36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3591 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_3591  protein of unknown function DUF1036  100 
 
 
157 aa  326  8e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.98491  normal  0.146301 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3290  protein of unknown function DUF1036  98.09 
 
 
157 aa  320  4e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.772364  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2677  hypothetical protein  87.86 
 
 
145 aa  264  2.9999999999999995e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.355095  normal  0.206179 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3691  hypothetical protein  76.82 
 
 
204 aa  246  6e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.296318  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1689  hypothetical protein  68.84 
 
 
153 aa  193  9e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.760794  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1749  hypothetical protein  68.84 
 
 
153 aa  193  9e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1164  hypothetical protein  68.12 
 
 
153 aa  192  1e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3255  hypothetical protein  60.9 
 
 
158 aa  184  5e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1424  hypothetical protein  47.48 
 
 
197 aa  144  5e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0127  hypothetical protein  48.89 
 
 
160 aa  142  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.90722  normal  0.376398 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4672  protein of unknown function DUF1036  45.64 
 
 
194 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2746  hypothetical protein  52.99 
 
 
180 aa  137  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.306874  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0987  hypothetical protein  46.92 
 
 
194 aa  137  7e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.762572 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2973  protein of unknown function DUF1036  47.73 
 
 
151 aa  136  1e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.914552 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6868  hypothetical protein  51.75 
 
 
195 aa  136  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.564815  normal  0.0261857 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3981  hypothetical protein  50.43 
 
 
197 aa  135  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.316948  normal  0.424983 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2064  hypothetical protein  49.58 
 
 
182 aa  135  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1403  hypothetical protein  51.79 
 
 
196 aa  135  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.661083  normal  0.675418 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0134  hypothetical protein  57.43 
 
 
121 aa  133  9e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5963  protein of unknown function DUF1036  55.36 
 
 
151 aa  133  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1219  hypothetical protein  50.43 
 
 
194 aa  132  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.530921  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2868  protein of unknown function DUF1036  51.79 
 
 
163 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5206  hypothetical protein  54.05 
 
 
116 aa  128  3e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.224545  normal  0.192345 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3233  hypothetical protein  45.31 
 
 
146 aa  127  8.000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3701  protein of unknown function DUF1036  43.57 
 
 
143 aa  120  9e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0176708 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2881  hypothetical protein  42.86 
 
 
128 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.940085 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1587  integral membrane protein-like  37.82 
 
 
146 aa  84.3  6e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.378927 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1886  integral membrane protein-like  35.58 
 
 
357 aa  72.4  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0296  hypothetical protein  30.95 
 
 
333 aa  63.9  0.0000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0456  peptidoglycan binding domain-containing protein  27.52 
 
 
331 aa  57.8  0.00000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.954935  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7330  hypothetical protein  30.17 
 
 
372 aa  55.1  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.117708  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0813  hypothetical protein  27.78 
 
 
347 aa  50.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.780692  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0679  peptidoglycan binding domain-containing protein  28.57 
 
 
318 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0632  hypothetical protein  25.74 
 
 
339 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0073  peptidoglycan binding domain-containing protein  26.36 
 
 
384 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00557733 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0481  protease  26.89 
 
 
371 aa  46.2  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.43704  normal  0.335547 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>