36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2677 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2677  hypothetical protein  100 
 
 		 145 aa  300  5.000000000000001e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.355095  normal  0.206179 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3290  protein of unknown function DUF1036  86.43 
 
 		 157 aa  259  8e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.772364  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3591  protein of unknown function DUF1036  90.84 
 
 		 157 aa  254  3e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.98491  normal  0.146301 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3691  hypothetical protein  80.43 
 
 		 204 aa  240  5e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.296318  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1164  hypothetical protein  69.12 
 
 		 153 aa  197  5e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1689  hypothetical protein  69.12 
 
 		 153 aa  194  2.0000000000000003e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.760794  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1749  hypothetical protein  69.12 
 
 		 153 aa  194  2.0000000000000003e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3255  hypothetical protein  61.19 
 
 		 158 aa  186  8e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1424  hypothetical protein  49.62 
 
 		 197 aa  144  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0127  hypothetical protein  49.19 
 
 		 160 aa  142  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.90722  normal  0.376398 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3981  hypothetical protein  49.25 
 
 		 197 aa  142  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.316948  normal  0.424983 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4672  protein of unknown function DUF1036  50 
 
 		 194 aa  141  3e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0987  hypothetical protein  48.09 
 
 		 194 aa  140  8e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.762572 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1219  hypothetical protein  50.38 
 
 		 194 aa  140  8e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.530921  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2746  hypothetical protein  49.24 
 
 		 180 aa  139  9e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.306874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6868  hypothetical protein  53.04 
 
 		 195 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.564815  normal  0.0261857 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2973  protein of unknown function DUF1036  49.24 
 
 		 151 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.914552 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2064  hypothetical protein  50.42 
 
 		 182 aa  137  7e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1403  hypothetical protein  51.79 
 
 		 196 aa  134  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.661083  normal  0.675418 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0134  hypothetical protein  57.43 
 
 		 121 aa  132  9.999999999999999e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5963  protein of unknown function DUF1036  54.46 
 
 		 151 aa  131  3e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2868  protein of unknown function DUF1036  52.68 
 
 		 163 aa  130  5e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5206  hypothetical protein  54.95 
 
 		 116 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.224545  normal  0.192345 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3233  hypothetical protein  47.66 
 
 		 146 aa  127  4.0000000000000003e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3701  protein of unknown function DUF1036  41.43 
 
 		 143 aa  121  4e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0176708 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2881  hypothetical protein  42.06 
 
 		 128 aa  105  3e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.940085 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1587  integral membrane protein-like  38.98 
 
 		 146 aa  85.9  2e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.378927 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1886  integral membrane protein-like  38.32 
 
 		 357 aa  73.6  0.0000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0296  hypothetical protein  32.76 
 
 		 333 aa  63.2  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0456  peptidoglycan binding domain-containing protein  27.93 
 
 		 331 aa  53.9  0.0000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.954935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7330  hypothetical protein  30.28 
 
 		 372 aa  53.1  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.117708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0813  hypothetical protein  27.03 
 
 		 347 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.780692  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0679  peptidoglycan binding domain-containing protein  28.57 
 
 		 318 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0632  hypothetical protein  27.78 
 
 		 339 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0073  peptidoglycan binding domain-containing protein  24.65 
 
 		 384 aa  47.8  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00557733 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0481  protease  24.14 
 
 		 371 aa  40.4  0.009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.43704  normal  0.335547 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>