201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1387 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008228  Patl_0863  transposase, IS4  100 
 
 
402 aa  830    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.174344  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1387  transposase, IS4  100 
 
 
402 aa  830    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1846  transposase, IS4  98.51 
 
 
402 aa  818    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.79186  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1943  transposase, IS4  98.76 
 
 
420 aa  820    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1945  transposase, IS4  98.51 
 
 
420 aa  820    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2598  transposase, IS4  98.76 
 
 
402 aa  819    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2740  transposase, IS4  98.51 
 
 
402 aa  818    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2744  transposase, IS4  98.76 
 
 
402 aa  819    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3451  transposase, IS4  98.76 
 
 
402 aa  819    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1473  transposase, IS4  70.4 
 
 
400 aa  589  1e-167  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2062  transposase, IS4  70.4 
 
 
400 aa  589  1e-167  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2254  transposase, IS4  70.4 
 
 
400 aa  589  1e-167  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2960  transposase, IS4  70.4 
 
 
400 aa  589  1e-167  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0212641  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3325  transposase, IS4  70.4 
 
 
400 aa  589  1e-167  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2240  IS4 family transposase  70.65 
 
 
400 aa  590  1e-167  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0969816  normal  0.0243292 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1919  transposase IS4 family protein  70.15 
 
 
400 aa  586  1e-166  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.035581  normal  0.0427868 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0461  transposase, IS4 family protein  70.15 
 
 
400 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1916  transposase IS4 family protein  69.65 
 
 
400 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.511256  normal  0.075627 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06074  hypothetical protein  55.78 
 
 
399 aa  458  9.999999999999999e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08194  transposase  55.53 
 
 
399 aa  456  1e-127  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  0.679296  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01470  hypothetical protein  55.53 
 
 
399 aa  456  1e-127  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01664  hypothetical protein  55.53 
 
 
399 aa  456  1e-127  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02007  hypothetical protein  55.78 
 
 
399 aa  457  1e-127  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02009  hypothetical protein  55.78 
 
 
405 aa  457  1e-127  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02494  hypothetical protein  55.78 
 
 
399 aa  457  1e-127  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02811  hypothetical protein  55.53 
 
 
399 aa  456  1e-127  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05054  hypothetical protein  55.78 
 
 
399 aa  457  1e-127  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05982  hypothetical protein  55.78 
 
 
399 aa  457  1e-127  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01925  hypothetical protein  55.28 
 
 
399 aa  453  1.0000000000000001e-126  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02579  hypothetical protein  55.03 
 
 
399 aa  452  1.0000000000000001e-126  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3489  transposase, IS4  67.95 
 
 
310 aa  434  1e-120  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4716  transposase (IS4 family)  53.12 
 
 
402 aa  408  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.189582  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1603  IS10 transposase  53.12 
 
 
402 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4777  IS10 transposase  53.12 
 
 
402 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.271469  normal  0.676926 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0524  IS10 transposase  53.12 
 
 
402 aa  408  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.661315  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2541  IS10, transposase  53.12 
 
 
402 aa  408  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  6.2795e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2715  IS10 transposase  53.12 
 
 
402 aa  408  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3046  IS10 transposase  53.12 
 
 
402 aa  408  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3181  IS10 transposase  53.12 
 
 
402 aa  408  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4558  IS10 transposase  53.12 
 
 
402 aa  408  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0820  transposase  53.12 
 
 
402 aa  407  1.0000000000000001e-112  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00771423  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0337  IS10 transposase  53.12 
 
 
402 aa  408  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1590  IS10 transposase  53.12 
 
 
402 aa  408  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1949  putative transposase  98.95 
 
 
224 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.307515  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05883  hypothetical protein  56.4 
 
 
346 aa  397  1e-109  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02577  hypothetical protein  56.37 
 
 
312 aa  374  1e-102  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0146  ISSod3, transposase  49.1 
 
 
404 aa  361  2e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0731  ISSod3, transposase  49.1 
 
 
404 aa  361  2e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1541  ISSod3, transposase  49.1 
 
 
404 aa  361  2e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1974  ISSod3, transposase  49.1 
 
 
404 aa  361  2e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2226  ISSod3, transposase  49.1 
 
 
404 aa  361  2e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2283  ISSod3, transposase  49.1 
 
 
404 aa  361  2e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3567  ISSod3, transposase  49.1 
 
 
404 aa  361  2e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3625  ISSod3, transposase  49.1 
 
 
404 aa  361  2e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4000  ISSod3, transposase  49.1 
 
 
404 aa  361  2e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4239  ISSod3, transposase  49.1 
 
 
404 aa  361  2e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4437  ISSod3, transposase  49.1 
 
 
404 aa  361  2e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0102  ISSod3, transposase  49.1 
 
 
404 aa  361  2e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0136  ISSod3, transposase  49.1 
 
 
404 aa  361  2e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3499  ISSod3, transposase  48.84 
 
 
404 aa  359  4e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1244  ISSod3, transposase  48.84 
 
 
404 aa  358  6e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2465  IS4 family transposase  48.58 
 
 
404 aa  357  9.999999999999999e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000609587  hitchhiker  0.0000155014 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4432  ISSod3, transposase  48.58 
 
 
404 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1636  transposase, IS4 family protein  48.32 
 
 
460 aa  356  5e-97  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4275.4  transposase  50.78 
 
 
334 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1658  transposase, IS4 family protein  64.44 
 
 
220 aa  282  6.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0196092  normal  0.138544 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06245  hypothetical protein  58.22 
 
 
238 aa  278  1e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00244  hypothetical protein  37.4 
 
 
397 aa  260  3e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06221  hypothetical protein  37.4 
 
 
397 aa  259  6e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00147  transposase  37.4 
 
 
385 aa  259  6e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05129  hypothetical protein  37.4 
 
 
397 aa  259  6e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05114  hypothetical protein  37.4 
 
 
397 aa  259  6e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06040  hypothetical protein  37.4 
 
 
397 aa  259  7e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03453  hypothetical protein  37.4 
 
 
397 aa  259  7e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05616  hypothetical protein  37.4 
 
 
397 aa  259  7e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03320  hypothetical protein  37.4 
 
 
397 aa  259  7e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03107  hypothetical protein  37.4 
 
 
397 aa  259  7e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05840  hypothetical protein  37.4 
 
 
397 aa  259  7e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06201  hypothetical protein  37.4 
 
 
397 aa  259  7e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00547  hypothetical protein  37.4 
 
 
397 aa  259  7e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00551  hypothetical protein  37.4 
 
 
397 aa  259  7e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00587  hypothetical protein  37.4 
 
 
397 aa  259  7e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00840  hypothetical protein  37.4 
 
 
397 aa  259  7e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06075  hypothetical protein  37.4 
 
 
397 aa  259  7e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06470  hypothetical protein  37.4 
 
 
397 aa  259  7e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06585  hypothetical protein  37.4 
 
 
397 aa  259  7e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06459  hypothetical protein  37.4 
 
 
397 aa  259  7e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01679  hypothetical protein  37.4 
 
 
397 aa  259  7e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06782  hypothetical protein  37.4 
 
 
397 aa  259  7e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07009  hypothetical protein  37.4 
 
 
397 aa  259  7e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06908  hypothetical protein  37.4 
 
 
397 aa  259  7e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02408  hypothetical protein  37.4 
 
 
397 aa  259  7e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02480  hypothetical protein  37.4 
 
 
397 aa  259  7e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05898  hypothetical protein  37.4 
 
 
397 aa  259  7e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02550  hypothetical protein  37.4 
 
 
397 aa  259  7e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05081  hypothetical protein  37.4 
 
 
397 aa  259  7e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05605  hypothetical protein  37.4 
 
 
397 aa  259  7e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05431  hypothetical protein  37.4 
 
 
397 aa  259  7e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02684  hypothetical protein  37.4 
 
 
397 aa  259  7e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06347  hypothetical protein  37.4 
 
 
397 aa  259  7e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>