94 
 
 
339 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0073  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.21 
 
 
384 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00557733 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1886  integral membrane protein-like  36.63 
 
 
357 aa  65.1  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3691  hypothetical protein  29.91 
 
 
204 aa  62.4  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.296318  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2064  hypothetical protein  26.5 
 
 
182 aa  61.6  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3255  hypothetical protein  28.1 
 
 
158 aa  60.5  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2881  hypothetical protein  32.08 
 
 
128 aa  59.3  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.940085 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3290  protein of unknown function DUF1036  28.83 
 
 
157 aa  58.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.772364  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3591  protein of unknown function DUF1036  28.21 
 
 
157 aa  57  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.98491  normal  0.146301 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1689  hypothetical protein  29.51 
 
 
153 aa  56.6  0.0000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.760794  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1749  hypothetical protein  29.51 
 
 
153 aa  56.6  0.0000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1587  integral membrane protein-like  32.5 
 
 
146 aa  55.8  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.378927 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1164  hypothetical protein  29.47 
 
 
153 aa  54.7  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2677  hypothetical protein  27.93 
 
 
145 aa  53.9  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.355095  normal  0.206179 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3701  protein of unknown function DUF1036  29.13 
 
 
143 aa  54.3  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0176708 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0127  hypothetical protein  28.21 
 
 
160 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.90722  normal  0.376398 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3233  hypothetical protein  28.7 
 
 
146 aa  54.3  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2973  protein of unknown function DUF1036  27.35 
 
 
151 aa  53.9  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.914552 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2746  hypothetical protein  27.35 
 
 
180 aa  53.5  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.306874  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0134  hypothetical protein  29.13 
 
 
121 aa  52.4  0.00001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1424  hypothetical protein  24.83 
 
 
197 aa  52.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5963  protein of unknown function DUF1036  29.73 
 
 
151 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2868  protein of unknown function DUF1036  27.93 
 
 
163 aa  50.4  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0987  hypothetical protein  24.79 
 
 
194 aa  50.1  0.00005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.762572 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1219  hypothetical protein  26.21 
 
 
194 aa  50.1  0.00006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.530921  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2412  peptidoglycan binding domain-containing protein  45.71 
 
 
1557 aa  50.1  0.00006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6868  hypothetical protein  22.69 
 
 
195 aa  49.3  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.564815  normal  0.0261857 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5206  hypothetical protein  27.93 
 
 
116 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.224545  normal  0.192345 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3981  hypothetical protein  23.08 
 
 
197 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.316948  normal  0.424983 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4672  protein of unknown function DUF1036  28.07 
 
 
194 aa  47.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1403  hypothetical protein  22.12 
 
 
196 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.661083  normal  0.675418 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>