36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5963 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_5963  protein of unknown function DUF1036  100 
 
 		 151 aa  304  3e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5206  hypothetical protein  93.97 
 
 		 116 aa  231  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.224545  normal  0.192345 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0127  hypothetical protein  78.2 
 
 		 160 aa  226  6e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.90722  normal  0.376398 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2746  hypothetical protein  72.31 
 
 		 180 aa  207  3e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.306874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2973  protein of unknown function DUF1036  73.98 
 
 		 151 aa  205  2e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.914552 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4672  protein of unknown function DUF1036  65.69 
 
 		 194 aa  205  2e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1424  hypothetical protein  66.92 
 
 		 197 aa  204  3e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3981  hypothetical protein  68.29 
 
 		 197 aa  199  8e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.316948  normal  0.424983 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1219  hypothetical protein  62.59 
 
 		 194 aa  196  7e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.530921  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6868  hypothetical protein  64.66 
 
 		 195 aa  196  1.0000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.564815  normal  0.0261857 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0987  hypothetical protein  63.91 
 
 		 194 aa  195  2.0000000000000003e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.762572 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2868  protein of unknown function DUF1036  75.22 
 
 		 163 aa  195  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1403  hypothetical protein  66.1 
 
 		 196 aa  188  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.661083  normal  0.675418 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2064  hypothetical protein  64.41 
 
 		 182 aa  177  5.999999999999999e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3701  protein of unknown function DUF1036  58.57 
 
 		 143 aa  167  3e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0176708 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3233  hypothetical protein  56.25 
 
 		 146 aa  166  1e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1164  hypothetical protein  50 
 
 		 153 aa  152  1e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1689  hypothetical protein  50 
 
 		 153 aa  152  2e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.760794  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1749  hypothetical protein  50 
 
 		 153 aa  152  2e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3255  hypothetical protein  47.86 
 
 		 158 aa  148  3e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3691  hypothetical protein  50 
 
 		 204 aa  145  1.0000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.296318  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2677  hypothetical protein  53.54 
 
 		 145 aa  145  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.355095  normal  0.206179 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3290  protein of unknown function DUF1036  50 
 
 		 157 aa  144  6e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.772364  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3591  protein of unknown function DUF1036  54.47 
 
 		 157 aa  142  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.98491  normal  0.146301 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0134  hypothetical protein  50 
 
 		 121 aa  116  9e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2881  hypothetical protein  43.2 
 
 		 128 aa  111  4.0000000000000004e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.940085 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1587  integral membrane protein-like  43.22 
 
 		 146 aa  93.6  9e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.378927 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0296  hypothetical protein  33.33 
 
 		 333 aa  71.6  0.000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1886  integral membrane protein-like  33.06 
 
 		 357 aa  69.7  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0813  hypothetical protein  31.09 
 
 		 347 aa  63.5  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.780692  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0073  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.04 
 
 		 384 aa  57.4  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00557733 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0481  protease  31.03 
 
 		 371 aa  56.6  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.43704  normal  0.335547 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0679  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.75 
 
 		 318 aa  55.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0456  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.91 
 
 		 331 aa  52.8  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.954935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0632  hypothetical protein  29.6 
 
 		 339 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7330  hypothetical protein  27.93 
 
 		 372 aa  48.9  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.117708  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>