51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_3040 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_3040  IS4 family transposase  100 
 
 		 335 aa  678    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3051  IS4 family transposase  100 
 
 		 335 aa  678    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4720  transposase IS4 family protein  23.47 
 
 		 414 aa  53.1  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.370488  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0848  transposase IS4 family protein  23.47 
 
 		 414 aa  53.1  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.253852  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1209  transposase IS4 family protein  23.47 
 
 		 414 aa  53.1  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0722892  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1934  transposase IS4 family protein  23.47 
 
 		 414 aa  53.1  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000387173  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2461  transposase IS4 family protein  23.47 
 
 		 414 aa  53.1  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.250425  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2872  transposase IS4 family protein  23.47 
 
 		 414 aa  53.1  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2890  transposase IS4 family protein  23.47 
 
 		 414 aa  53.1  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0289371  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3071  transposase IS4 family protein  23.47 
 
 		 414 aa  53.1  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.52529  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3220  transposase IS4 family protein  23.47 
 
 		 414 aa  53.1  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.390647  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3427  transposase IS4 family protein  23.47 
 
 		 414 aa  53.1  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000920727  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3532  transposase IS4 family protein  23.47 
 
 		 414 aa  53.1  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000268669  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3610  transposase IS4 family protein  23.47 
 
 		 414 aa  53.1  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3831  transposase IS4 family protein  23.47 
 
 		 414 aa  53.1  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000386672  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0068  transposase, IS4 family protein  24.84 
 
 		 397 aa  51.2  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.974421  normal  0.334707 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2062  transposase, IS4  34.88 
 
 		 400 aa  47.4  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1473  transposase, IS4  34.88 
 
 		 400 aa  47.4  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2254  transposase, IS4  34.88 
 
 		 400 aa  47.4  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2960  transposase, IS4  34.88 
 
 		 400 aa  47.4  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0212641  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3325  transposase, IS4  34.88 
 
 		 400 aa  47.4  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0820  transposase  37.84 
 
 		 402 aa  46.2  0.0008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00771423  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4777  IS10 transposase  37.84 
 
 		 402 aa  46.2  0.0008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.271469  normal  0.676926 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1603  IS10 transposase  37.84 
 
 		 402 aa  46.2  0.0008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3489  transposase, IS4  34.88 
 
 		 310 aa  46.2  0.0009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2715  IS10 transposase  36.49 
 
 		 402 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0337  IS10 transposase  36.49 
 
 		 402 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4716  transposase (IS4 family)  36.49 
 
 		 402 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.189582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0524  IS10 transposase  36.49 
 
 		 402 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.661315  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2541  IS10, transposase  36.49 
 
 		 402 aa  45.8  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  6.2795e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1590  IS10 transposase  36.49 
 
 		 402 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3046  IS10 transposase  36.49 
 
 		 402 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3181  IS10 transposase  36.49 
 
 		 402 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4558  IS10 transposase  36.49 
 
 		 402 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1658  transposase, IS4 family protein  32.18 
 
 		 220 aa  45.1  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0196092  normal  0.138544 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1943  transposase, IS4  30.69 
 
 		 420 aa  44.7  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1094  transposase IS4 family protein  23.47 
 
 		 401 aa  44.3  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0885817  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3939  transposase IS4 family protein  23.47 
 
 		 401 aa  44.3  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0863  transposase, IS4  34.15 
 
 		 402 aa  44.3  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.174344  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1387  transposase, IS4  34.15 
 
 		 402 aa  44.3  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2240  IS4 family transposase  26.97 
 
 		 400 aa  44.3  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0969816  normal  0.0243292 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1945  transposase, IS4  24.67 
 
 		 420 aa  43.9  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3451  transposase, IS4  24.67 
 
 		 402 aa  43.9  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4089  transposase IS4 family protein  24.87 
 
 		 401 aa  43.9  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.034496  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2744  transposase, IS4  24.67 
 
 		 402 aa  43.9  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2740  transposase, IS4  24.5 
 
 		 402 aa  43.9  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1846  transposase, IS4  24.5 
 
 		 402 aa  43.9  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.79186  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2598  transposase, IS4  24.67 
 
 		 402 aa  43.9  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0461  transposase, IS4 family protein  35.71 
 
 		 400 aa  43.5  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1919  transposase IS4 family protein  35.71 
 
 		 400 aa  43.5  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.035581  normal  0.0427868 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4535  transposase IS4 family protein  28.42 
 
 		 365 aa  42.7  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>