More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4193 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4193  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 
487 aa  974    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.161144  hitchhiker  0.00282421 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0041  aldehyde dehydrogenase  77 
 
 
484 aa  726    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0209129  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2213  Aldehyde Dehydrogenase  38.97 
 
 
499 aa  325  1e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273985 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0829  aldehyde dehydrogenase  38.16 
 
 
503 aa  325  2e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0391046  unclonable  0.0000197255 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1554  aldehyde dehydrogenase  37.65 
 
 
498 aa  323  3e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.220201 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0560  Aldehyde Dehydrogenase  37.35 
 
 
500 aa  322  9.000000000000001e-87  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1459  aldehyde dehydrogenase  36.81 
 
 
505 aa  322  9.999999999999999e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1222  aldehyde dehydrogenase  37.25 
 
 
497 aa  320  5e-86  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1702  Aldehyde Dehydrogenase  38.01 
 
 
498 aa  316  5e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3867  aldehyde dehydrogenase  36.16 
 
 
498 aa  315  1.9999999999999998e-84  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00214537  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1303  Aldehyde Dehydrogenase  40.16 
 
 
516 aa  311  2e-83  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3314  aldehyde dehydrogenase  38.26 
 
 
496 aa  296  6e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1496  NAD-dependent aldehyde dehydrogenases  34.67 
 
 
496 aa  295  1e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000254816  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0316  Aldehyde Dehydrogenase  37.11 
 
 
496 aa  286  5e-76  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2387  aldehyde dehydrogenase (NAD+)  35.11 
 
 
493 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.957539  normal  0.715084 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0383  Aldehyde Dehydrogenase  34.02 
 
 
493 aa  284  3.0000000000000004e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4431  Aldehyde Dehydrogenase  36.8 
 
 
483 aa  278  1e-73  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0589221  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0212  Aldehyde Dehydrogenase  33.33 
 
 
484 aa  276  6e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1253  Aldehyde Dehydrogenase  33.95 
 
 
493 aa  273  4.0000000000000004e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3632  aldehyde dehydrogenase family protein  35.43 
 
 
482 aa  271  2e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4209  Aldehyde Dehydrogenase  37.53 
 
 
483 aa  271  2e-71  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1826  aldehyde dehydrogenase  32.78 
 
 
485 aa  258  1e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.225626 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3763  aldehyde dehydrogenase  33.68 
 
 
481 aa  257  3e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0544  aldehyde dehydrogenase  38 
 
 
482 aa  256  5e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.292442  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4482  Aldehyde Dehydrogenase  35 
 
 
479 aa  254  2.0000000000000002e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0437923  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2635  Aldehyde Dehydrogenase  37.53 
 
 
474 aa  252  1e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.311715 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4351  aldehyde dehydrogenase  33.06 
 
 
491 aa  249  6e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0442  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  37.47 
 
 
488 aa  246  6e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5802  aldehyde dehydrogenase  32.5 
 
 
480 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5803  Aldehyde Dehydrogenase  34.23 
 
 
480 aa  246  9e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.164732  normal  0.396611 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1357  betaine-aldehyde dehydrogenase  33.13 
 
 
480 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.368184  normal  0.825895 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1779  aldehyde dehydrogenase  33.26 
 
 
485 aa  245  1.9999999999999999e-63  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0859  Aldehyde Dehydrogenase  34.44 
 
 
478 aa  241  2e-62  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1319  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  34.01 
 
 
489 aa  238  3e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0129024  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3439  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  35.39 
 
 
493 aa  236  8e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.383483  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4047  Aldehyde Dehydrogenase  38.26 
 
 
468 aa  234  3e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0301  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase (acylating)  32.51 
 
 
487 aa  231  2e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2297  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase (acylating)  32.74 
 
 
487 aa  229  7e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2529  methylmalonic acid semialdehyde dehydrogenase  32.74 
 
 
487 aa  229  7e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000279037 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2801  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  33.86 
 
 
486 aa  229  8e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6789  Aldehyde Dehydrogenase  35.48 
 
 
495 aa  229  9e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.772669  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2125  Aldehyde Dehydrogenase  33.89 
 
 
488 aa  229  9e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2334  methylmalonic acid semialdehyde dehydrogenase  32.74 
 
 
487 aa  229  1e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.777066  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2513  methylmalonic acid semialdehyde dehydrogenase  32.74 
 
 
487 aa  229  1e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2240  Aldehyde Dehydrogenase  33.81 
 
 
482 aa  228  2e-58  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.455066  normal  0.336013 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1958  aldehyde dehydrogenase  32.67 
 
 
479 aa  228  3e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0277  aldehyde dehydrogenase  32.14 
 
 
477 aa  227  4e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.872601  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2217  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  33.41 
 
 
488 aa  227  4e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2161  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  32.66 
 
 
486 aa  225  1e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.017881  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3233  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  34.7 
 
 
493 aa  226  1e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.436611  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2673  aldehyde dehydrogenase family protein  34.85 
 
 
493 aa  225  2e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0828689  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3004  methylmalonic acid semialdehyde dehydrogenase  32.66 
 
 
486 aa  224  3e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.18708 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0814  Aldehyde Dehydrogenase  33.26 
 
 
480 aa  223  4.9999999999999996e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.350858  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2262  aldehyde dehydrogenase  34.62 
 
 
493 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2084  aldehyde dehydrogenase  34.93 
 
 
493 aa  223  6e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3974  aldehyde dehydrogenase  32.14 
 
 
475 aa  223  6e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3646  aldehyde dehydrogenase family protein  34.93 
 
 
493 aa  223  7e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.196663 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2320  methylmalonic acid semialdehyde dehydrogenase  32.66 
 
 
486 aa  223  7e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1729  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  31.98 
 
 
486 aa  223  7e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2253  methylmalonic acid semialdehyde dehydrogenase  31.98 
 
 
488 aa  223  8e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2257  aldehyde dehydrogenase  34.4 
 
 
493 aa  223  9e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2407  aldehyde dehydrogenase  34.4 
 
 
493 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.830868  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2193  methylmalonic acid semialdehyde dehydrogenase  32.43 
 
 
486 aa  222  1.9999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0440978  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2130  methylmalonic acid semialdehyde dehydrogenase  32.43 
 
 
486 aa  222  1.9999999999999999e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000408712  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2373  methylmalonic acid semialdehyde dehydrogenase  32.43 
 
 
486 aa  222  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2354  methylmalonic acid semialdehyde dehydrogenase  32.43 
 
 
486 aa  222  1.9999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2116  methylmalonic acid semialdehyde dehydrogenase  32.21 
 
 
486 aa  221  3e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.230403  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0577  aldehyde dehydrogenase  32.99 
 
 
483 aa  221  3e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2382  methylmalonic acid semialdehyde dehydrogenase  32.21 
 
 
486 aa  220  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.313113  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0292  hypothetical protein  33.85 
 
 
488 aa  220  5e-56  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1856  aldehyde dehydrogenase  32.99 
 
 
488 aa  220  5e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2455  methylmalonic acid semialdehyde dehydrogenase  32.21 
 
 
486 aa  219  6e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.91337  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1119  aldehyde dehydrogenase  35.32 
 
 
479 aa  219  7.999999999999999e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.65747 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2434  NADP-dependent glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase  29.26 
 
 
482 aa  219  8.999999999999998e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0210  aldehyde dehydrogenase family protein  31.7 
 
 
477 aa  219  1e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0308  hypothetical protein  32.89 
 
 
488 aa  219  1e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2774  succinic semialdehyde dehydrogenase  33.48 
 
 
486 aa  219  1e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5935  aldehyde dehydrogenase  33.1 
 
 
476 aa  218  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1478  aldehyde dehydrogenase  32.18 
 
 
481 aa  218  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.696903  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1418  betaine-aldehyde dehydrogenase  32.44 
 
 
477 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00255167  normal  0.0518765 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1691  succinic semialdehyde dehydrogenase  33.48 
 
 
484 aa  218  2.9999999999999998e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.943711  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3333  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  35.02 
 
 
521 aa  217  4e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.000000027969 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2720  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  35.71 
 
 
496 aa  217  4e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.133505  normal  0.10056 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4824  aldehyde dehydrogenase  32.58 
 
 
492 aa  217  4e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00512486  normal  0.364288 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2524  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  32.8 
 
 
509 aa  217  4e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.70277  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3173  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  33.11 
 
 
486 aa  217  5e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.235174  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0201  aldehyde dehydrogenase family protein  31.47 
 
 
477 aa  216  5.9999999999999996e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1641  putative delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  31.25 
 
 
525 aa  216  5.9999999999999996e-55  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2748  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  28.76 
 
 
482 aa  216  5.9999999999999996e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4941  betaine-aldehyde dehydrogenase  35.32 
 
 
498 aa  216  8e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4477  aldehyde dehydrogenase  31.64 
 
 
498 aa  214  2.9999999999999995e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.749064  normal 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4697  aldehyde dehydrogenase  33.56 
 
 
496 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.754003  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1164  betaine-aldehyde dehydrogenase  33.33 
 
 
512 aa  213  9e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.278559  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0213  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  33.04 
 
 
480 aa  212  1e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.246043 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2837  Aldehyde Dehydrogenase  31.2 
 
 
502 aa  212  1e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3493  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.68 
 
 
483 aa  212  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.348419  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2474  succinic semialdehyde dehydrogenase  30.77 
 
 
487 aa  211  2e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.353671  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1597  succinate semialdehyde dehydrogenase  34.35 
 
 
496 aa  211  2e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.263811  normal  0.212402 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0759  nonphosphorylating glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase  33.61 
 
 
484 aa  211  2e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0247006  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0228  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  32.82 
 
 
480 aa  211  3e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.927727 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>