More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4053 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4053  acetylglutamate kinase  100 
 
 
261 aa  506  9.999999999999999e-143  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.183035  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3361  acetylglutamate kinase  85.44 
 
 
259 aa  398  9.999999999999999e-111  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.121168  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4143  acetylglutamate kinase  57.38 
 
 
248 aa  232  4.0000000000000004e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0350  acetylglutamate kinase  51.02 
 
 
254 aa  207  1e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000201879 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4380  acetylglutamate kinase  41.39 
 
 
301 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.114818 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43249  predicted protein  42.08 
 
 
330 aa  169  4e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2729  acetylglutamate kinase  42.59 
 
 
293 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.070794 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1068  acetylglutamate kinase  42.59 
 
 
293 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2865  acetylglutamate kinase  43.35 
 
 
292 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3560  acetylglutamate kinase  42.28 
 
 
290 aa  165  5.9999999999999996e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02900  acetylglutamate kinase  40.44 
 
 
300 aa  162  8.000000000000001e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1203  acetylglutamate kinase  39.69 
 
 
294 aa  160  1e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00815716 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0256  acetylglutamate kinase  43.46 
 
 
290 aa  161  1e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0433  acetylglutamate kinase  43.46 
 
 
290 aa  161  1e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.394347  hitchhiker  0.0000000109203 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0082  acetylglutamate kinase  39.56 
 
 
301 aa  160  2e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0218  acetylglutamate kinase  39.56 
 
 
301 aa  160  2e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3297  acetylglutamate kinase  41.06 
 
 
303 aa  160  2e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0738  acetylglutamate kinase  43.16 
 
 
257 aa  160  3e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0640766  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6099  acetylglutamate kinase  39.78 
 
 
301 aa  160  3e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0780503  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0621  acetylglutamate kinase  39.27 
 
 
302 aa  159  4e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  unclonable  0.00000000000196007 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0104  acetylglutamate kinase  41.94 
 
 
295 aa  159  4e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.806574  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3479  acetylglutamate kinase  40.65 
 
 
306 aa  159  5e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0564956  normal  0.537456 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0084  acetylglutamate kinase  41.7 
 
 
304 aa  159  6e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0633  acetylglutamate kinase  42.55 
 
 
285 aa  158  7e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0182  acetylglutamate kinase  38.6 
 
 
301 aa  157  1e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0306646  hitchhiker  0.000000157401 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2781  acetylglutamate kinase  41.8 
 
 
300 aa  157  2e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3330  acetylglutamate kinase  39.77 
 
 
305 aa  157  2e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.147011 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5339  acetylglutamate kinase  38.6 
 
 
301 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.866501  hitchhiker  0.00605357 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3982  acetylglutamate kinase  40.74 
 
 
305 aa  157  2e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5289  acetylglutamate kinase  38.24 
 
 
301 aa  156  3e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.92163 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5198  acetylglutamate kinase  38.24 
 
 
301 aa  156  3e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.934726  normal  0.307512 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1321  acetylglutamate kinase  41.56 
 
 
296 aa  156  3e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.463012 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70280  acetylglutamate kinase  39.42 
 
 
301 aa  156  3e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0568  acetylglutamate kinase  41.15 
 
 
301 aa  156  4e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0588  acetylglutamate kinase  41.15 
 
 
296 aa  155  4e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.633832  normal  0.230992 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0180  acetylglutamate kinase  39.92 
 
 
309 aa  155  5.0000000000000005e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1226  acetylglutamate kinase  40.65 
 
 
296 aa  155  7e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5543  acetylglutamate kinase  40.24 
 
 
301 aa  155  8e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0140  acetylglutamate kinase  39.51 
 
 
344 aa  154  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0749115 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1730  acetylglutamate kinase  40.33 
 
 
300 aa  154  2e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0464  acetylglutamate kinase  40.71 
 
 
295 aa  154  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2984  N-acetylglutamate kinase  38.66 
 
 
306 aa  154  2e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.492788  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1041  acetylglutamate kinase  39.57 
 
 
282 aa  153  2e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0274311  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1326  acetylglutamate kinase  40.56 
 
 
301 aa  153  2e-36  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2995  acetylglutamate kinase  38.46 
 
 
301 aa  153  2.9999999999999998e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1641  acetylglutamate kinase  40.32 
 
 
295 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0075  acetylglutamate kinase  40.16 
 
 
295 aa  153  2.9999999999999998e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4139  acetylglutamate kinase  39.09 
 
 
296 aa  153  2.9999999999999998e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.9539  hitchhiker  0.00000200653 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1164  acetylglutamate kinase  42.04 
 
 
300 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.113745  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0033  acetylglutamate kinase  39.92 
 
 
310 aa  152  4e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0185  acetylglutamate kinase  37.97 
 
 
292 aa  152  4e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3230  acetylglutamate kinase  40.49 
 
 
294 aa  152  4e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0773  acetylglutamate kinase  39.09 
 
 
297 aa  152  4e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1071  acetylglutamate kinase  39.57 
 
 
282 aa  152  4e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0437011  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3675  acetylglutamate kinase  38.46 
 
 
300 aa  152  5e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0797606  normal  0.0933841 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7329  acetylglutamate kinase  39.47 
 
 
298 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645386  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0539  acetylglutamate kinase  39.92 
 
 
303 aa  152  5.9999999999999996e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22020  N-acetylglutamate kinase  40 
 
 
330 aa  152  7e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.869961  decreased coverage  0.00246187 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0086  acetylglutamate kinase  39.36 
 
 
295 aa  151  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2621  acetylglutamate kinase  40.56 
 
 
298 aa  151  1e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0678898 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2342  acetylglutamate kinase  40.56 
 
 
298 aa  151  1e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.791434  normal  0.660777 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0338  acetylglutamate kinase  39.09 
 
 
299 aa  150  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4385  acetylglutamate kinase  39.09 
 
 
299 aa  150  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.614022  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0380  acetylglutamate kinase  40.16 
 
 
312 aa  150  2e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2297  acetylglutamate kinase  40.16 
 
 
298 aa  150  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.719983  normal  0.313323 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0195  acetylglutamate kinase  38.68 
 
 
299 aa  149  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3249  acetylglutamate kinase  38.68 
 
 
299 aa  149  3e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.219346  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0064  acetylglutamate kinase  39.09 
 
 
299 aa  150  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.207968  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2413  acetylglutamate kinase  39.76 
 
 
296 aa  150  3e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3438  acetylglutamate kinase  38.68 
 
 
299 aa  149  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0160  acetylglutamate kinase  39.09 
 
 
355 aa  149  3e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0499  acetylglutamate kinase  39.09 
 
 
304 aa  150  3e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.600707 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0880  acetylglutamate kinase  43.22 
 
 
304 aa  150  3e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00277635  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0185  acetylglutamate kinase  38.68 
 
 
351 aa  149  4e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.651482  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1351  acetylglutamate kinase  38.75 
 
 
283 aa  149  4e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0380  acetylglutamate kinase  38.68 
 
 
351 aa  149  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.734124  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1899  acetylglutamate kinase  37.96 
 
 
304 aa  149  4e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2179  acetylglutamate kinase  38.68 
 
 
351 aa  149  4e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0814  acetylglutamate kinase  39.47 
 
 
298 aa  149  4e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.94029 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2910  acetylglutamate kinase  38.68 
 
 
351 aa  149  4e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.290051  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2013  acetylglutamate kinase  39.09 
 
 
300 aa  149  5e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3095  acetylglutamate kinase  44.31 
 
 
302 aa  149  5e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3394  acetylglutamate kinase  38.27 
 
 
308 aa  149  6e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3717  acetylglutamate kinase  38.27 
 
 
308 aa  149  6e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1697  acetylglutamate kinase  38.4 
 
 
299 aa  148  7e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3005  acetylglutamate kinase  38.27 
 
 
299 aa  149  7e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.68107 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0071  acetylglutamate kinase  38.96 
 
 
295 aa  148  8e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.428546  normal  0.0291112 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3092  acetylglutamate kinase  38.68 
 
 
321 aa  148  8e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.144382 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0539  acetylglutamate kinase  36.33 
 
 
288 aa  148  9e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000417739  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0190  acetylglutamate kinase  45.42 
 
 
260 aa  148  9e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6447  acetylglutamate kinase  38.27 
 
 
299 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.635335  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2255  acetylglutamate kinase  38.68 
 
 
294 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0153182  hitchhiker  0.00000292258 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3112  acetylglutamate kinase  38.27 
 
 
299 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.421465 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2482  acetylglutamate kinase  38.27 
 
 
321 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0753356  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2289  acetylglutamate kinase  37.34 
 
 
287 aa  147  1.0000000000000001e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.99529  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3143  acetylglutamate kinase  38.27 
 
 
344 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.537624  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3096  acetylglutamate kinase  38.27 
 
 
321 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0983385  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2910  acetylglutamate kinase  43.09 
 
 
301 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.872032  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0659  acetylglutamate kinase  36.82 
 
 
299 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1595  acetylglutamate kinase  44.66 
 
 
258 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>