83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_3112 on replicon NC_009939
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009939  Dgeo_3112  transposase IS4 family protein  100 
 
 
398 aa  804    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2039  transposase IS4 family protein  33.53 
 
 
378 aa  149  7e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0405  transposase IS4 family protein  33.69 
 
 
383 aa  137  4e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00559123 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0411  transposase IS4 family protein  33.69 
 
 
383 aa  137  4e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.215728  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0444  transposase, IS4 family protein  24.7 
 
 
372 aa  79.7  0.00000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000119461  normal  0.0439577 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3158  transposase, IS4 family protein  27.1 
 
 
416 aa  70.5  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4514  transposase IS4 family protein  25.25 
 
 
384 aa  68.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.810745  normal  0.887559 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4535  transposase IS4 family protein  27.89 
 
 
365 aa  68.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3922  transposase IS4 family protein  25.25 
 
 
384 aa  68.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3398  transposase IS4 family protein  25.25 
 
 
384 aa  68.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3046  transposase IS4 family protein  25.25 
 
 
384 aa  68.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2792  transposase IS4 family protein  25.25 
 
 
384 aa  68.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2048  transposase IS4 family protein  25.25 
 
 
384 aa  68.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1809  transposase IS4 family protein  25.25 
 
 
384 aa  68.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1100  transposase IS4 family protein  25.25 
 
 
384 aa  68.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4552  transposase IS4 family protein  25.25 
 
 
384 aa  68.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4536  transposase IS4 family protein  25.25 
 
 
384 aa  68.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.0600651  normal  0.65428 
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4464  transposase IS4 family protein  25.25 
 
 
384 aa  68.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4489  transposase IS4 family protein  25.25 
 
 
384 aa  68.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4499  transposase IS4 family protein  25.25 
 
 
384 aa  68.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1486  hypothetical protein  26.42 
 
 
417 aa  63.2  0.000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0068  transposase, IS4 family protein  28.41 
 
 
397 aa  59.7  0.00000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.974421  normal  0.334707 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5389  transposase IS4 family protein  23.24 
 
 
387 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1598  hypothetical protein  27.27 
 
 
417 aa  58.5  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5516  transposase IS4 family protein  23.24 
 
 
387 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.378571 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4105  transposase IS4 family protein  33.55 
 
 
384 aa  56.6  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2547  hypothetical protein  26.2 
 
 
417 aa  56.6  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0495707  normal  0.214927 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4089  transposase IS4 family protein  25 
 
 
401 aa  53.9  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.034496  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4911  IS4 family transposase  24.12 
 
 
275 aa  53.9  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0145672  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1094  transposase IS4 family protein  24.67 
 
 
401 aa  53.1  0.000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0885817  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3939  transposase IS4 family protein  24.67 
 
 
401 aa  53.1  0.000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2690  hypothetical protein  26.64 
 
 
649 aa  52  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4509  hypothetical protein  26.2 
 
 
417 aa  51.2  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.326946 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4456  hypothetical protein  25.81 
 
 
417 aa  50.8  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.185829 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1851  hypothetical protein  23.13 
 
 
361 aa  50.4  0.00006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0038  hypothetical protein  23.13 
 
 
361 aa  50.1  0.00007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2461  transposase IS4 family protein  24.5 
 
 
414 aa  49.3  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.250425  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2872  transposase IS4 family protein  24.5 
 
 
414 aa  49.3  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2890  transposase IS4 family protein  24.5 
 
 
414 aa  49.3  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0289371  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3071  transposase IS4 family protein  24.5 
 
 
414 aa  49.3  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.52529  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3220  transposase IS4 family protein  24.5 
 
 
414 aa  49.3  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.390647  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3427  transposase IS4 family protein  24.5 
 
 
414 aa  49.3  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000920727  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3532  transposase IS4 family protein  24.5 
 
 
414 aa  49.3  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000268669  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3610  transposase IS4 family protein  24.5 
 
 
414 aa  49.3  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3831  transposase IS4 family protein  24.5 
 
 
414 aa  49.3  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000386672  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0716  hypothetical protein  23.13 
 
 
361 aa  48.9  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4720  transposase IS4 family protein  24.5 
 
 
414 aa  49.3  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.370488  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1813  hypothetical protein  23.13 
 
 
361 aa  48.9  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0881  hypothetical protein  23.13 
 
 
361 aa  48.9  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1934  transposase IS4 family protein  24.5 
 
 
414 aa  49.3  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000387173  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1209  transposase IS4 family protein  24.5 
 
 
414 aa  49.3  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0722892  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0848  transposase IS4 family protein  24.5 
 
 
414 aa  49.3  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.253852  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2895  hypothetical protein  23.13 
 
 
361 aa  48.9  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1945  hypothetical protein  23.13 
 
 
361 aa  48.9  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1754  hypothetical protein  25.4 
 
 
417 aa  48.1  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.467768 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1807  transposase, IS4  27.05 
 
 
333 aa  47.8  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.911781  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1702  transposase, IS4  27.05 
 
 
363 aa  47.8  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0308  transposase, IS4  27.05 
 
 
363 aa  47.8  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.365924 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0464  transposase, IS4  27.05 
 
 
363 aa  47.8  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0293358  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0925  transposase, IS4  27.05 
 
 
363 aa  47.8  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.310658  normal  0.553314 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2823  transposase, IS4  27.05 
 
 
363 aa  47.8  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2659  transposase, IS4  27.05 
 
 
363 aa  47.8  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2108  transposase, IS4  27.05 
 
 
363 aa  47.8  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.958109 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2205  transposase, IS4  27.05 
 
 
363 aa  47.8  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2430  transposase, IS4  27.05 
 
 
363 aa  47.8  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0869  transposase IS4 family protein  24.5 
 
 
418 aa  47.4  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3793  transposase IS4 family protein  26.76 
 
 
397 aa  45.8  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3303  transposase IS4 family protein  26.39 
 
 
397 aa  46.2  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2015  transposase IS4 family protein  26.76 
 
 
397 aa  45.8  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1976  transposase IS4 family protein  26.39 
 
 
397 aa  46.2  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00982369  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0978  hypothetical protein  25 
 
 
417 aa  45.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.764358  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1910  hypothetical protein  28.73 
 
 
248 aa  43.9  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.542489  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05982  hypothetical protein  23.65 
 
 
399 aa  43.1  0.008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08194  transposase  23.65 
 
 
399 aa  43.1  0.008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  0.679296  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01470  hypothetical protein  23.65 
 
 
399 aa  43.1  0.008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01664  hypothetical protein  23.65 
 
 
399 aa  43.1  0.008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02007  hypothetical protein  23.65 
 
 
399 aa  43.1  0.008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02009  hypothetical protein  23.65 
 
 
405 aa  43.1  0.008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02494  hypothetical protein  23.65 
 
 
399 aa  43.1  0.008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02811  hypothetical protein  24.07 
 
 
399 aa  43.1  0.008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05054  hypothetical protein  23.65 
 
 
399 aa  43.1  0.008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06074  hypothetical protein  23.65 
 
 
399 aa  43.1  0.008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3489  transposase, IS4  29.75 
 
 
310 aa  43.1  0.009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>