76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0068 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0068  transposase, IS4 family protein  100 
 
 		 397 aa  774    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.974421  normal  0.334707 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2872  transposase IS4 family protein  45.84 
 
 		 414 aa  263  4.999999999999999e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2890  transposase IS4 family protein  45.84 
 
 		 414 aa  263  4.999999999999999e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0289371  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3071  transposase IS4 family protein  45.84 
 
 		 414 aa  263  4.999999999999999e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.52529  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3220  transposase IS4 family protein  45.84 
 
 		 414 aa  263  4.999999999999999e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.390647  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3427  transposase IS4 family protein  45.84 
 
 		 414 aa  263  4.999999999999999e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000920727  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3532  transposase IS4 family protein  45.84 
 
 		 414 aa  263  4.999999999999999e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000268669  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3610  transposase IS4 family protein  45.84 
 
 		 414 aa  263  4.999999999999999e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3831  transposase IS4 family protein  45.84 
 
 		 414 aa  263  4.999999999999999e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000386672  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4720  transposase IS4 family protein  45.84 
 
 		 414 aa  263  4.999999999999999e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.370488  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1934  transposase IS4 family protein  45.84 
 
 		 414 aa  263  4.999999999999999e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000387173  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1209  transposase IS4 family protein  45.84 
 
 		 414 aa  263  4.999999999999999e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0722892  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2461  transposase IS4 family protein  45.84 
 
 		 414 aa  263  4.999999999999999e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.250425  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0848  transposase IS4 family protein  45.84 
 
 		 414 aa  263  4.999999999999999e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.253852  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4089  transposase IS4 family protein  45.31 
 
 		 401 aa  252  9.000000000000001e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.034496  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3939  transposase IS4 family protein  45.11 
 
 		 401 aa  251  2e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1094  transposase IS4 family protein  45.11 
 
 		 401 aa  251  2e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0885817  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1039  hypothetical protein  42.86 
 
 		 144 aa  97.4  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2039  transposase IS4 family protein  29.21 
 
 		 378 aa  85.9  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3158  transposase, IS4 family protein  32.07 
 
 		 416 aa  80.9  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1486  hypothetical protein  31.22 
 
 		 417 aa  75.9  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0444  transposase, IS4 family protein  28.5 
 
 		 372 aa  76.3  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000119461  normal  0.0439577 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4456  hypothetical protein  30.92 
 
 		 417 aa  66.6  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.185829 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1598  hypothetical protein  29.77 
 
 		 417 aa  65.5  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0411  transposase IS4 family protein  25.49 
 
 		 383 aa  65.5  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.215728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0405  transposase IS4 family protein  25.49 
 
 		 383 aa  65.5  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00559123 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1809  transposase IS4 family protein  21.09 
 
 		 384 aa  64.3  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1100  transposase IS4 family protein  21.09 
 
 		 384 aa  64.3  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4464  transposase IS4 family protein  21.09 
 
 		 384 aa  64.3  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4489  transposase IS4 family protein  21.09 
 
 		 384 aa  64.3  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4499  transposase IS4 family protein  21.09 
 
 		 384 aa  64.3  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4514  transposase IS4 family protein  21.09 
 
 		 384 aa  64.3  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.810745  normal  0.887559 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4536  transposase IS4 family protein  21.09 
 
 		 384 aa  64.3  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.0600651  normal  0.65428 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4552  transposase IS4 family protein  21.09 
 
 		 384 aa  64.3  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3922  transposase IS4 family protein  21.09 
 
 		 384 aa  64.3  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2048  transposase IS4 family protein  21.09 
 
 		 384 aa  64.3  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2792  transposase IS4 family protein  21.09 
 
 		 384 aa  64.3  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3046  transposase IS4 family protein  21.09 
 
 		 384 aa  64.3  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3398  transposase IS4 family protein  21.09 
 
 		 384 aa  64.3  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5516  transposase IS4 family protein  21.05 
 
 		 387 aa  60.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.378571 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5389  transposase IS4 family protein  21.05 
 
 		 387 aa  60.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3112  transposase IS4 family protein  28.16 
 
 		 398 aa  60.5  0.00000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2547  hypothetical protein  28.84 
 
 		 417 aa  59.3  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0495707  normal  0.214927 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1040  hypothetical protein  41.56 
 
 		 102 aa  58.2  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0863  transposase, IS4  27.92 
 
 		 402 aa  57.8  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.174344  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1387  transposase, IS4  27.92 
 
 		 402 aa  57.8  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1943  transposase, IS4  27.92 
 
 		 420 aa  57.4  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2690  hypothetical protein  28.99 
 
 		 649 aa  56.6  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1067  hypothetical protein  32.52 
 
 		 140 aa  56.6  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2598  transposase, IS4  27.92 
 
 		 402 aa  56.2  0.0000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2744  transposase, IS4  27.92 
 
 		 402 aa  56.2  0.0000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3451  transposase, IS4  27.92 
 
 		 402 aa  56.2  0.0000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4509  hypothetical protein  29.3 
 
 		 417 aa  55.8  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.326946 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1846  transposase, IS4  27.92 
 
 		 402 aa  56.2  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.79186  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2740  transposase, IS4  27.92 
 
 		 402 aa  56.2  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1945  transposase, IS4  27.92 
 
 		 420 aa  55.1  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4105  transposase IS4 family protein  27.15 
 
 		 384 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0978  hypothetical protein  29.69 
 
 		 417 aa  54.7  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.764358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2292  hypothetical protein  30.6 
 
 		 185 aa  54.3  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1754  hypothetical protein  28.99 
 
 		 417 aa  53.9  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.467768 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4535  transposase IS4 family protein  23.97 
 
 		 365 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3051  IS4 family transposase  25.47 
 
 		 335 aa  51.2  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3040  IS4 family transposase  25.47 
 
 		 335 aa  51.2  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1919  transposase IS4 family protein  24.7 
 
 		 400 aa  50.1  0.00007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.035581  normal  0.0427868 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2062  transposase, IS4  25 
 
 		 400 aa  48.9  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3325  transposase, IS4  25 
 
 		 400 aa  48.9  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2960  transposase, IS4  25 
 
 		 400 aa  48.9  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0212641  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2254  transposase, IS4  25 
 
 		 400 aa  48.9  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1473  transposase, IS4  25 
 
 		 400 aa  48.9  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3489  transposase, IS4  24.75 
 
 		 310 aa  47.4  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0461  transposase, IS4 family protein  24.29 
 
 		 400 aa  46.6  0.0008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2240  IS4 family transposase  23.89 
 
 		 400 aa  46.6  0.0008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0969816  normal  0.0243292 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0869  transposase IS4 family protein  25.65 
 
 		 418 aa  44.7  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4911  IS4 family transposase  20.87 
 
 		 275 aa  43.9  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0145672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1658  transposase, IS4 family protein  34.57 
 
 		 220 aa  43.1  0.008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0196092  normal  0.138544 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1916  transposase IS4 family protein  24.19 
 
 		 400 aa  43.1  0.009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.511256  normal  0.075627 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>